Geri Dön

Gıda kaynaklı Enterococcus faecalis ve Enterococcus faecium suşlarında virülans faktörlerin belirlenmesi

Determination of virülence factors in food originated Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium strains

  1. Tez No: 328226
  2. Yazar: FATMA NESLİHAN YÜKSEL
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MUSTAFA AKÇELİK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Mikrobiyoloji, Biotechnology, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2012
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ankara Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 128

Özet

Enterokoklar insan ve hayvanların bağırsak florasında ve ayrıca gıdalarda bulunan Gram pozitif bakterilerdir. Gıdalarda probiyotik ve starter kültürler olarak kullanılmaktadır. Çalışmamızda, Türkiye' deki peynirlerden izole edilen 48 Enterococcus cinsi üyesinde virülans faktörler ve antibiyotik direnç determinantlarının sıklıkları araştırılmıştır. E. faecium ve E. faecalis suşlarında 11 antibiyotik için duyarlılık testleri, disk difüzyon ve mikrodilüsyon yöntemleri kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Suşlardaki direnç yüzdeleri; ampisilin için % 16.6, streptomisin için % 97.91, nalidiksik asit için % 100, kanamisin için % 100, gentamisin için % 14.58, kloramfenikol için % 22.91, tetrasiklin için % 25, rifampisin için % 79.16, vankomisin için % 79,16, eritromisin için % 97.91, siprofloksasin için % 62.5 olarak belirlenmiştir. Antibiyotik direncinden sorumlu genler belirlemek amacıyla polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) yöntemi kullanılmıştır. tetM ve vanB genleri için tüm suşlar negatif bulunmuştur. PZR ürünleri dizi analizi ile doğrulanmıştır. PZR yöntemi ile enterokokların virülanslığı ile ilişkili agregasyon faktör (AS) geni, yüzey proteini esp, kollojen bağlayıcı adhezin ace, E. faecalis endokardit antijen efaA, jelatinaz gelE, fsr lokusu, sitolizin genleri (cylM, cylA, cylB) ve seks feromonları (cpd, cob, ccf) araştırılmıştır. Virülans determinantların E. faecalis suşlarında E. faecium suşlarına oranla daha fazla oldukları saptanmıştır. Antibiyotik direnç genlerinin konjugasyon yolu ile aktarımı araştırılmış ancak bu çalışmalarda konjugant elde edilememiştir.

Özet (Çeviri)

Enterococci are Gram-positive bacteria which present in the gut of humans and animals and can also be food products. They are used as starter and probiotic cultures in foods. In this study, we investigated the incidence of virulence factors and antibiotic resistance determinants of 48 Enterococcus isolates originated from cheese in Turkey. Susceptibility testing for 11 antibiotics were analyzed with disc diffusion and microdilution methods in E. faecalis and E. faecium strains. Resistance levels of strains was determined as for ampicillin (% 16.6), streptomycin (% 97.91), nalidixic acid (% 100), kanamycin (% 100), gentamicin (% 14.58), chloramphenicol (% 22.91), tetracycline (% 25), rifampicin (% 79.16), vancomycin (% 79.16), erythromycin (% 97.91), ciprofloxacin (% 62.5). To identify genes responsible from antibiotic resistance, polymerase chain reaction (PCR) method was used. All strains were found negative in respect of tetL and vanB genes. Sizes of amplicons were verified by sequence analysis. The presence of the aggregation substance (AS) gene, the surface protein gene esp, the accessory colonisation factor ace, the E. faecalis endocarditis antigen efaA and the gelatinase gelE gene, fsr locus, cytolysin genes (cylM, cylA, cylB), sex pheromones (cpd, cob, ccf) which are involved in the virulence of enterococci, were also tested by PCR. Virulence determinants in E. faecalis strains determined greater numbers compared to E. faecium strains. Conjugation mechanisms was investigated for acquire antibiotic resistance genes but any transconjugant was determined.

Benzer Tezler

  1. Doğal fermente gıdalar ve anne sütünden enterokokların izolasyonu, karakterizasyonu ve bunların probiyotik kültür olarak kullanılabilme potansiyelinin araştırılması

    Isolation and characterization of enterococci from naturally fermented foods and human milk and investigation of their usage potential as probiotic culture

    SİNE ÖZMEN TOĞAY

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    Gıda MühendisliğiHacettepe Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYHAN TEMİZ

  2. Su ürünü kaynaklı enterokok izolatlarının antimikrobiyel aktivite potansiyelinin belirlenmesi

    Determination of antimicrobial activity potential of enterococci isolates from seafood

    GÖZDE SOYSAL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Gıda MühendisliğiBursa Uludağ Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SİNE ÖZMEN TOĞAY

  3. Klinik ve gıda kaynaklı enterokoklar tarafından üretilen bakteriyosinin bazı patojen bakteriler üzerine antimikrobiyel aktivitelerinin karşılaştırılması

    Comparison of antimicrobial activitiy against some pathogenic bacteria of bacteriocins produced by clinical and food borne enterococci

    HATİCE ULUDAĞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Gıda MühendisliğiÇukurova Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZERRİN ERGİNKAYA

  4. Hayvansal kaynaklı gıdalarda enterokokların varlığı, tür düzeyinde identifikasyonları ve antibiyotik dirençliliklerinin belirlenmesi

    Presence of enterococci in animal originated foods, species level identification and determination of antibiotic resistance

    TÜLAY ELAL MUŞ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    MikrobiyolojiUludağ Üniversitesi

    Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FİGEN ÇETİNKAYA

  5. Faklı kaynaklardan Enterococcus faecalis ve Enterococcus faecium izolasyonu, moleküller tanısı ve genotiplendirilmesi

    The isolation of Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium from different sources and their molecular diagnosis and genotyping

    KEREM DİKEN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    BiyolojiDumlupınar Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. TUBA İÇA