Geri Dön

Salt stress responsive proteins identification in wild sugar beet (Beta maritima) by mass spectrometry

Yabani şeker pancarında (Beta maritima) tuza duyarlı proteinlerin kütle spektrometre kullanılarak tanımlanması

PDF İndir

  1. Tez No: 232908
  2. Yazar: EMİNE PINAR BAYDARA
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. TALAT YALÇIN, YRD. DOÇ. DR. H. ÇAĞLAR KARAKAYA
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Kimya, Chemistry
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2008
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 84

Özet

Verimli tarım alanlarının tuzlanması, tüm dünyada giderek büyük bir sorun haline gelmektedir. Dünya üzerindeki arazilerinin yüzde yedisi ve sulama yapılan toprakların yüzde beşi tuzluluktan etkilenmektedir. Türkiye şeker pancarı üretiminde dünyada dördüncü avrupadada üçüncü sırada yer almaktadır. Şeker pancarının çimlenme ve fide dönemlerinde tuz stresinden olumsuz etkilendiği, üretimde önemli derecede verim kayıpları meydana getirdiği ve bitkinin kalitesini etkilediği gözlemlenmiştir.Bu çalışmada, yabani şeker pancarının tuza dayanıklı türü olan Beta maritima kullanılarak tuz-stresine toleranslı proteinler proteomik yaklaşım kullanılarak incelenmiştir. Yaklaşık iki ayda yetiştirilen şeker pancarı bitkileri yedi gün boyunca 250 mM NaCl maruz bırakılmıştır. Kontrol bitkilerine bu süre içinde tuz uygulanmamıştır. Yapraktaki toplam proteinler izole edilmiştir ve solüsyon içinde parçalama tekniği kullanılarak proteinler peptitlere parçalanmıştır. Sıvı kromatografisi-ikili kütle spektrometresi (LC-MS/MS) kullanılarak proteinler tanımlanmıştır. Toplam 288 protein yaprak örneklerinde, 259 protein de kök örneklerinde tanımlanmıştır.Tanımlanan protein sonuçlarına bakıldığında tuz uygulanan yaprak örnekleri ve fazla tanımlanan yapraktaki proteinler antioksidant enzimlerken, tuz uygulanmış kök örneklerinde vakular ATP sentez subunit A proteini tanımlanmıştır.

Özet (Çeviri)

Salt stress is one of the major abiotic stresses in agriculture worldwide. Seven percent of the land?s surface and five percent of cultivated lands are affected by salinity. Turkey is the fourth in the world and third in Europe in producing sugar beet. It is observed that salt stress affects the sugar beet negatively especially at germination and seedling stages, it limits the productivity of crop plants and affects the quality of plants.In the present study, proteomic approach was used to investigate the salt-stress responsive proteins in wild salt-tolerant beet, Beta maritima. Sugar beet were grown approximately two months. After growing, they were treated with 250 mM NaCl for seven days. Control plants received no salt treatment during this period. Total proteins of leaves and root were extracted. The proteins were fragmented into peptides using in-solution digestion technique and liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) used for identified the proteins. Totally 288 proteins were identified in leave samples and totally 259 proteins were identified in the root samples.Identified protein results were shown that unique of salt leave proteins and up-regulated proteins of leave samples were the related to the antioxidant enzymes. On the other hand, active transporter protein of vacular ATP synthase subunit A was identified in the salt responsive of root samples.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    320711

    Identification of salt stress responsive proteins in wild sugar beet (Beta maritima) using 2D-PAGE with MALDI-TOF/TOF system

    2D-PAGE ile MALDI-TOF/TOF sistemi kullanılarak yabani şeker pancarında (Beta maritima) tuz stresine duyarlı proteinlerin belirlenmesi

    ÇİĞDEM ÇAKIROĞLU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2012

    Genetikİzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. HÜSEYİN ÇAĞLAR KARAKAYA

  2. Tez No

    371413

    Kuraklık stresi altında karnitin teşvikli proteinlerin tanımlanması

    Identification of carnitine induced proteins under drought stress

    BURCU ÇEBİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    BotanikEge Üniversitesi

    Biyoloji Bölümü

    DOÇ. DR. HEDİYE SEKMEN ESEN

  3. Tez No

    309357

    Identification and functional analysis of an autophagy-related gene, TdAtg8, in wild emmer wheat under biotic (Fusarium culmorum) and abiotic (Drought) stress conditions

    Otofaji ile bağdaştırılan TdAtg8 geninin biotik (Fusarium culmorum) ve abiotik (Kuraklık) koşullar altında yabani buğdayda tanımlanması ve fonksiyonel analizi

    DUYGU KUZUOĞLU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2010

    BiyolojiSabancı Üniversitesi

    Biyoloji Bilimleri ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HİKMET BUDAK

  4. Tez No

    238912

    Aegilops tauschii'de tuz stresine dayanikliliği sağlayacak yeni genlerin cDNA AFLP yöntemi ile belirlenmesi

    Identification of novel genes expressed under salt stress by cDNA AFLP in Aegilops tauschii

    AYŞEN YUMURTACI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    BiyolojiMarmara Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AHU ALTINKUT UNCUOĞLU

    PROF. DR. MERAL ÜNAL

  5. Tez No

    770930

    Fasulye (Phaseolus vulgaris L.) bitkisinde trihelix gen ailesi üyelerinin genom düzeyinde tanımlanması ve çeşitli abiyotik stresler sırasında ifade profilleri

    Genome-wide identification of Trihelix gene family members in common bean (Phaseolus vulgaris L.) and expression profiles during various abiotic stress

    SAMET CAN EKER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyolojiAnkara Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İLKER BÜYÜK

Geri Dön