Stenotrophomonas maltophilia'da farklı sınıflardaki integronların varlığının araştırılması ve antibakteriyel direnç ile ilişkilerinin belirlenmesi
Investigation of the presence of several integron classes in stenotrophomonas maltophilia and determination of their relationship with antibacterial resistance
- Tez No: 351426
- Danışmanlar: PROF. DR. CAFER EROĞLU
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2014
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 92
Özet
S. maltophilia hastanelerde sık izole edilen fırsatçı patojenlerdendir. Hastane enfeksiyon etkeni olarak giderek artan öneme sahip olan non-fermentatif bir basildir. Pek çok farklı mekanizmayı kullanarak geniş spektrumlu antibiyotiklerin çoğuna direnç gösterir. Bu durum klinikte tedavi seçeneklerini kısıtlamaktadır.İntegronlar antibiyotik direnç genlerinin aktarımında rol alan mobil genetik elemanlardandır. Sınıf 1 integronlar başta olmak üzere, farklı Gram negatif bakterilerde antibiyotik direnci ile olan ilişkisi irdelenmiş olmasına rağmen özellikle S. maltophilia için ülkemizdeki veriler oldukça sınırlıdır. Çalışmamızda S. maltophilia'larda antibiyotik direnç genlerinin yakalanmasından ve mobilizasyonundan sorumlu integron ve plazmidlerin tespiti ve antibiyotik direnç profili ile ilişkisi araştırılmıştır. Klinik örneklerden izole edilen 100 S. maltophilia suşunun antibiyotik duyarlılık testleri CLSI önerileri doğrultusunda sıvı mikrodilüsyon yöntemi ile yapıldı. Örneklerin hepsinde uygun primerler kullanılarak sınıf 1, sınıf 2, sınıf 3 integron gen kasetleri ve integron 5'-3' korunmuş gen bölgeleri polimeraz zincir reaksiyonu ile araştırıldı. Amplifiye edilen ürünlerin nükleotit dizi analizleri yapıldığında suşların %12'sinde integron varlığı gösterilmiştir. Bu işlem sonucunda integron sınıf 1 geni, quaternary ammonium compound resistance protein (suqacL) geni, aminoglycoside adenylyltransferase (aadA) geni ve integron-associated recombination bölgesi (attI1) saptandı.Ayrıca S. maltophilia suşlarında plazmid varlığı araştırılmıştır. Suşların %9'unda plazmid saptanmıştır. Saptanan plazmidlerin boyutları 17200, 2340, 1350, 2760, 18600, 20000, 3570-2540, 2510 ve 5000-2540 bp idi. Sonuç olarak S. maltophilia suşlarımızın azımsanmayacak bir kısmında integron (%12) ve plazmid (%9) varlığı hastanemizde ki dirençli suşların yayılımı açısından uyarmalıdır.
Özet (Çeviri)
S. maltophilia are an opportunistc pathogens, which frequently isolated in hospitals. They are non-fermentative rods and the growing importance of cause of hospital-acquired infections. Using many different mechanisms of resistance to many broad spectrum antibiotics. This situation is limiting treatment. Integrons are mobile genetic elements, which participate to transfer antibiotic resistance genes. Mainly examined Class 1 in different gram-negative bacteria, but they are limited especially at S. maltophilia in our country. In our study, we detected integrons and plasmids, which responsible for the capture and mobilization of antibiotic resistance genes and correlated with antibiotic resistance profiles. Antimicrobial susceptibility tests of 100 strains S. maltophilia, that isolated from clinical samples, accordance with there commendations of the CLSI and was determined by the broth microdilution method. In all the samples using the appropriate primers class 1, class 2, class 3 integron gene cassettes and integrons 5'-3 'conserved gene regions were determined by polymerase chain reaction. Nucleotide sequence analysis of the amplified products strains, showed the presence of 12% of integron. When analyzed the nucleotide sequence analysis of the gene cassette, integron class 1 gene, quaternary ammonium compound resistance protein (suqacL) gene, aminoglycoside adenylyltransferase (aadA) gene, integron-associated recombination site (attI1) were determined. In addition, in the S. maltophilia isolates were investigated plasmid. Plasmids were detected in 9% strains. In 9 strains plasmids was detected 2340, 1350, 2760, 18600, 20000, 3570-2540, 2510 ve 5000-2540 bp in size. As a result, in a substantial portion of our S. maltophilia strains the presence of integron (12%) and plasmid (9%) in terms of the spread of resistant strains in our hospital should be warned.
Benzer Tezler
- Kistik fibrozlu hastalardan izole edilen pseudomonas aeruginosa ve Stenotrophomonas maltophilia suşlarının tiplendirilmesi
Başlık çevirisi yok
HASAN NAZİK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2005
Mikrobiyolojiİstanbul ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BETİGÜL ÖNGEN
- Klinik stenotrophomonas maltophilia izolatlarında kolistin heterodirencinin araştırılması
Investigation of colistin heteroresistance in clinicalStenotrophomonas maltophilia isolates
ÜMRAN LİSTE
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
MikrobiyolojiHacettepe ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CUMHUR ÖZKUYUMCU
PROF. DR. BANU SANCAK
- Citrus limon (limon) meyvesinin kabuk, iç zar ve yaprak özütlerinin biyolojik aktivite potansiyelinin belirlenmesi ve Stenotrophomonas maltophilia üzerine etkilerinin araştırılması
Investigation of the effect of Citrus lemon (lemon) endocarp, skin and leaf plant extracts on dna protective activities and Stenotrophomonas maltophilia
AFAN OMAR AMEEN AMEEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
BiyolojiGaziantep ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET ÖZASLAN
- Thymbra spicata L. var. spicata (zahter) bitki özütlerinin DNA koruyucu aktivitelerinin ve Stenotrophomonas maltophilia üzerine etkilerinin araştırılması
Investigation of the effect of Thymbra spicata L. var. spicata plant extracts on DNA protective activities and Stenotrophomonas maltophilia
MAHDI HUSSAIN JOMA
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
BiyolojiGaziantep ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İBRAHİM HALİL KILIÇ
- Endemik Astragalus tokatensis Fischer ve Verbascum myrianthum boiss.' un bazı farmasotik özelliklerinin belirlenmesi
Determination of some of the pharmasotical properties of endemic astragalus tokatensis Fischer and Verbascum myrianthum Boiss.
NAHİDE KÜBRA ZANBAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
BotanikTokat Gaziosmanpaşa ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ BEDRETTİN SELVİ