Evaluations of clinically important snps and polymorphisms of serotonin transporter (SERT) gene
Serotonin taşıyıcı geninde (SERT) klinik öneme sahip genetik değişimlerin değerlendirilmesi
- Tez No: 342775
- Danışmanlar: DOÇ. DR. LOKMAN ALPSOY
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2013
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Fatih Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Depresyon, bipolar bozukluk, şizofreni, obsesif kompulsifi bozukluk anksiyete, dikkat eksikliği ve hiperaktivite bozukluğu, alkol ve madde bağımlılığı, sosyal fobi, Alzheimer, intihar davranışı, yeme bozuklukları, migren, cinsel işlev bozukluğu, irritabl barsak sendromu, hipertansiyon, miyokard infarktüsü, bulantı ve kusma gibi birçok stres bağlantılı bozukluğun etiyolojisinde rolü olan serotonin nörotransmitterinin düzgün fonksiyonunu yapmasında sadece uygun bir şekilde sentezlenmesi yetmemektedir. Bu nörotransmitterin reseptörleri ve geri alınım mekanizmasından sorumlu SERT proteini ve bu proteinin çalışmasını bozan çeşitli gen polimorfizmleri yukarıda geçen hastalıklarla ilgili olarak araştırılmaktadır. SERT geninde yaklaşık 2645 SNP?den klinik öneme sahip olduğu araştırmalarca ortaya konmuş 5-10 arası SNP ve genetik değişim bulunmaktadır. Çalışmamızda epidemiyolojik çalışmaları hızlandıracak şekilde klinik öneme sahip bu değişimlerin real-time PCR HRM analizi yöntemi ile halihazırda kullanımdaki yöntemlere oranla çok daha hızlı, ucuz ve onlar kadar güvenilir bir şekilde tespit edilmeleri amaçlanmıştır. Çalışmamızda klinik öneme sahip, Türk populasyonu açısından da klinik ve farmakogenetik kullanımları olan SERT gen SNP ve polimorfizmlerden rs25533 ve 5HTT-VNTR, literatürde kullanılan primerler ile HRM analizi için optimize edilmek şekliyle gönüllü DNAları ile çalışılmıştır. Validasyon için DNA dizi analizi ve KASP yöntemleri kullanılmıştır. Çalışmamızın sonucunda, HRM analizinin polimorfizm tespiti için uygun ve avantajlı bir yöntem olduğu validasyon da yapılarak gösterilmiştir.
Özet (Çeviri)
Serotonin neurotransmitter regular synthesis is not sufficient for proper function which plays a role in the etiology of many stress related disorders such as depression, bipolar disorder, schizophrenia, obsessive-compulsive disorder, anxiety disorder, ADHD, alcohol and drug addiction, social phobia, Alzheimer?s disease, suicide behavior, eating disorder, migraine, sexual disfunction, irritable bowel sendrom, hypertension, myocardial infarction, nausea and vomiting. Various gene polymorphisms of SERT protein, receptors of SERT neurotransmitters and reuptake mechanisms are searched with related many diseases mentioned above. SERT gene contains approximately 2645 SNPs. Exclusively 5 to 10 of 2645 SNPs and genetic variations are clinically significant that is exhibited with researches. The aim of this study is to accelerate epidemiological studies of these clinically significant differences with HRM analysis of real-time PCR method which is much faster cheaper and reliable way as they are intended to be identified than the methods currently in used. In this thesis, clinically significant and also in use of clinical and pharmacogenetical rs25533 SNP and 5HTT-VNTR polymorphism in Turkish population from SERT gene were studied with volunteer's DNA. Study was performed with primers used in literature that has been optimized for HRM analysis. DNA sequence analysis and KASP methods were used for validation. As a result of this study, HRM analysis is a method of convenient and advantageous for the detection of polymorphisms in the validation were completed.
Benzer Tezler
- İsmayıl Hakkı Baltacıoğlu'nun kültür ve eğitim kavramı üzerine bir inceleme
An Examination of the concepts of culture and education of Ismayıl Hakkı Baltacıoğlu
ABDULLAH DİKİCİ
Doktora
Türkçe
1986
Eğitim ve ÖğretimUludağ ÜniversitesiEğitim Bilimleri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SUAT ANAR
- Gebelik ve doğum olgularında prolaktin düzeylerinin değerlendirilmesi
The Evaluation of prolactin values during pregnancy labour and in deliveries
TÜLİN AKAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1987
Kadın Hastalıkları ve DoğumGazi ÜniversitesiKadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. MÜLAZIM YILDIRIM
- Yenileme yatırımları
Başlık çevirisi yok
OSMAN NURİ FİLİZ
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
İşletmeGazi ÜniversitesiEndüstri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. OSMAN OKKA
- Bromtimol mavisi, bromkresol moru ve klorfenol kırmızısı indikatörleri katılmış özel besiyerlerinin sütlerde antibiyotik belirtilmesine uygunluğu üzerine araştırmalar
Başlık çevirisi yok
ESENGÜL TUNCER
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
Gıda MühendisliğiEge ÜniversitesiSüt Teknolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HASAN YAYGIN
- Bir pamuk iplikhanesinde fiili çalışma metodlarının incelenmesi ve mevcut işlemlerin standart sürelerinin saptanması
Başlık çevirisi yok
MÜRŞİDE KESEROĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
İşletmeEge ÜniversitesiTekstil Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSTAFA NAZMİ ERCAN