Geri Dön

Candida türlerinin tanımlanmasında iki farklı isitemin karşılaştırılması

Comparison of two different medhots for identification candida species

PDF İndir

  1. Tez No: 360203
  2. Yazar: ÜLKÜ GAYIBOV
  3. Danışmanlar: PROF. DR. BEYZA ENER
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2014
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Uludağ Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Temel Tıp Bilimleri Bölümü
  12. Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 50

Özet

Fırsatçı mantarlar, nozokomiyal enfeksiyonların önemli nedenlerinden biri olup, C. albicans ve diğer Candida türleri hastalardan artan sıklıkta izole edilmektedir. Bunlardan bir kısmı yaygın kullandığımız antifungallere dirençli olduklarından, uygun tedaviye başlamak için hızlı ve doğru tanımlama gerekir. Bu çalışmada da API ID 32 C (bioMerieux France) ve Phoenix Yeast ID (Becton, Dickinson Diagnostics, Sparks, MD) tanımlama sistemlerinin karşılaştırılması ve morfolojik bulguların tanımlamaya etkisinin değerlendirilmesi amaçlanmıştır. İzolatlar, çalışma döneminde Uludağ Üniversitesi Hastanesi'nde yatan hastaların örneklerinden elde edilmiştir. Tüm izolatlar çimlenme borusu ve mikroskobik morfoloji açısından incelenmiş ve üretici firmaların önerileri doğrultusunda tanımlama yapılmıştır. İki sistem arasındaki uyum yüzde olarak hesaplanmış ve uyumsuz sonuçlar, morfolojik bulgularla çözümlenmeye çalışılmıştır. Yüz otuz yedi hastadan toplam 211 maya izolasyonu olmuştur. İzolatların 159'unda aynı tanımlama elde edilmiş olup, %75,4 uyum saptanmıştır. Uyum, sık izole edilen türlerde (%81,7), seyrek olanlara (%38,7) göre anlamlı olarak (p=0.034; x2 test) daha yüksek bulunmuştur. Her ne kadar anlamlı olmasa da (p=0.31; x2 test) morfolojik bulguların eklenmesi ile uyum oranı (%88,1) artmıştır. Uyumlu tanımlama bulgularına göre, en sık izole edilen tür C. albicans (%44,1) olmuş, bunu C. tropicalis (%9,9), C. glabrata (%9,5), C. parapsilosis (%8,5) ve C. kefyr (%8,1) izlemiştir. Tür tanımlanmasında moleküler yöntemler daha doğru olsa da, klinik mikrobiyoloji laboratuvarlarında halen fenotipik yöntemlerden yararlanılmaktadır. Bu çalışmada da iki sistemin karşılaştırılabilir olduğu ve morfolojinin tanımlamaya pozitif etkisi görülmüştür. Phoenix Yeast ID Panel kullanımı ve yorumlanması kolay olup, API ID 32 C'den 24 saat daha erken sonuçlanmaktadır. Hiçbir yöntemin tek başına tamamen güvenilir olmadığı düşünülürse, laboratuvarlarda tür tanımlamasında dikkatli değerlendirme şarttır.

Özet (Çeviri)

Comparison of Two Different Methods for Identification of Candida species Opportunistic fungal pathogens are becoming important causes of nosocomial infections. Candida albicans and other Candida species are increasingly recovered from patients. Since many of the yeasts have been found to be resistant to the most common antifungal agents, the introduction of appropriate therapy depends on the rapid and accurate identification. The aim of this study, was to compare the identification of API ID 32 C (bioMerieux France) and Phoenix Yeast ID (Becton, Dickinson Diagnostics, Sparks, MD) and to evaluate the effect of morphological findings in identification. İsolates were obtained from cultures of clinical specimens of individual patients, hospitalized at Uludağ University Hospital during the study period. Germ tube production and microscopic morphology were examined. All yeasts were tested according to manufacturer's recommandations and percentage of concordance between the two commerical systems was calculated. Discrepant results between the systems were tried to resolve by morphological tests. A total of 211 clinical yeast specimens from 137 patients were tested. Same identification was obtained among 159 isolates and 75,4% concordance was found. The concordance was found significantly higher (p=0.034; x2 test) in species more frequently isolated (81,7%) than the rare ones (38,7%). Although not significant (p=0.31; x2 test), the rate of concordance between the systems was increase (88,1%), when adding the morphological findings. According to the concordant identification, the most frequently isolated species was found C. albicans (44,1%) followed by C. tropicalis (9,9%), C. glabrata (9,5%), C. parapsilosis (8,5%) and C. kefyr (8,1%). Although molecular methods are more accurate to identify the species, many clinical microbiology laboratories still rely on phenotypic methods. We found that the two identification systems were comparable and careful observation of yeast morphology can add confidence to the identification. The Phoenix Yeast ID system was very easy to use and interpret, and the results were obtained approximately 24 hours earlier than those of the API ID 32 C system. As none of the methods evaluated was completely reliable as a stand-alone, careful evaluation is necessary for laboratories to identify these species.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    628080

    Albicans dışı candida türlerinin isimlendirilmesinde iki farklı MALDI-TOF MS yönteminin karşılaştırılması

    Comparative evaluation of the maldi biotyper and vitek MS matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight (MALDI-TOF) mass spectrometry systems for identification of non-albicans candida

    LEYLA TEKE

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    MikrobiyolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BANU BAYRAKTAR

  2. Tez No

    831197

    Skin infections caused by emerging Candida species

    Candida türlerinin neden olduğu deri enfeksiyonları

    LEENA MUTAR IBRAHIM AL BUMHEDEE

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SERDAL TARHANE

  3. Tez No

    352381

    Microbiota analysis in dishwashers by using the next generation sequencing

    Bulaşık makinalarındaki mikrobiotanın belirlenmesinde yeni nesil dna dizi analiz tekniğinin kullanılması

    DUYGU KAVADARLI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    İleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NEVİN GÜL-KARAGÜLER

    PROF. DR. MELEK TÜTER

  4. Tez No

    857071

    Farklı klinik örneklerden izole edilen Candida parapsilosis kompleks türlerinin genotipik olarak tanımlanması

    Genotypic identification of the Candida parapsilosis complex species isolated from different clinical samples

    ÖZLEM KARATAŞ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    MikrobiyolojiEge Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖZLEM ABACI GÜNYAR

  5. Tez No

    408453

    Kan kültürlerinden izole edilen candida türlerinin floresan in situ hibridizasyon yöntemiyle tanımlanması ve antifungal duyarlılıklarının araştırılması

    Determination of candida species isolated from blood cultures with floresan in situ hibridization method and investigation of antifungal susceptibilty

    GONCA AYDEMİR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    MikrobiyolojiErciyes Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞE NEDRET KOÇ

Geri Dön