Eskişehir-Kırka bor maden yatakları ve çevresinden bor toleransı yüksek bakterilerin izolasyonu, moleküler karakterizasyonu ve bor toleransı ile ilgili genlerin araştırılması
Isolation and characterization of highly boron tolerant bacteria from Eskisehir-Kirka boron mine and surrounding regions and investigation of genes realated to boron tolerance
- Tez No: 337897
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. BEKİR ÇÖL
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2013
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Muğla Sıtkı Koçman Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 216
Özet
Bor, yeryüzünde topraktan okyanuslara kadar çeşitli alanlarda bulunan, doğa ve canlılar ile etkileşimi açısından önemli etkilere sahip bir eser elementtir. Borun bitkiler ve bazı mikroorganizmalar için esansiyel olduğu bildirilmiştir fakat hücrede yer aldığı biyokimyasal süreçler kapsamlı olarak henüz ortaya konmamıştır. Bor-canlı ilişkisinin aydınlatılabilmesi için Bor?a tolerans gösteren veya gereksinim duyan, aynı zamanda çalışma kolaylığı sağlayan model organizmalara ihtiyaç vardır. Bu açıdan bakteriler, Bor?un biyolojik işlevinin açıklığa kavuşturulmasında ideal model organizma adaylarıdır. Bu çalışmada Bor ile ilişkisi olan bakteri türlerinin izolasyonu amaçlanmış ve gerçekleştirilmiştir. Eskişehir iline bağlı Kırka Bor madeninden ve çevresinden toprak, su ve maden örnekleri toplanmıştır. İzolasyon sonucunda 130 adet izolat elde edilmiştir. Elde edilen izolatların Bor?a tolerans seviyeleri tespit edilmiştir. 400, 300, 200 ve 150 mM borik asit konsantrasyonlarına karşı toleransa sahip olan ve bu ortamlarda rahatlıkla üreyebilen onlarca bakteri izolatı bulunmuştur. Bazı seçilen izolatların fenotipik ve biyokimyasal özellikleri belirlenmiş ve 16SrDNA geni sekans analizleri yapılmıştır. Elde edilen sonuçlar değerlendirildiğinde, 8 adet farklı cinste temsil edilen türler tespit edilmiştir. Bunlar; Zhihengliuella, Pseudomonas, Bacillus, Arthrobacter, Micrococcus, Kocuria, Staphylococcus ve Erwinia cinsleridir. 200 mM ve üstünde tolerans seviyesine sahip olan izolatlardan 10 tanesinin SDS-PAGE protein profilleri belirlenmiştir. Bor (borik asit) konsantrasyonundaki artışa bağlı olarak yüksek bor toleransına sahip bazı izolatların büyüme eğrileri çıkarılmıştır. 400 mM borik asit konsantrasyonuna tolerans gösteren bir izolatın (EK983Y) genomik kütüphanesi oluşturulmuştur. Seleksiyon çalışmaları sonucunda, bakteri dünyası için ilk kez, Bor?a tolerans gösterilmesini sağlayan yedi adet Bor (tolerans) gen adayı önerilmiştir. Sonuç olarak bu çalışmada; mikrobiyolojik, biyokimyasal ve moleküler yaklaşımların da kullanılmasıyla, Bor-bakteri ilişkisini anlayabilmek için kullanılabilecek model organizmalar elde edilmiş ve protein aktiviteleri sunulmuştur.
Özet (Çeviri)
Boron is a trace element possessing noteworthy effects in terms of its interaction with nature and the living organisms and is found in various areas in the earth from the soil to the oceans. It is reported that Boron is essential for the plants and some microorganisms, but the biochemical processes it is involved in the cell has not yet been clearly and extensively revealed. In order to shed light on the relationship between Boron and life, the model organisms that tolerate or require boron and that at the same time are easy to handle need to be discovered. In that regard, the bacteria are the ideal candidate of model organisms to clarify the biological function of Boron. In this study, isolation of the bacterial species that have relation with Boron was aimed and achieved. Soil and water samples were collected from and around the Kırka boron mine in Eskişehir. As a result of isolation, one hundred and thirty (130) bacteria isolates were obtained. The levels of Boron tolerance of the isolates were determined. A number of boron tolerant bacteria that can easily grow in the presence of 400, 300, 200 and 150 mM boric acid were found. Phenotypic and biochemical properties of some of the selected isolates were determined and 16SrRNA gene sequence analysis was performed. When the results were analyzed, the species belonging to 8 different genuses were identified. These are Zhihengliuella, Pseudomonas, Bacillus, Arthrobacter, Micrococcus, Kocuria, Staphylococcus and Erwinia. SDS-PAGE profiles of ten of the isolates having 200 mM and higher levels of tolerance were obtained. Growth curves of some of the isolates as a function of increasing boron (boric) acid concentrations were determined Genomic library of one isolate (EK983Y) that tolerate up to 400 mM boric acid concentration was constructed. After selection studies, seven candidate genes conferring Boron tolerance to the bacteria were proposed for the first time. In conclusion, this study presents the model organisms that can be used to elucidate Boron-bacteria relationship using microbiological, biochemical and molecular approaches as well as some protein activities.
Benzer Tezler
- Kırka (Eskişehir) bor yatakları çevresindeki biyojeokimyasal anomalilerin araştırılması
An investigation of the biogeochemical anomalies around the Kırka (Eskişehir) borate mine
SEMİHA ZORLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2006
Jeoloji MühendisliğiÇukurova ÜniversitesiJeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MUSTAFA AKYILDIZ
YRD. DOÇ. DR. ZEYNEP ÖZDEMİR
- Kırka tinkal cevheri ve konsantresinin zenginleştirilme olanaklarının araştırılması
Başlık çevirisi yok
ENDER SÖNMEZ
- Preparation of cross-linked poly (styrene) based resin amidated by staudinger reaction, modification with iminopropylene glycole and removal of the boron from aqueous solutions
Staudinger reaksiyonu ile aminlenmiş çapraz bağlı poli (stiren) esaslı reçinenin hazırlanması iminopropilen glikol ile modifikasyonu ve borun sulu çözeltilerden giderilmesinde kullanılması
ALEYNA BUĞÇE MASACI
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
Polimer Bilim ve Teknolojisiİstanbul Teknik ÜniversitesiPolimer Bilim ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BAHİRE FİLİZ ŞENKAL
- Enerji ve ekserji analizi ile etimaden Kırka bor işletme müdürlüğü bünyesindeki bir fabrikanın enerji verimliliğinin incelenmesi
Investigation of energy efficiency of a plant of etimaden Kırka bor enterprise by energy and exergy analysis
SALİH AYAĞIBÜYÜK
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Makine MühendisliğiEskişehir Osmangazi ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. LATİFE BERRİN ERBAY
- Beneficiation of tincal ore by decripitation method
Tinkal cevherinin dekripitasyon yoluyla zenginleştirilmesi
HAKAN KAMİL ARMAN
Yüksek Lisans
İngilizce
1995
Maden Mühendisliği ve MadencilikDokuz Eylül ÜniversitesiPROF.DR. MEVLÜT KEMAL