Vitreoscilla hemoglobin eksprasyonu yapan rekombinant Erwinia herbicola'da ikincil metabolit akış dağılımı
Secondary metabolite flux distribution in Erwinia herbicola expressing Vitreoscilla hemoglobin
- Tez No: 318763
- Danışmanlar: DOÇ. DR. BURHAN ATEŞ, PROF. DR. HİKMET GEÇKİL
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Genetik, Mikrobiyoloji, Biology, Genetics, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İnönü Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 159
Özet
Bu çalışmada, Erwinia herbicola ve onun Vitreoscilla hemoglobin geni (vgb) klonlanmış suşu (vgb+) ile vgb içermeyen (vgb-) rekombinant suşları kullanılmıştır. Vitreoscilla hemoglobinin (VHb) E. herbicola'da indol-3-asetik asit, ß-karoten, likopen, C vitamini, fenazin, meropenem, ATP ve NAD üretimi üzerindeki etkisi araştırılmıştır. E. herbicola'da bu şekilde endojen rekombinant bir oksijen alım sisteminin bu metabolitlerin üretimi üzerindeki etkisi ilk defa çalışılmıştır.Diğer iki suşla karşılaştırıldığında, vgb+ rekombinant suşunun düşük konsantrasyonda L-triptofan eklenen zengin kültür ortamının ileri kültür fazı ile yüksek glukozlu M9 ortamında önemli derecede yüksek indol-3-asetik asit seviyesine sahip olduğu belirlendi. Yine bu suşun diğer suşlara göre zengin besiyerinde daha yüksek ß-karoten ve likopen seviyesine sahip olduğu gözlendi. VHb'nin C vitamini üretimini hem glukozlu M9 ortamı ve hem de zengin besiyerinde pozitif yönde etkilediği saptanırken, fenazin üretiminin fruktoz ortamında ve meropenem üretiminin ise sükroz ortamında VHb varlığından pozitif yönde etkilendiğ belirlendi. Ayrıca, rekombinant suşların konakçıdan önemli derecede yüksek oksijen alımına sahip oldukları belirlendi. Zengin besiyerinde vgb+ suşunun hem ATP hem de NAD düzeyleri konakçı ve vgb- rekombinantından daha yüksek bulundu.
Özet (Çeviri)
In this study Erwinia herbicola and its recombinants, one carrying the Vitreoscilla hemoglobin gene (vgb+) and the other missing it (vgb-), were used in a comparative fashion with respect to production of selected secondary metabolites. In this regard, this study is the first for investigation of the effect of such an endogenous recombinant oxygen-uptake system on microbial production of secondary metabolites as indol-3-asetik asit, ß-caroten, lycopene, vitamin C, phenazine, meropenem whose production are tightly regulated by oxygen. Further, the energetic state of bacteria were evaluated through the level of ATP and NAD.Compared to other two strains, the level of indol-3-asetik asit in the low L-tryptophan rich medium late phase vgb+ cultures was considerably high. Similarly, the level of this hormone in high glucose minimal medium cultures of vgb+ was higher than the host and vgb- strains. The rich medium cultures of vgb+ recombinant strain had also considerably higher levels of ß-carotene and lycopene. The vgb+ strain was also determined to have a higher level of vitamin C both in rich and glucose supplemented minimal media cultures. The presence of vgb was also determined to positively regulate the production of two antibiotics, phenazine and meropenem, under different carbon supply. The highest phenazine and meropenem levels were achieved with fructose and sucrose, respectively. Also, the recombinants had considerably higher oxygen uptake rates than the host strain. The levels of both ATP and NAD in rich cultures of vgb+ recombinant were higher than the host and vgb- recombinant.
Benzer Tezler
- Vitreoscilla Hemoglobini ,(VHb) ile patates işleme atık suyundan biyoetanol üretiminin arttırılması
Enhancement by Vitreoscilla Hemoglobin (VHb) of bioethanol production from potato processsing waste water
KÜBRA ABANOZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
BiyolojiGebze Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MELTEM YEŞİLÇİMEN AKBAŞ
- Vitreoscilla hemoglobin geni klonlanmış bakterilerde L-asparajinaz enziminin sentezi: Önemli bir kanser kemoterapi ajanı
The synthesis of L-asparaginase in bacteria carrying Vitreoscilla hemoglobin gene: An enzyme used in cancer therapy
SALİH GENCER
- Bakteriyel hemoglobin geni klonlanmış Pseudomonas sp.'lerinin çeşitli zararlı aromatik madde yıkım potansiyellerinin araştırılması
The potential use of Pseudomonas sp. engineered with the bacterial hemoglobin gene for the degradation of various harmful aromatic compounds
HÜSEYİN KAHRAMAN
- L-asparaginaz geninin (ansB) farklı gram negatif bakterilere klonlanması, izolasyonu ve ekspresyonu
Cloning, isolation and expression of L-asparaginase gene (ansB) in different gram-negative bacteria
ŞEBNEM ÖZALP ERENLER
- Farklı gıda işleme atıklarından biyoetanol üretiminde Vitreoscilla hemoglobininin kullanım potansiyelinin araştırılması
Potential use of Vitreoscilla hemoglobin for bioethanol production from different food wastes
TANER ŞAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
BiyolojiGebze Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MELTEM YEŞİLÇİMEN AKBAŞ