Geri Dön

Meme kanserinde HOXB13 VE IL17BR genlerinin ve bu genler ile ilişkili miRNA'ların prognostik ve prediktif önemi

Prognostic and predictive significance of HOXB13, IL17BR genes and miRNAs associated with these genes in breast cancer

PDF İndir

  1. Tez No: 360126
  2. Yazar: ELİF DEMİRDÖĞEN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ÜNAL EGELİ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Meme kanseri, HOXB13, IL17BR, mikroRNA, Breast cancer, HOXB13, IL17BR, microRNA
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Uludağ Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 127

Özet

Meme kanseri, dünyada kadınlar arasında en sık görülen kanser türüdür. Son yıllarda meme kanseri oluşumunda rol oynayan genlerin ve mikroRNA (miRNA)'ların işlevlerinin anlaşılmaya başlanması, hem meme kanserinin moleküler patolojisinin anlaşılmasını hem de yeni moleküler hedefe yönelik tedavilerin geliştirilmesini sağlamaktadır. Çalışmada, ER(+) Türk primer meme kanserli 40 hastanın tümör, normal doku ve periferik kan örneklerinde; meme kanseri gelişiminde prognostik ve prediktif açıdan önemli olan HOXB13 ve IL17BR genlerinin ve bu genleri hedef alan miRNA' ların (miR-661, miR-1260, miR-1278 ve miR-1266) ekspresyon analizleri gerçekleştirilmiştir. Elde edilen veriler; Bağımsız İki Örnek t-testi, İşlem Karakteristik Eğrisi, Lojistik Regresyon, Kaplan Maier ve Cox Oransal Risk Regresyon Analizi ile değerlendirilmiştir. Hastaların tümör dokularında normal dokuya göre, HOXB13 ekspresyon seviyesinde 1.31 kat artış, IL17BR ekspresyon seviyesinde ise 0.80 kat azalış belirlenmesine rağmen istatistiki bir anlamlılık saptanmamıştır (p= 0.3559, p= 0.3166). HOXB13:IL17BR ekspresyon oranındaki artışın sağkalım ve tedaviye yanıt ile ilişkisi anlamlı bulunmuştur (p= 0.0491, p= 0.0267). miR-661, miR-1260, miR-1266 ekspresyon seviyeleri, tümör dokuda normal dokuya göre sırasıyla; 1.94, 1.59 ve 1.38 kat artış; miR-1278 ekspresyon seviyesi ise 0.30 kat azalış göstermiştir (p= 0.3578, p= 0.3451, p= 0.6930, p= 0.2428). Rekürens/metastaz (-) hastalar ile rekürens/metastaz(+) hastalar arasında HOXB13'ü hedef alan miR-1278 ve IL17BR'yi hedef alan miR-1266 ekspresyon seviyelerinde istatistiksel olarak anlamlı farklılık gözlenmiştir (p = 0.0014, p= 0.0048). Hastaların periferik kanlarında ise HOXB13 ve IL17BR genlerinin ekspresyonu gözlenmemiştir. Elde edilen bulgular ışığında; ER(+) primer meme tümörlerinde HOXB13 ve IL17BR'yi hedefleyen miRNA düzeylerindeki farklılıklar değerlendirilerek, tümörün agresivitesi ve metastaz riski hakkında bilgi edinilebilecektir. Böylece, farklı etkin tedavi yaklaşımlarının düzenlenmesi ve hastaların yaşam süresi ve kalitesinin geliştirilebilmesine yönelik çalışmalara katkı sağlanabilecektir. Ayrıca mevcut çalışma; ER(+) Türk primer meme kanserli hastalarda, kötü prognozun takibinde ve uygulanan tedavinin etkinliğinde faydalanılabilecek miRNA düzeyindeki biyobelirteçlerin belirlenmesi konusunda yapılacak ileri çalışmalara yol gösterici olan, uluslararası ve ulusal literatüre katkı sağlayabilecek nitelikteki ilk çalışmadır.

Özet (Çeviri)

Breast cancer is the most common type of cancer among women worldwide. In recent years, understanding the functions of genes and miRNAs that play a role in breast cancer development, has been providing expectations for understanding the molecular pathology of breast cancer as well as developing new molecular targeted therapies. In this study, the expression analysis of HOXB13 and IL17BR genes and their target miRNAs (miR-661, miR-1260, miR-1278 ve miR-1266) carried out in tumor, normal tissue and peripheral blood samples of 40 ER(+) Turkish primary breast cancer patients. Obtained data were evaluated by Independent Samples t-test, ROC Curve, Logistic Regression, Kaplan Maier and Cox Proportional Hazards Regression Analysis. Expression levels of HOXB13 is 1.31 fold higher and expression levels of IL17BR is 0.80 fold lower in tumor samples than normal tissues of patients but it isn't determined any statistical significance (p = 0.3559, p = 0.3166). An increase in HOXB13:IL17BR gene expression ratio is significantly correlated with survival of breast cancer patients and treatment response (p= 0.0491, p= 0.0267). miR-661, miR-1260 and miR-1266 expression levels are 1.94, 1.59 and 1.38 fold higher and miR-1278 expression level is 0,30 fold lower in tumor than normal tissue (p= 0.3578, p= 0.3451, p= 0.6930, p= 0.2428). HOXB13 associated miR-1278 and IL17BR associated miR-1266 expression levels are significantly correlated with recurrence/distant metastasis (p = 0.0014, p = 0.0048). HOXB13 and IL17BR gene expressions are not observed in peripheral blood samples of patients. These data will be beneficial for evaluation of miRNA expression levels target HOXB13 and IL17BR to obtain information about tumor aggressiveness and metastasis risk in ER(+) primary breast cancer patients. In this manner, it can be contributed to the studies of organization of different effective treatment approaches and improvement the quality of life and survival of patients. Moreover, the present study is the first study that can contribute to the international and national literature in terms of guide for further studies for the determination of biomarkers in miRNA levels providing follow-up of poor prognosis and evaluating the effectiveness of the treatment in ER(+) Turkish primary breast cancer patients.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    884772

    Mammogram görüntülerinden derin öğrenme yöntemleri ile meme kanseri teşhisi

    Breast cancer diagnosis with deep learning methods from mammogram images

    FURKAN ESMERAY

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Mühendislik BilimleriFırat Üniversitesi

    Elektrik ve Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ARİF GÜLTEN

  2. Tez No

    243118

    Metastatik meme kanserli hastalarda primer ve rekürren/metastatik hastalığa ait dokularda ER, PR, HER-2 ekspresyonunun karşılaştırılması

    Comparison of ER, PR and HER-2 in primary and paired recurrent/metastatic lesions in metastatic breast cancer patients

    EBRU SARI

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    OnkolojiHacettepe Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YAVUZ ÖZIŞIK

  3. Tez No

    243412

    Adjuvan kemoterapi alan meme kanserli olgularda ghrelin, obestatin, leptin düzeyi ile kilo artışı ilişkisi

    The relationship between weight gain and ghrelin, obestatin and leptin levels in the breast cancer treated by adjuvant chemoteraphy

    NİMET YILMAZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    OnkolojiFırat Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AZİZ KARAOĞLU

  4. Tez No

    246744

    Analysis of differentially expressed genes in breast cancer: BRCA1-induced gene expression profiles and meta-analysis gene signature

    Meme kanserinde farklılaşmış ifade gösteren genlerin analizi: BRCA1 tarafından indüklenen gen ifade profilleri ve meta-analiz gen imzası

    BALA GÜR DEDEOĞLU

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2009

    Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. IŞIK G. YULUĞ

  5. Tez No

    248694

    Meme kanserli 640 hastada hormon reseptör durumu ve HER-2/neu düzeyi ile tedavi sonuçları arasındaki ilişki

    The releationship between HER-2/neu level and hormone receptor status with treatment results in 640 breast cancer patients

    FATİH DEMİRCİOĞLU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    OnkolojiGazi Üniversitesi

    Radyasyon Onkolojisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YÜCEL PAK

Geri Dön