Karaciğer spesifik TİP60 nakavt farelerde karbonik anhidraz enzimlerinin (I, III ve VII) ekspresyon analizi
TIP60 liver specific knockout mice carbonic anhydrase enzymes (I, III and VII) of the analysis of expression
- Tez No: 335117
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. HARUN BUDAK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Biyoloji, Genetik, Biochemistry, Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Karbonik anhidraz, Tip60, Çinko bağlanma proteini, Ekspresyon, Hidrataz aktivitesi, Sirkadian ritim, Carbonic anhydrase, Tip60, Zinc finger E box, Expression, Hydratase activity, Circadian rhythm
- Yıl: 2013
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Atatürk Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 103
Özet
Karbondioksit, yaşayan tüm canlılar için önemli bir metabolittir. Karbonik anhidrazlar (CAs) ise bu önemli metabolitin bikarbonata dönüşmesini katalizleyen ve biyolojik olarak birçok fonksiyonu olan önemli bir enzim ailesidir. Çinko bağlanma proteini (Zinc finger E box), TIP60 (histon asetil transferaz) ile ilşkili reseptör bir proteindir. Tip60 geninin çinko sağlayıcı bölgesinin bulunması, karbonik anhidraz enzimininde aktif bölgesinde çinko iyonu içermesinden dolayı bu iki gen arasında bir ilişki olabileceği fikri doğurmuştur. Fakat bu güne kadar bu konu hakkında yayınlanmış bir bilgi bulunmamaktadır. Bu tez kapsamında, karaciğere spesifik Tip60 kontrollü nakavt farelerden ve kontrol grubu farelerden farklı zaman birimlerinde toplanan karaciğer dokularında Ca I, III ve VII genlerinin ekspresyon seviyeleri Real-Time PCR ile kantitatif olarak analiz edildi Tip60 geni silinen karaciğer dokularında Ca I ve Ca III genlerinin ekspresyon seviyesi her bir zaman biriminde önemli ölçüde azalırken, Ca VII geninin ekspresyonunda bir değişiklik görülmedi. Nakavt ve kontrol grubu için CA III enziminin hidrataz aktivitesi ölçüldü. Ayrıca her üç genin gün içerisinde göstermiş olduğu sirkadian ritimde incelendi.
Özet (Çeviri)
Carbondioxide is a major metabolite for all living organisms. Carbonic anhydrases (CAs) are a significant enzyme family that catalyse the conversion of CO2 to bicarbonate and has many biological functions. Zinc finger E box is a receptor protein which is related to TIP60 (histone acetyltransferase). This has given rise to the idea may be a relationship between Tip60 (histone acetyltransferase) and carbonic anhydrases due to having zinc supplying domain in Tip60 gene, and the active site of most carbonic anhydrases contains a zinc ion. However, so far there is no published studies about this subject. In this thesis, the expression levels of Ca I, III and VII genes were analyzed by Real-Time PCR in liver tissues which were collected from the liver-specific Tip60 conditional knockout and control group mice in different times points of day. While the expression levels of Ca I and Ca III genes in Tip60 deleted liver significantly decreased in every different time points, it was observed that there is no differences for the gene expression level of Ca VII gene. Hydratase activity was measured to determine CA III enzyme activity for both knockout and control groups. Additionally, circadian rhythms of these three genes were analysed during the days.
Benzer Tezler
- Karaciger spesifik TİP60 nakavt farelerde hepsidin (HAMP) gen ekspresyonunun araştırılması
Investigation of hepcidin (HAMP) gene expression on liver specific TIP60 conditional knockout mice
MESUT AKYÜZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
BiyokimyaAtatürk ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. HARUN BUDAK
- Tip60 geninin oksidatif stres üzerine etkisinin karaciğer spesifik tip60 nakavt farelerde araştırılması
Investigation of the effect of tip60 gene on oxidative stress in liver spesific tip60 knockout mice
ENVER FEHİM KOÇPINAR
- TİP60 geninin fare karaciğer dokusundaki inflamasyon yolağı üzerine etkisinin gen ve protein seviyesinde araştırılması
Investigation of the impact of TIP60 gene on inflammation pathway in mouse liver at gene and protein level
ŞEYDA NUR ÇAKIR
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
GenetikAtatürk ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HARUN BUDAK
- Tip60 geninin demir metabolizmasının düzenlenmesindeki rolünün fare karaciğer dokusunda araştırılması
Investigation of the role of Tip60 gene in the regulation of iron metabolism in mouse liver
NURDAN GÖNÜL
Doktora
Türkçe
2018
BiyokimyaAtatürk ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HARUN BUDAK
- A study of polymorphic variants of repairing genes in breast cancer and comparison of patient diets in Iraqi population
Meme kanserinde onarıcı genlerin polimorfik varyantları ve Irak nüfusunda hasta beslenmelerinin karşılaştırılması üzerine bir çalışma
HUDA SALİH MEZAAL MEZAAL
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
BiyolojiAltınbaş ÜniversitesiBiyomedikal Bilimler ve Mühendislik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ÖZGE SEÇMELER