Geri Dön

Identification of salt stress responsive proteins in wild sugar beet (Beta maritima) using 2D-PAGE with MALDI-TOF/TOF system

2D-PAGE ile MALDI-TOF/TOF sistemi kullanılarak yabani şeker pancarında (Beta maritima) tuz stresine duyarlı proteinlerin belirlenmesi

PDF İndir

  1. Tez No: 320711
  2. Yazar: ÇİĞDEM ÇAKIROĞLU
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. HÜSEYİN ÇAĞLAR KARAKAYA
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Tıbbi Biyoloji, Genetics, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2012
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 68

Özet

Yüksek tuzluluk bitkilerde homeostaziyi, büyümeyi ve üretkenliği etkileyen abiyotik streslerden biridir. Bitkilerde esansiyel olmayan tuz iyonlarının alımı, hücrelerin osmotik dengesini değiştirerek ve aşırı susuzluğa neden olarak, bitkilerin anatomisini, fizyolojisini ve metabolizmasını olumsuz yönde etkiler. Bu durumda yüksek bitkiler ilgili sinyal yolaklarını uyarmak, tuz iyonlarını dışarı atmak, bu toksik iyonları vakuollerinde biriktirmek, detoksifikasyon mekanizmalarını aktive etmek ya da osmoprotektan üretmek gibi tuz tolerans mekanizmaları geliştirirler.Bu çalışmada kısmi halofit yabani tür şeker pancarı Beta vulgaris ssp. maritima'da tuza duyarlı proteinlerin belirlenmesi amaçlanmıştır. Protein esaslı doğal stres tolerans mekanizmalarını keşfetmek için bitkiler 150 mM NaCl'e maruz bırakılmış ve total proteinleri elde edilmiştir. Farklı olarak ifadelenen proteinler MALDI-TOF/TOF ile kombine edilmiş iki boyutlu poliakrilamid jel elektroforezini kapsayan proteomik uygulamalarıyla belirlenmiştir. Sonuçlar ortaya çıkarıyor ki enzimatik antioksidanlar ve antioksidatif yolakların ikincil üyeleri tuz stresine duyarlılık göstermektedir. Sonuç olarak, tespit edilen proteinler gösteriyor ki halofitik bitkilerde antioksidatif sistem majör savunma mekanizması olabilir.

Özet (Çeviri)

High salinity is one of the abiotic stresses, which affects the homeostasis, growth and productivity of plants. In plants, uptake of the non-essential salt ions negatively affects the anatomy, physiology and metabolism, changes the osmotic balance in cells and causes abundant dehydration. In this case, higher plants develop salt tolerance mechanisms such as induction of related signaling pathways, effluxion of salt ions, accumulation of these toxic ions in their vacuoles, activation of their detoxification mechanisms and production of osmoprotectans.In this study, identification of salt responsive proteins in moderately halophyte wild type sugar beet Beta vulgaris ssp. maritima was aimed. In order to investigate the protein-based natural stress tolerating mechanisms, plants were exposed to 150 mM NaCl and total proteins were extracted. Differentially expressed proteins were identified by proteomic approaches including MALDI-TOF/TOF mass spectrometry combined two dimensional polyacrylamide gel electrophoresis. The results revealed that enzymatic antioxidants and secondary members of antioxidative pathways are responsive in salt stress. In conclusion, these detected proteins demonstrate that antioxidative system may be the major defense mechanism in halophytic plants.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    232908

    Salt stress responsive proteins identification in wild sugar beet (Beta maritima) by mass spectrometry

    Yabani şeker pancarında (Beta maritima) tuza duyarlı proteinlerin kütle spektrometre kullanılarak tanımlanması

    EMİNE PINAR BAYDARA

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2008

    Kimyaİzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Kimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. TALAT YALÇIN

    YRD. DOÇ. DR. H. ÇAĞLAR KARAKAYA

  2. Tez No

    371413

    Kuraklık stresi altında karnitin teşvikli proteinlerin tanımlanması

    Identification of carnitine induced proteins under drought stress

    BURCU ÇEBİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    BotanikEge Üniversitesi

    Biyoloji Bölümü

    DOÇ. DR. HEDİYE SEKMEN ESEN

  3. Tez No

    238912

    Aegilops tauschii'de tuz stresine dayanikliliği sağlayacak yeni genlerin cDNA AFLP yöntemi ile belirlenmesi

    Identification of novel genes expressed under salt stress by cDNA AFLP in Aegilops tauschii

    AYŞEN YUMURTACI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    BiyolojiMarmara Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AHU ALTINKUT UNCUOĞLU

    PROF. DR. MERAL ÜNAL

  4. Tez No

    309357

    Identification and functional analysis of an autophagy-related gene, TdAtg8, in wild emmer wheat under biotic (Fusarium culmorum) and abiotic (Drought) stress conditions

    Otofaji ile bağdaştırılan TdAtg8 geninin biotik (Fusarium culmorum) ve abiotik (Kuraklık) koşullar altında yabani buğdayda tanımlanması ve fonksiyonel analizi

    DUYGU KUZUOĞLU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2010

    BiyolojiSabancı Üniversitesi

    Biyoloji Bilimleri ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HİKMET BUDAK

  5. Tez No

    770930

    Fasulye (Phaseolus vulgaris L.) bitkisinde trihelix gen ailesi üyelerinin genom düzeyinde tanımlanması ve çeşitli abiyotik stresler sırasında ifade profilleri

    Genome-wide identification of Trihelix gene family members in common bean (Phaseolus vulgaris L.) and expression profiles during various abiotic stress

    SAMET CAN EKER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyolojiAnkara Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İLKER BÜYÜK

Geri Dön