Geri Dön

Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae izolatlarında CTX-M tipi geniş spektrumlu ß-laktamaz genlerinin PCR, PCR-RFLP, dizi analizi yöntemleri ile identifikasyonu ve suşlar arasındaki klonal ilişkinin PFGE yöntemi ile belirlenmesi

Identification of CTX-M type Extended Spectrum ?-Lactamase Genes in Escherischia coli and Klebsiella pneumoniae Isolates by PCR, PCR-RFLP, DNA Sequencing methods and determination of clonal relation between these strains by PFGE method

PDF İndir

  1. Tez No: 281811
  2. Yazar: MÜMTAZ GÜRAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. FATİH KÖKSAL
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Antibiyotikler-laktam, Beta laktamazlar, Elektroforez, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Antibiotics-lactam, Beta lactamases, Electrophoresis, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Polymerase chain reaction
  7. Yıl: 2011
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Çukurova Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

CTX-M tipi GSBL üreten E.coli ve K.pneumoniae suşları tüm dünyada giderek artan prevalans oranları ile gerek toplum kökenli gerekse hastane kökenli enfeksiyonlarda tedavi başarısızlıklarının önemli bir sebebi haline gelmiştir. Alternatif tedavi seçeneklerinin başarısızlıkları ile çoklu ilaç dirençli hale gelen CTX-M tipi GSBL üreten suşların kontrolünde, en önemli alternatif klonal düzeyde etkin sürveyanstır.Ülkemizde CTX-M tipi Geniş Spektrumlu ß-laktamaz enzimi üreten E.coli ve K. pneumoniae türlerinin varlığı sınırlı sayıda çalışma ile gösterilmiştir. Ancak bölgemizde GSBL üreten suşların varlığı bilinmekle beraber CTX-M tipi beta laktamaz üreten suşlar ve görülen subtipler hakkında bilgi mevcut değildir.Bu çalışmada hastanemizin Merkez Laboratuarında, hastane ve toplum kökenli enfeksiyonlara ait klinik materyallerden izole edilen, G.S.B.L. üreten E.coli ve K. pneumoniae suşları arasında, moleküler epidemiyolojik yöntemlerle, CTX-M tipi beta laktamaz üreten suşların prevalansının, enzim tiplerinin ve bu suşlar arasındaki muhtemel klonal ilişkinin belirlenmesi amaçlandı.Çalışma sonunda; PCR yöntemi ile CTX-M tipi enzimleri, G.S.B.L. üreten E. coli izolatları arasında %87,31 (69/79), K. pneumoniae izolatları arasında da %88,88 (24/27) oranında belirlendi. Ayrıca Grup Spesifik PCR, PCR-RFLP ve Dizi Analizi çalışmalarıyla suşlarımızın % 94.6 (88/94)'sının CTX-M-1 grubu/CTX-M-15 alttipi enzim üreten suşlar olduğu, kalan 5 (%5.3) suşun da CTX-M-9 grubu/CTX-M-14 alt tipi enzim üreten suşlar oldukları belirlendi. İzolatlarımız arasındaki muhtemel klonal ilişkinin tespiti amacıyla kullandığımız PFGE yöntemi CTX-M tipi enzim üreten suşlar arasında klonal bir ilişkinin bulunmadığını gösterdi.

Özet (Çeviri)

CTX-M type ESBL producer E.coli and K.pneumoniae strains have become an important cause of treatment failures both in nosocomial and community acquired infections with increasing prevelance ratios all over the world. In control of CTX-M type ESBL producer strains which became multi drug resistant because of failure of alternative treatment options, the most important option is effective surveillance in clonal level.The presence of CTX-M type ESBL producing E.coli and K.pneumoniae species has been shown by limited number of studies in our country. Although the presence of ESBL producing strains is known in our region, there is no data regarding the CTX-M type ESBL producing strains and their subtypes observed.Aim of this study was to investigate the prevelance of CTX-M type ESBL producing strains, types of enzymes and probable clonal relation between these strains isolated from clinical material belonging to both nosocomial and community acquired infections at the central laboratory of our hospital.At the end of the study; CTX-M type enzymes among ESBL producing E.coli isolates have been identified at a ratio of 87,31% (69/79) and 88,88% (24/27) between K.pneumoniae isolates with PCR method. Moreover, group specific PCR, PCR-RFLP and DNA Sequencing assays showed that 94.6% (88/94) of our strains are CTX-M-1 group/CTX-M-15 subtype enzyme producers and the other 5 (5.3%) are CTX-M-9 group/CTX-M-14 subtype enzyme producers. PFGE method which we used to identify clonal relations among our isolates demonstrated that there is no serious clonal dissemination between our strains.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    652378

    Sefoksitin Dirençli ya da Az Duyarlı Saptanan Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli ve Proteus mirabilis Suşlarındaki Plazmid Aracılı AmpC Beta Laktamaz Enzim Tiplerinin PCR Yöntemi ve Dizi Analizi ile Araştırılması

    Detection of Plasmid-Borne AmpC Beta Lactamase Enzyme Types in Cefoxitin Resistant or Intermediate Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli and Proteus mirabilis Isolates by using Multiplex PCR and Sequencing

    HADİYE DEMİRBAKAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    MikrobiyolojiAkdeniz Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MERAL DİLARA ÖĞÜNÇ

  2. Tez No

    352702

    Enterobacteriaceae klinik izolatlarında beta laktamaz aktivitesinin fenotipik ve genotipik yöntemlerle araştırılması

    Investigation of beta lactamase activity in enterobacteriaceae clinic isolates with phenotypic and genotypic methods

    GÜL BAYRAM ABİHA

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    MikrobiyolojiMersin Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NURAN DELİALİOĞLU

  3. Tez No

    224815

    Gram negatif basillerde CTX-M tipi beta-laktamazların genotiplerinin araştırılması

    The investigation of CTX-M type beta-lactamases in gram negative bacills

    AYŞE NUR YURTMAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    MikrobiyolojiEge Üniversitesi

    Farmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    Y.DOÇ.DR. HÜSEYİN TAŞLI

  4. Tez No

    310196

    Genişlemiş spektrumlu beta laktamaz üreten escherichia coli ve klebsiella spp. izolatlarında beta laktamaz direncinin polimeraz zincir reaksiyonu ile araştırılması

    Investigation of beta lactamase resistance in extended spectrum beta lactamase producing escherichia coli and klebsiella spp. isolates with polimerase chain reaction

    AHU KAMBUROĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    MikrobiyolojiKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. CELAL KURTULUŞ BURUK

  5. Tez No

    641133

    Kars yöresinde insanlarda üriner sistem enfeksiyonlarından izole edilen escherichia coli ve klebsiella pneumoniae suşlarında CTX-m, tem ve SHV tipi genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz aktivitesinin otomatize ve moleküler yöntemlerle araştırılması

    Investigation of CTX-M, tem and SHV TYPE extended spectrum beta-lactamase activity by automated and molecular methods in escherichia coli and klebsiella pneumoniae strains isolated from urinary track infections in humans in Kars Region, Turkey

    SİBEL DENİZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    MikrobiyolojiKafkas Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FATİH BÜYÜK

Geri Dön