Geri Dön

Domates genotiplerinde genetik benzerliğin SSR (basit dizi tekrarı) marköriyle tespiti

Determination of genetic diversity on genotypes of tomatoes by SSR (simple sequence repeats) marker

PDF İndir

  1. Tez No: 321539
  2. Yazar: ŞENAY DAĞIDIR
  3. Danışmanlar: PROF. DR. AHMET OKUMUŞ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Genetik, Biology, Biotechnology, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2012
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 133

Özet

Bu araştırma, domates (Solanum lycopersicum) popülasyonlarında genetik çeşitliliği belirlemek amacıyla farklı bölgelerden elde edilen 21 yerli ve 3 ticari genotipin 40 SSR lokusu kullanılarak genetik düzeyde allel profilleri, genetik tanımlamaları ve aralarındaki genetik benzerlikleri araştırılmıştır. Lokuslarda gözlenen allel sayısı 13 (LEat018) ilâ 3 arasında (SSR50, SSR80, SSR9, LEtat002) değişmiştir. Beklenen ve gözlenen heterozigotluk oranı ortalaması sırasıyla He: 0,753 ve Ho:0,714 olarak bulunmuştur. Lokuslara ait ortalama Polimorfizm Bilgi İçeriği (PIC) değeri, 0,694 olarak bulunmuştur. Allellerin lokuslarda ki dağılımlarına bakıldığında; en yüksek allel frekansının % 62,5 ile SSR75 lokusunda, en düşük allel frekanslarının ise % 16,6 ile AI491065 ve LEta024 lokuslarında görüldüğü tespit edilmiştir. Kümeleme analizi için UPGMA (Unweighted Pair-Group Method Using Arithmetic Means) yöntemi uygulanmıştır. Dendogramda 2 ana grup ortaya çıkarak, genotiplerin büyük kısmını içeren ikinci (2) grup içinde çok sayıda alt grup gözlenmiştir. 40 SSR lokusuna göre analiz edilen 24 domates genotipinden Bafra-Merkez ve Sivas-Yukarıkale Köyü genotiplerinin genetik benzerlik değeri 0,776 olarak bulunmuştur. En düşük benzerlik 0,136 değeri ile Sivas-Yıldızeli-Emirler Köyü ve Samsun- Çarşamba genotipleri arasında bulunmuştur.

Özet (Çeviri)

In this research, allele profiles, genetic identification and genetic similarity between 21 local 3 commercial genotypes collected from different regions were investigated to establishe the genetic variability in tomatoes (Solanum lycopersicum) populations at genetic level by using 40 SSR loci. Number of alleles per locus ranged from 13 (LEat018) to 3 (SSR50, SSR80, SSR9, LEtat002). Expected and observed heterozygosity values were between He: 0,753 and Ho: 0,714 respectively. The mean Polymorphism Information Content (PIC) value of these loci was found as 0,694. Considering distribution of alleles per loci, the highest allele frequency was observed from SSR75 with % 62,5 while the lowest was in AI491065 and LEta024 with % 16,6 locus. UPGMA (Unweighted Pair-Group Method Using Arithmetic Means) method was conducted for cluster analysis. The dendrogram was consisted 2 main groups, and group 2 was the largest and it contained many sub-groups. Twenty-four tomato genotypes were analyzed by 40 SSR loci and genetic similarity level of genotypes from Bafra-Merkez and Sivas-Yukarıkale Köyü was found as 0,776. The lowest similarity ratio was observed between Sivas-Yıldızeli-Emirler Köyü ve Samsun- Çarşamba genotype with 0,136 value.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    150702

    Önemli zeytin (Olea europaea L.) çeşitlerinin izoenzim polimorfizmleri ve genetik özellikleri

    Isoenzyme polymorphisms and genetic characteristics of important olive (Olea europaea L.) cultivars and types

    SEVDA DÜLGER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    ZiraatÇanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi

    Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MURAT ŞEKER

  2. Tez No

    406142

    Domates genotiplerinde farklı besi ortamlarında kallus gelişimi ve genetik farklılığın RAPD markörleri ile belirlenmesi

    Identification of callus development in different nutrient medias and genetic diversity in tomato genotypes with RAPD markers

    ZAFER SEÇGİN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyoteknolojiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AHMET OKUMUŞ

  3. Tez No

    745531

    Cold tolerance related mi RNA expression patterns in cultivated and wild tomato genotypes

    Bazı yabani ve kültür domates genotiplerinde soğuk toleransı ile ilgili miRNA ifade analizleri

    HOUTAN VAFAEIFARD

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    ZiraatRecep Tayyip Erdoğan Üniversitesi

    Tohumluk Bilimi ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HÜLYA İLBİ

    DOÇ. DR. AYLİN KABAŞ

  4. Tez No

    297552

    Bazı yerel domates genotiplerinde farklı yöntemler kullanarak, domates lekeli solgunluk virüsü (Tomato spotted wilt virus, TSWV)'ne dayanıklılığın ve genetik varyasyonun araştırılması

    The study of the genetical variations and the resistance to TSWV (Tomato spotted wilt virus) of some of the local tomato genotypes by using different methods

    ASU OĞUZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    ZiraatAnkara Üniversitesi

    Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. Ş. ŞEBNEM ELLİALTIOĞLU

  5. Tez No

    457896

    SSR markörleriyle yerel domates genotiplerinin akrabalık ilişkilerinin belirlenmesi

    Determination of genetic relationships of local tomato genotypes using SSR markers

    SIMON PETER SSENDAWULA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    BiyoteknolojiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MUSA KAVAS

Geri Dön