Meme kanseri biyopsi örneklerinde östrojen hormonu alıcı varlığının zeki yöntemlerle tespiti
Using intelligent methods to detect estrogen hormone receptor existance in breast cancer biopsy samples
- Tez No: 320811
- Danışmanlar: PROF. DR. ADEM KALINLI
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyomühendislik, Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol, Patoloji, Bioengineering, Computer Engineering and Computer Science and Control, Pathology
- Anahtar Kelimeler: Görüntü analizi, Görüntü bölütleme, Görüntü işleme yöntemleri, Hücre sınıflandırma, Neoplazm hücreleri, Örüntü sınıflama, Image analysis, Image segmentation, Image processing methods, Cell classification, Neoplastic cells, Pattern classification
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Erciyes Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Östrojen alıcı durumunun değerlendirilmesi, meme kanserinin tanısında başvurulan ve doktor tarafında öznel olarak gerçekleştirilen bir işlemdir. Östrojen alıcı durum değerlendirmesinde yeniden üretilebilir ve nesnel sonuçlar almak için, bu tez çalışmasında çeşitli yapay öğrenme yöntemleri ve farklı öznitelik kümelerinin sınıflama ve tıbbî tanı başarımları incelenmiştir.Yarıçap fonksiyonlu ağlar, k-en yakın komşuluk metodu, destek vektör makineleri, sade bayes sınıflayıcı, fonksiyonel karar ağaçları ve k-orta nokta algoritması test veri kümesi üzerinde deneysel olarak incelenmiştir. Çeşitli öznitelik kümeleri üzerinde her bir metodun sınıflama başarımı araştırılmıştır. Bu metotlarla test resimleri üzerinde elde edilen tanı karaları uzman patologların kararları ile karşılaştırılmıştır.Elde edilen deneysel sonuçlara göre, östrojen alıcı tanısında fonksiyonel karar ağaçları ve sade bayes sınıflayıcısının birleşimden oluşan tümleşik model en iyi tanı puanlamasını ve östrojen alıcı negatif/pozitif ayırımını gerçekleştirmiştir. Bu iki yöntem diğer metotlara göre daha iyi genelleme yapabilme özelliğini ortaya koymuştur. Elde edilen sonuçlara göre, dalgacık desen öznitelikleri Laws desen özniteliklerinden ve eş oluşum matrisi özniteliklerinden daha üstün sınıflama kabiliyeti göstermektedir.
Özet (Çeviri)
In medical practice for prognosis of breast cancer, estrogen receptor status evaluations have been done subjectively. To get objective and reproducible analysis of estrogen receptor, this thesis examined classification and prognostic scoring performances of several computer methods on different feature sets.Radial basis function network, k-nearest neighborhood search, support vector machines, naive bayes classifier, functional trees and k-means clustering algorithm were experimented on the test datasets. Several features were employed and classification accuracies of each method on these features were examined. Assessment results of the methods on test images were also experimentally compared with that of two pathologist experts.According to results our experimental work, combination of functional trees and naive bayes classifier gave the best prognostic scores and dichotomization results for assessment of estrogen receptor status. These two methods showed better generalization behavior than the other methods. Wavelet color features provided better classification accuracy than Laws texture energy and co-occurrence matrix features.
Benzer Tezler
- Büyüme hormonu gen anlatımı arttırılmış meme kanseri hücrelerinde curcuminin apoptotik hücre ölümü üzerine etkisinde inflamasyonun rolü
The investigation of the role of inflammation in the curcumin induced apoptotic cell death in autocrine growth hormone induced breast cancer cell
BUSE ÖZAKALTUN
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
İstanbul Kültür ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
Yükleniyor...
- Meme kanserinde core needle biyopsi ve cerrahi rezeksiyon arasındaki HER2 low durumunun ilişkisi
Relationship of HER2-low status between core needle biopsy and surgical resection in breast cancer
HATİCE KURT
- Meme kanseri ve aksiller metastazı bulunan hastalarda, memedeki kitlenin immunohistokimyasal özellikleri ile aksilladaki metastatik lenfadenopatinin immunohistokimyasal özelliklerinin kalın iğne biyopsi bulguları ile karşılaştırılması
Comparison of immunohistochemical properties of the breast mass and axillary metastatic lymphadenopathy with trucut biopsy findings in patients with breast cancer and axillary metastasis
MUHAMMED ŞAMİL AYDIN
- İnvaziv meme kanserlerinde tru-cut biyopsi ve mastektomi materyallerine rutin uygulanan histomorfolojik ve immünohistokimyasal analiz sonuçlarının karşılaştırması
Comparison of histomorphological and immunohistochemical analysis results routinely applied to tru-cut biopsy and mastectomy materials in invasive breast cancer
HİLAL ÇALIŞKAN ERGÜN
- Erken evre ve lokal ileri evre meme kansererinde Bcl-2 C erbB-2 EGFR MMP-9 düzeyleri ile prognostik faktörler arasındaki ilişki
The correlation among Bcl-2 C erbB-2 EGFR MMP-9 levels and prognostic factors in the early and locally advanced stage breast cancer
TURGUT KÖSE