Sığırlarda geniş spektrumlu beta-laktamaz sentezleyen Escherichia coli prevalansının belirlenmesi
Determination of the prevalence of extended spectrum beta-lactamase producing escherichia coli in cattle
- Tez No: 340736
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ÖZKAN ASLANTAŞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Veteriner Hekimliği, Microbiology, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: Geni?lemi? spektrumlu beta-laktamaz, Escherichia coli, sığır, Extended spectrum beta-lactamase, Escherichia coli, cattle
- Yıl: 2013
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Mustafa Kemal Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Sağlık Bilimleri Bölümü
- Bilim Dalı: Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 55
Özet
Sığırlarda Geni?lemi? Spektrumlu Beta-laktamaz Sentezleyen Escherichia coli Prevalansının Belirlenmesi Bu çalı?mada, Hatay?da yetiştirilen sığırlarda geniş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) sentezleyen Escherichia coli prevalansının belirlenmesi amaçlandı. Rektal svab örneklerinden 2 mg/L sefotaksim içeren Eosine Methylene Blue (EMB) agara ekimleri yapıldı. Pozitif izolatlar fenotipik doğrulama testleri ile konfirme edildi ve GSBL tipi polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ve sekans analizi ile araştırıldı. GSBL pozitif izolatların antimikrobiyal duyarlılıkları disk difüzyon testi ile filogenetik dağılımları ise PZR ile belirlendi. GSBL sentezleyen E. coli rektal svab örneklerinin %8.3?ünden (26/312) izole edildi. İzolatlarda en yaygın GSBL genleri sırasıyla blaTEM-1b (n=21), blaCTX-M-15 (n=12), blaCTX-M-1 (n=1), blaCTX-M-3 (n=2) ve blaOXA (n=1) olarak tespit edildi. Fakat izolatlarda blaSHV geni tespit edilmedi. GSBL pozitif izolatların tamamı sefotetan ve imipeneme duyarlı bulunurken; ampisilin (%100), seftriakson (%100), sefalotin (%96.2), sefaperozon (%88.5), streptomisin (%80.8), sulfametoksazol/trimetoprim (%76.9), tetrasiklin (%73.1), kloramfenikol ve kanamisin (%50), nalidiksik asit ve amoksisilin/klavulanik asit (%46.2), aztreonam (%38.5), siprofloksasin (%34.6), gentamisin (%11.5) ve sefoksitine (%3.8) değişen oranlarda direnç saptandı. Filogenetik analizler GSBL pozitif izolatların B1 (n=1, %50), A (n=9, %34.6) ve D1 (n=1, %3.8) olmak üzere 3 grupta yer aldığını gösterdi. Bu çalışma ile Türkiye?de ilk kez sığırlarda CTX-M-15, CTX-M-11, CTX-M-3 ve OXA-1 üreten fekal E. coli taşıyıcılığı tespit edilmiştir. Ayrıca, mevcut çalışmanın sonuçları Hatay ilinde yetiştirilen gerek süt ve gerekse de besi sığırlarının GSBL sentezleyen E. coli yönünden potansiyel rezervuar olduğunu göstermektedir. Bu nedenle, GSBL sentezleyen bakteriler dahil antimikrobiyal dirençli bakteriler hayvanlarda sürekli olarak izlenmeli ve GSBL pozitif bakterilerin klonal yayılımının önlenmesi için antibiyotikler bilinçli olarak kullanılmalıdır.
Özet (Çeviri)
Determination of the Prevalence of Extended Spectrum Beta-lactamase Producing Escherichia coli in Cattle In this study, it was aimed to determine the prevalence of extended-spectrum beta-lactamase (ESBLs) producing Escherichia coli in cattle in Hatay. Rectal swab samples were spread on the Eosin Methylen Blue (EMB) agar containing cefotaxime (2 mg/L). Isolates were confirmed using ESBL confirmatory tests. ESBL types were investigated by polymerase chain reaction (PCR) and sequencing. Antimicrobial susceptibility of the isolates was determined by disk diffussion method and distribution of phylogenetic groups was also determined by PCR. ESBL producing E. coli was isolated from 8.3% (26/312) of rectal swab samples. The most common ESBL gene was blaTEM-1b (n=21), followed by blaCTX-M-15 (n=12), blaCTX-M-1 (n=1), blaCTX-M-3 (n=2), and blaOXA (n=1). Howevwe, blaSHV gene was not detected. All ESBL positive isolates were found to be sensitive to cefotetan and imipenem, while variable rates of resistance were determined against other antimicrobials including ampicillin (100%), ceftriaxone (100%), cefalothin (96.2%), cefaperozone (88.5%), streptomycin (80.8%), trimethoprim-sulfamethoxazole (76.9%), tetracycline (73.1%), chloramphenicol and kanamycin (50%), nalidixic acid, amoxicillin/clavulanic acid (46.2%), aztreonam (38.5%), ciprofloxacin (34.6%), gentamycin (11.5%) ve cefoxitin (3.8%). Phylogenetic analysis revealed three groups being B1 (n=13, 50%), A (n=9, 34.6%), and D1 (n=4, 15.4%). For the first time, faecal carriage of CTX-M-15, CTX-M-11, CTX-M-3 and OXA-1 producing E. coli was detected in cattle in Turkey. In addition, results of the present study showed that both dairy cattle and beef cattle are potential reservoir of ESBL producing E. coli in Hatay. Therefore, continuous monitoring for antimicrobial resistant bacteria including ESBL producing bacteria in animals and prudent use of antimicrobials is necessary to prevent their clonal spread.
Benzer Tezler
- Farklı lösemi tiplerinde nükleer manyetik rezonans tabanlı metabolomik profilleme
Nuclear magnetic resonance based metabolomic profiling in different types of leukemia
AYŞE ZEHRA GÜL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
BiyokimyaBezm-i Alem Vakıf ÜniversitesiTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞAHABETTİN SELEK
- Retikülo peritonitis traumatikali sığırların teşhis ve prognozunda kan proteinleri ve glutaraldehit testinin önemi
Başlık çevirisi yok
MAHMUT OK
Doktora
Türkçe
1991
Veteriner HekimliğiSelçuk Üniversitesiİç Hastalıkları (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. VEYSİ ASLAN
- Osteoporoz risk faktörleri arasında çinkonun yeri
The role of zinc in the risk factors of osteoporosis
GÜLSÜN ÖZTÜRK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2009
Kadın Hastalıkları ve DoğumGazi ÜniversitesiKadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı
PROF. M ZEKİ TANER
- Posakonazol'un mikroemülsiyonlarının hazırlanması ve optimizasyonu
Preparation and optimization of microemulsions of posaconazole
SOUSAN SANAEIOSKOUEI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
Eczacılık ve Farmakolojiİstanbul ÜniversitesiFarmasötik Teknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHMET OĞUL ARAMAN
- Deneysel kandida albikans endoftalmili tavşan gözlerinde intravitreal ve oral moksifloksasin uygulamasının göz içi sıvılara geçişinin ve antifungal etkisinin değerlendirilmesi
Evaluation of antifungal activity and intraocular fluid penetration of intravitreally and orally administered moxifloxacin in eyes with endophthalmitis due to candida albicans in an experimental rabbit model
SEDAT ARIKAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2008
Göz HastalıklarıGazi ÜniversitesiGöz Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ŞENGÜL ÖZDEK