Geri Dön

Stem-loop RT-polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) yöntemi ile mikro RNA (miRNA) gen anlatım farklılıklarının tespiti

Micro RNA (miRNA) gene expression discrepancy determination with stem-loop RT polymerase chain reaction (PCR) method

PDF İndir

  1. Tez No: 342083
  2. Yazar: NURHAN MAVİ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. UĞUR ÖZBEK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Genetik Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 97

Özet

MikroRNA lar (miRNA), 19-23 nükleotid uzunluğunda küçük, tek iplikli ve fonksiyonel protein kodlamayan RNA?lardır. miRNA lar gelişim, hücre farklılaşması, apoptoz ve proliferasyon gibi önemli biyolojik süreçlerde görev yaparlar. Gelişim esnasında ve gen anlatımında büyük roller üstlendiklerinin bilinmesine rağmen normal ve neoplastik hücrelerdeki anlatım düzeyleri ve fonksiyonları hakkında sınırlı sayıda bilgi mevcuttur. Ayrıca miRNA, hem tümör baskılayıcı genleri (TS) hem de onkogenleri regüle etmektedirler, bu fonksiyonları bakımından oncomiR veya TS miRNA olarak adlandırılırlar. miRNA lar hematopoetik hastalıklarda rol oynamaktadır. miRNA gen anlatımlarının farklı kanser türlerinde belirlenmesi, kanser tanı ve tedavisinde de kullanılabilecek önemli bir araç olarak görülmektedir. Çalışmamızda ALL hastalarının (n=42) kemik iliği örnekleri ve ALL açısından sağlıklı bireyin (n=3) periferik kanlarından elde edilen CD19+ örneklerin daha önce yapılan çalışmalar sonucu lösemi hastalarında gen anlatımının aşırı derecede artmış olduğu belirlenen Beta-katenin (CTNNB1) genini hedef alan miR-214 mikroRNA'sı, Stem Loop Ters Transkriptaz Polimeraz Zincir Reaksiyonu (Stem-Loop RT-PZR) ile incelenmiştir. Yayınlarda miR-214'ün CTNNB1'i direkt olarak hedeflediği bildirildiğinden CTNNB1 seviyesi artarken miR-214 seviyesinin azalması beklenirdi fakat çalışmamız sonucu hasta grubumuzda her iki mRNA düzeyinin, miR-214 (p=0,6989) ve CTNNB1(p=0,5027), yüksek olduğu belirlendi. Bu nedenle, diğer hastalıklardan farklı olarak B-ALL hastalarında miR-214'ün CTNNB1'i dolaylı yoldan etkilediği düşüncesine varılmıştır. Ayrıca farklı klinik özellikler ile miR-214 anlatımı arasındaki ilişkiler araştırılmıştır. Bunun yanında çalışmada işlevselliği ve yüksek hassasiyeti nedeniyle seçilen Stem-Loop RT qPZR yöntemi ilk defa B-ALL patogenezi ve miRNA ilişkisinin araştırılmasında uygulanmış ve bu çalışma ile yöntem bölümümüzde farklı araştırmalarda kullanılmaya başlanmıştır.

Özet (Çeviri)

MicroRNAs (miRNAs) are small (~19/23 nt in length), non-protein coding RNAs and play important roles in biological processes like development, cell differentiation, proliferation and apoptosis. Their role in development and gene expression are well known where as limited evidence is published on their roles in normal and neoplastic cells regulations. miRNAs which are associated with various cancers, are located especially in fragile regions of chromosomes. In addition, miRNAs are regulate the tumor suppressor and oncogenes therefore they called as

Benzer Tezler

  1. Tez No

    759344

    Identification of risk factors and bio-markers for food allergy from ingested microRNAs

    Mideye girmiş mikro-RNA'lardan yemek alerjisi için yeni biyobelirteç ve risk faktörlerin belirlenmesi

    OYA IŞILAY CANİK

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    Allerji ve İmmünolojiSabancı Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ STUART JAMES LUCAS

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SİBEL ÇETİNEL

  2. Tez No

    342758

    Investigation of cis- elements on coding sequence involved in regulation of Stem-Loop Binding Protein (SLBP) in G1

    Stem-Loop Binding Protein'in (SLBP) aminoasit dizisindeki G1 regulasyonundan sorumlu cis-elementlerin araştırılması

    BÜŞRA AYDOĞDU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    GenetikFatih Üniversitesi

    Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MEHMET MURAT KÖSEOĞLU

  3. Tez No

    342766

    Stem loop binding protein expression under serum starvation

    Stem loop bındıng proteininin serum açlığı durumunda ifadesi

    ESRA YALÇIN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    BiyomühendislikFatih Üniversitesi

    Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MEHMET MURAT KÖSEOĞLU

  4. Tez No

    318636

    Investigating the role of Cyclin dependent kinase 2 in triggering late G1 expression of stem loop binding protein as a major mechanism to regulate histone production

    Histon üretiminin regülasyonunda önemli olan stem loop binding protein'in geç G1 fazında Cdk2 tarafından tetiklenmesinin araştırılması

    UMİDAHAN DJAKBAROVA

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2012

    BiyolojiFatih Üniversitesi

    Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MEHMET MURAT KÖSEOĞLU

  5. Tez No

    252263

    Systematic computational analysis of potential rna interference regulation in Toxoplasma gondii

    Toxoplasma gondii'de potansiyel rna interferans regülasyonunun sistematik sayısal analizi

    MEHMET VOLKAN ÇAKIR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2009

    Biyoistatistikİzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. JENS ALLMER

Geri Dön