Bortezomib bileşiğinin DNA topoizomeraz enzimleri ile biyomoleküler etkileşimlerinin tanımlanması
Identification of biomolecular interactions between bortezomib compound and DNA topoisomerase enzymes
- Tez No: 327172
- Danışmanlar: PROF. DR. ZEKİ TOPÇU
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Eczacılık ve Farmakoloji, Biology, Biotechnology, Pharmacy and Pharmacology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 76
Özet
DNA topoizomerazlar, DNA yapısında konformasyonel değişiklikleri düzenleyerek önemli hücresel faaliyetlerin gerçekleşmesini sağlayan enzimlerdir ve çok sayıda anti-kanser ilacın hücre içi hedefi olarak karakterize edilmişlerdir. Topoizomeraz hedefleyen bileşiklerin biyolojik önemleri hakkında güvenilir sonuçların alınabilmesi için DNA-enzim kompleksi ile etkileşimleri ile ilgili kapsamlı analizlere ihtiyaç duyulmaktadır. Bu çalışmada bazı kanser türlerinin tedavisinde etkili olan Bortezomib bileşiğinin topoizomeraz enzimleri ile etkileşimleri araştırılmıştır. Hipotezimize temel olan yaklaşım rapor edilen hücre kültürü çalışmalarında Bortezomib ile gözlenen etkilerin hücre proliferasyonunda önemli rolleri ile tanınan DNA topoizomeraz enzimleri aracılığı ile gerçekleşiyor olabileceğidir. Bileşiğin topoizomeraz enzimleri ile etkileşimi insan tip I ve tip II topoizomeraz enzimleri kullanılarak sırasıyla süpersarmal relaksasyon ve dekatenasyon reaksiyonları ile incelenmiştir. Çalışmamızda topoizomerazların Bortezomib varlığında substrat-ürün dönüşümü profilleri bileşiğin DNA kırıkları oluşturma potansiyelinin incelenmesi ile zenginleştirilmiştir. Testlerimizin son aşaması ise S. cerevisiae hücreleri ile yapılan hassasiyet ve spot testlerini kapsamış, elde edilen sonuçlar etkilerini topoizomeraz reaksiyonlarını hedefleyerek gösterdikleri bilinen yapılarla karşılaştırılmıştır.
Özet (Çeviri)
DNA topoisomerases regulate conformational changes in DNA topology during cellular processes and have been characterized as the cellular targets of a number of anti-cancer drugs. Reliable results about the biological importance of topoisomerase targeting drugs require comprehensive analyses of the interactions between DNA-enzyme complexes and topoisomerase targeting drugs. In this study, interactions between topoisomerase and Bortezomib, a clinically significant compound with reported anti-proliferative efects in some types of cancer cells was investigated. The rationale of our approach is based on the results obtained with Bortezomib could be mediated via topoisomerase reactions as these enzymes have important roles in cell proliferation. The interaction of the compound with human type I and type II topoisomerases were investigated using supercoil relaxation and mini-circle decatenation reactions, respectively. Both reaction types have been intensively employed in literature. The substrate to product conversion profiles of the enzymes in the presence of Bortezomib were enriched with the investigation of the potential of the compound to generate strand breaks. Finally, our study was extended to cover yeast sensitivity and spot tests, the results were compared to the compounds known to exert their effects through topoisomerase enzymes.
Benzer Tezler
- Bortezomib' in etoposid ve kamptotesin ile birlikte ökaryotik dna topoizomeraz enzimleri üzerine in vitro inhibisyon etkilerinin araştırılması
The investigation of in vitro inhibition effects of bortezomib in combined with etoposide and camptotheci̇n on eukaryotic dna topoisomerase enzymes
ÇİYDEM TIRINOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
BiyokimyaAksaray ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. EMİNE ÖKSÜZOĞLU
- Potansiyel proteazom inhibitörü bir grup karbosiklik ve heterosiklik bileşiğin sentez ve biyoaktivite çalışmaları
Synthesis and bioactivity studies of some carbocyclic and heterocyclic compounds as potential proteasome inhibitors
ŞİRİN UYSAL
Doktora
Türkçe
2017
Eczacılık ve FarmakolojiEge ÜniversitesiFarmasötik Kimya Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ZEYNEP SOYER
- Bor içeren ftalosiyaninlerin floresans kuantum verimleri ve singlet oksijen kuantum verimlerine solvent etkisinin incelenmesi
Investigation of fluorescence quantum yields and solvent effect of boron containing phthalocyanines on singlet oxygen quantum yields
FATMA NUR YABAŞ
- Bortezomib ve lenalidomid tedavilerini alan multipl miyelom olgularının retrospektif incelenmesi
Retrospective analysis of multiple myeloma patients whom recieved botezomib and lenalidomide treatments
ÇİĞDEM AKSU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2015
HematolojiUludağ Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. VİLDAN ÖZKOCAMAN
- Bortezomib ile ellajik asit, ferulik asit ve kafeik asit kombinasyonlarının Caco-2, A549 ve 3T3 hücrelerinde sinerjistik sitotoksik etkilerinin araştırılması
Investigation of synergistic cytotoxic effects of bortezomib and ellagic acid, ferulic acid, caffeic acid combinations on Caco-2, A549 and 3T3 cells
MERVE DİLBER
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
Eczacılık ve FarmakolojiAnadolu ÜniversitesiFarmakoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MİRİŞ DİKMEN