Çoklu dirençli Escherıchıa colı izolatlarında CTX-M, SHV ve TEM tiplerindeki beta-laktamaz direnç genlerinin moleküler yöntemlerle saptanması
Molecular detection of CTX-M, SHV and TEM types of betalactamase resistance genes in multiple resistant Escherichia coli isolates
- Tez No: 346659
- Danışmanlar: DOÇ. DR. EMEL BANU BÜYÜKÜNAL BAL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2013
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 82
Özet
Antibiyotiklerin yoğun ve kontrolsüz kullanımları, bakterilerde antibiyotiklere karşı dirençten sorumlu genlerin yayılma özellikleri ile bir araya geldiğinde bakterilerde antibiyotiklere direnç gibi önemli bir problemin yaygın hale gelmesini sağlamaktadır. Günümüzde çok farklı tipteki ß-laktamazlara direnç gelişiminden sorumlu Geniş Spektrumlu ß-laktamazlar (GSBL)-Extended-Spectrum ß-lactamases, ESBL) özellikle Enterobacteriaceae üyeleri arasında hızla artmaktadır. Önemli bir hastane enfeksiyon etkeni olan E. coli Enterobacteriaceae üyesidir. Bu türde çok sayıda GSBL üreten suş saptanmıştır. Çalışmamızda çeşitli klinik örneklerden izole edilen 109 adet E. coli suşu kullanılmıştır. Çift disk sinerji ve kombine disk testleriyle fenotipik olarak GSBL pozitif olduğu belirlenen bu suşlardaki, üç önemli grubu oluşturan CTX-M, TEM ve SHV tiplerindeki ß-laktamazlara özgü genlerin varlığı Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) ile incelenmiştir. PCR analizleri sonuçları, CTX-M tipindeki ß- laktamaz geninin 101 izolatta (%93), SHV tipindeki genin 79 izolatta (%73) ve TEM tipindeki genin ise 55 izolatta (%50) bulunduğunu göstermiştir. Ayrıca izolatların genetik ilişkisini ortaya koyabilmek amacıyla, 42 izolata Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus (ERIC) bölgeleri kullanılarak ERIC-PCR uygulanmıştır. ERIC-PCR iki farklı primer ile gerçekleştirilmiştir. İzolatlara ait ERIC-PCR profillerinden elde edilen Dice benzerlik katsayısı değerlerinden Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean (UPGMA) dendogramları elde edilmiştir. Çalışma sonuçları izolatların çeşitli klonal gruplara sahip olduğunu göstermiştir. Çalışma sonucunda, iki farklı primer ile elde edilen ana grup sayısının benzer olduğu saptanmıştır. Her iki dendogramda birbirine uygun şekilde yerleşim gösteren izolatlar ile birlikte farklı yerleşimlere sahip izolatlar da tespit edilmiştir. GSBL üreten mikroorganizmalar, aminoglikozidler ve florokinolonlar gibi diğer antibiyotiklere dirençlidirler. Bu nedenle, GSBL üreten mikroorganizmaların doğru tespiti, bu tip organizmalardan kaynaklanan enfeksiyonların tedavisinde ve kontrolünde büyük önem taşımaktadır
Özet (Çeviri)
When extensive and uncontrolled use of antibiotics has been collaborating together with dispersal feature of antibiotic resistance genes, they cause an important problem as an antibiotic resistance in bacteria. Recently, various types of Extended Spectrum of Beta- Lactamases (ESBL) responsible for resistance against ß-lactam antibiotics have been drastically increased among members of Enterobacteriaceae. As an important infectious agent, E. coli is a member of Enterobacteriaceae. Many E. coli strains producing ESBLs have been identified. In the present study, 109 E. coli strains have been isolated from various clinical samples. All strains, which have been determined as phenotypically ESBL positive according to double disk synergy method, were analyzed with PCR for the presence of genes coding the three main types of ß- lactamase (CTX-M, TEM and SHV). The PCR results showed that CTX-M, SHV, and TEM types of ß-lactamase genes were present in 101 (93%), 79 (73%), and 55 isolates (50%), respectively. Moreover, genetic relationship among 42 isolates was investigated by Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus (ERIC) regions of ERIC-PCR analysis. Two different primers were used in ERIC-PCR. Dice similarity coefficients estimated from ERIC-PCR profiles of isolates were used to construct Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean (UPGMA) based dendograms. Results indicated that several clonal groups among isolates were present. Numbers of main groups detected with two different primers were the same. In two dendograms, some isolates have been replaced in accordance, whereas some isolates were positioned far apart. ESBL producing isolates are also resistant to other groups of antibiotics such as aminoglycosides and fluoroquinolones. Therefore, accurate detection of ESBL producing organisms is great importance for treatment and control of infections.
Benzer Tezler
- Üriner sistem enfeksiyon etkeni e. coli suşlarında fosfomisin direnç genleri, ctx-m, shv ve tem genlerinin araştırılması
Investigation of fosfomycin resistance genes, ctx-m, shv, and tem genes in e coli strains as the causative agent of urinary system i̇nfections
İPEK OMAY BEŞER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
MikrobiyolojiAnkara Yıldırım Beyazıt ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NURAL CEVAHİR
- Kars yöresinde insanlarda üriner sistem enfeksiyonlarından izole edilen escherichia coli ve klebsiella pneumoniae suşlarında CTX-m, tem ve SHV tipi genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz aktivitesinin otomatize ve moleküler yöntemlerle araştırılması
Investigation of CTX-M, tem and SHV TYPE extended spectrum beta-lactamase activity by automated and molecular methods in escherichia coli and klebsiella pneumoniae strains isolated from urinary track infections in humans in Kars Region, Turkey
SİBEL DENİZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
MikrobiyolojiKafkas ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FATİH BÜYÜK
- Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae izolatlarında CTX-M tipi geniş spektrumlu ß-laktamaz genlerinin PCR, PCR-RFLP, dizi analizi yöntemleri ile identifikasyonu ve suşlar arasındaki klonal ilişkinin PFGE yöntemi ile belirlenmesi
Identification of CTX-M type Extended Spectrum ?-Lactamase Genes in Escherischia coli and Klebsiella pneumoniae Isolates by PCR, PCR-RFLP, DNA Sequencing methods and determination of clonal relation between these strains by PFGE method
MÜMTAZ GÜRAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
MikrobiyolojiÇukurova ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATİH KÖKSAL
- Sefoksitin Dirençli ya da Az Duyarlı Saptanan Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli ve Proteus mirabilis Suşlarındaki Plazmid Aracılı AmpC Beta Laktamaz Enzim Tiplerinin PCR Yöntemi ve Dizi Analizi ile Araştırılması
Detection of Plasmid-Borne AmpC Beta Lactamase Enzyme Types in Cefoxitin Resistant or Intermediate Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli and Proteus mirabilis Isolates by using Multiplex PCR and Sequencing
HADİYE DEMİRBAKAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2007
MikrobiyolojiAkdeniz ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MERAL DİLARA ÖĞÜNÇ
- Escherichia coli klinik izolatlarında blaTEM, blaSHV ve blaCTX-M Genlerinin polimeraz zincir reaksiyon yöntemiyle belirlenmesi
Determination of blaTEM, blaSHV and blaCTX-M genes by polymerase chain reaction method in Escherichia coli clinical isolates
ERSİN KAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıArtvin Çoruh ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ AYŞEGÜL SARAL