Genetiği değiştirilmiş ürünlerin çoklu real-time PCR ile belirlenmesi
Development of multiplex real-time PCR assays for screening of genetically modified organisms (GMOs)
- Tez No: 318681
- Danışmanlar: PROF. DR. SALİH KAFKAS
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Genetiği değiştirilmiş organizma (GDO), Real-Time PCR, Multipleks, Genetically modified organisms (GMOs), Real-Time PCR, Multiplex
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çukurova Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 62
Özet
Ticari değeri olan genetiği değiştirilmiş organizmaların (GDO) sayısı vebunları belirlemek için geliştirilen moleküler teknikler sürekli değişmektedir. Bununsonucunda GDO laboratuvarları ve gıda üretim endüstrisi ham materyallerde vekompleks işlenmiş gıda ürünlerinde güvenilir farklı yöntemleri uygulamayazorlanmaktadır. Bu çalışmada GDO analizlerinde çoğunlukla kullanılan 35S(karnabahar mozaik virüs promotörü), NOS (Agrobacterium tumefaciens'in nopalinsentez geni terminatörü), FMV (Sıracaotu mozaik virüsünün 35S promotörü) ve Bar(Streptomyces hygroscopicus toprak bakterisi) genlerini belirlemek için çoklu realtimePCR sistemlerinin geliştirilmesi amaçlanmıştır. Bunlara ek olarak, PCRreaksiyonlarında engelleyici bir maddenin olup olmadığını kontrol edebilmek içindahili pozitif kontrol (IPC) ve bitki DNA'sının olup olmadığını belirlemek için bitkispesifik (18sR) probları kullanılmıştır. Real-time PCR reaksiyonlarında üç adet 35S,üç adet NOS, bir adet FMV ve 1 adet Bar genlerinin TaqManTM problarınınkombinasyonları test edilmiştir. Sonuç olarak, ikili, üçlü ve dörtlü real-time PCRyöntemleri IPC ve 18sR genlerini içerecek şekilde geliştirilmiştir. Tümkombinasyonlar hem Applied Biosystem (ABI 7500) hem de Strategene (Mx3005P)firmalarının Real-time PCR cihazlarında yapılmıştır. Geliştirilen yöntemlerin GDOlaboratuvarlarında tarama için ucuz ve uygun olduğu bulunmuştur.
Özet (Çeviri)
The number of commerically available genetically modified organisms(GMOs) and molecular detection techniques have been constantly changing. As aresult, GMO laboratories and the food production industry currently are forced toapply many different methods to reliably test raw material and complex processedfood products. In this study, it was aimed to develop multiplex real-time PCRsystems to detect 35S (the promoter of the cauliflower mosaic virüs), NOS (theterminator of the nopaline synthase gene of Agrobacterium tumefaciens), FMV (the35S promoter from the figwort mosaic virüs), and Bar (from the soilbacteriumStreptomyces hygroscopicus) genes as the most widely used in GMO analysis.Additionally an internal positive control (IPC) indicating the presence or absence ofPCR inhibiting substances, and plant gene specific primer (18sR) for the detection ofplant gene was used in the PCR reactions. Combinations of three 35S, three NOS,one FMV and one Bar TaqManTM probes were tested in Real-time PCR reactions. Asa result, duplex, triplex and quadruflex real-time PCR assays were developedincluding IPC and 18sR genes. All the combinations were performed in both AppliedBiosystem (ABI 7500) and Stratagene (Mx3005P) Real-Time PCR systems. Thedeveloped methods were found to be inexpensive and suitable for fast screening inGMO labs.
Benzer Tezler
- P35S, TNOS and PFMV targeted multiplex PCR using a single dye
Tek boya kullanarak P35S, TNOS ve PFMV hedefli çoklu PZR
DENİZ GÜLBİN TAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2013
Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesiİleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY
DR. MUSTAFA KOLUKIRIK
- Development of an oligonucleotide based sandwich array platform for the detection of transgenic elements from plant sources using label-free PCR products
İşaretlenmemiş PZR ürünlerini kullanarak bitkilerden transgenik elementlerin tespiti için oligonukleotit tabanlı sandviç dizi platformunun geliştirilmesi
FATMA GÜL
Yüksek Lisans
İngilizce
2010
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Bölümü
DOÇ. DR. FÜSUN İNCİ EYİDOĞAN
PROF. DR. HÜSEYİN AVNİ ÖKTEM
- GDO tayini için mikroakışkan biyosensör tasarlanması
Design of microfluidic biosensor for GMO detection
ÖZLEM ULUĞBEY
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Mekatronik MühendisliğiMarmara ÜniversitesiMekatronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ HÜSEYİN YÜCE
DR. ÖĞR. ÜYESİ OYA AKÇA
- Kars yöresine ait ata buğdayı Kavılca ve modern ekmeklik buğdaydan hazırlanan un ve ekmeğin fonksiyonel özelliklerinin ve sağlık etkilerinin incelenmesi
Investigation of the functional properties and health effects of flour and bread prepared from Kavılca wheat grown in Kars and modern bread wheat
ELİF FEYZA AYDAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Gıda Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BERAAT ÖZÇELİK
- Development and application of techniques on molecular analysis of genetically modified products
Genetiği değiştirilmiş ürünlerin analizinde moleküler tekniklerin geliştirilmesi ve uygulanması
ATAKAN ERTUĞRUL
Yüksek Lisans
İngilizce
2007
BiyomühendislikSabancı ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SELİM ÇETİNER