Bortezomib bileşiğinin DNA topoizomeraz enzimleri ile biyomoleküler etkileşimlerinin tanımlanması
Identification of biomolecular interactions between bortezomib compound and DNA topoisomerase enzymes
- Tez No: 327172
- Danışmanlar: PROF. DR. ZEKİ TOPÇU
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Eczacılık ve Farmakoloji, Biology, Biotechnology, Pharmacy and Pharmacology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 76
Özet
DNA topoizomerazlar, DNA yapısında konformasyonel değişiklikleri düzenleyerek önemli hücresel faaliyetlerin gerçekleşmesini sağlayan enzimlerdir ve çok sayıda anti-kanser ilacın hücre içi hedefi olarak karakterize edilmişlerdir. Topoizomeraz hedefleyen bileşiklerin biyolojik önemleri hakkında güvenilir sonuçların alınabilmesi için DNA-enzim kompleksi ile etkileşimleri ile ilgili kapsamlı analizlere ihtiyaç duyulmaktadır. Bu çalışmada bazı kanser türlerinin tedavisinde etkili olan Bortezomib bileşiğinin topoizomeraz enzimleri ile etkileşimleri araştırılmıştır. Hipotezimize temel olan yaklaşım rapor edilen hücre kültürü çalışmalarında Bortezomib ile gözlenen etkilerin hücre proliferasyonunda önemli rolleri ile tanınan DNA topoizomeraz enzimleri aracılığı ile gerçekleşiyor olabileceğidir. Bileşiğin topoizomeraz enzimleri ile etkileşimi insan tip I ve tip II topoizomeraz enzimleri kullanılarak sırasıyla süpersarmal relaksasyon ve dekatenasyon reaksiyonları ile incelenmiştir. Çalışmamızda topoizomerazların Bortezomib varlığında substrat-ürün dönüşümü profilleri bileşiğin DNA kırıkları oluşturma potansiyelinin incelenmesi ile zenginleştirilmiştir. Testlerimizin son aşaması ise S. cerevisiae hücreleri ile yapılan hassasiyet ve spot testlerini kapsamış, elde edilen sonuçlar etkilerini topoizomeraz reaksiyonlarını hedefleyerek gösterdikleri bilinen yapılarla karşılaştırılmıştır.
Özet (Çeviri)
DNA topoisomerases regulate conformational changes in DNA topology during cellular processes and have been characterized as the cellular targets of a number of anti-cancer drugs. Reliable results about the biological importance of topoisomerase targeting drugs require comprehensive analyses of the interactions between DNA-enzyme complexes and topoisomerase targeting drugs. In this study, interactions between topoisomerase and Bortezomib, a clinically significant compound with reported anti-proliferative efects in some types of cancer cells was investigated. The rationale of our approach is based on the results obtained with Bortezomib could be mediated via topoisomerase reactions as these enzymes have important roles in cell proliferation. The interaction of the compound with human type I and type II topoisomerases were investigated using supercoil relaxation and mini-circle decatenation reactions, respectively. Both reaction types have been intensively employed in literature. The substrate to product conversion profiles of the enzymes in the presence of Bortezomib were enriched with the investigation of the potential of the compound to generate strand breaks. Finally, our study was extended to cover yeast sensitivity and spot tests, the results were compared to the compounds known to exert their effects through topoisomerase enzymes.
Benzer Tezler
- Bortezomib' in etoposid ve kamptotesin ile birlikte ökaryotik dna topoizomeraz enzimleri üzerine in vitro inhibisyon etkilerinin araştırılması
The investigation of in vitro inhibition effects of bortezomib in combined with etoposide and camptotheci̇n on eukaryotic dna topoisomerase enzymes
ÇİYDEM TIRINOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
BiyokimyaAksaray ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. EMİNE ÖKSÜZOĞLU
- Potansiyel proteazom inhibitörü bir grup karbosiklik ve heterosiklik bileşiğin sentez ve biyoaktivite çalışmaları
Synthesis and bioactivity studies of some carbocyclic and heterocyclic compounds as potential proteasome inhibitors
ŞİRİN UYSAL
Doktora
Türkçe
2017
Eczacılık ve FarmakolojiEge ÜniversitesiFarmasötik Kimya Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ZEYNEP SOYER
- Bor içeren ftalosiyaninlerin floresans kuantum verimleri ve singlet oksijen kuantum verimlerine solvent etkisinin incelenmesi
Investigation of fluorescence quantum yields and solvent effect of boron containing phthalocyanines on singlet oxygen quantum yields
FATMA NUR YABAŞ
- Ovariektomize sıçanların uterusu üzerinde proteazom önleyici bortezomib (Velcade)'nin koruyucu etkileri: Histolojik ve immünohistokimyasal çalışma
The protective effect of proteasome inhibitorof bortezomib (Velcade) on the uterus of ovariectomize mice: Histological and immunohistological study
BÜŞRANUR KARAKAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
Histoloji ve EmbriyolojiGaziantep ÜniversitesiTemel Tıp Bilimleri Bölümü
PROF. DR. SERAP SERGÜL İNALÖZ DEMİR
YRD. DOÇ. DR. İSMAİL CAN
- Bortezomib ve carfilzomib'in glioblastoma hücrelerine anti-tümör etkisi ve tümör mikro çevresindeki sağlıklı beyin hücrelerinde stres cevabı ve iskelet hasar tayini
Anti-tumor effect of Bortezomib and Carfilzomib on Glioblastoma cells and stress response and skeletal damage in healthy brain cells around the tumor microenvironment
SEMA ESERYEL
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
BiyokimyaMarmara ÜniversitesiBiyokimya (Tıp) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BETÜL YILMAZ