Identification of the lactobacillus species originated from human gut by pcr - ardra technique
İnsan bağırsağı kaynaklı lactobacıllus türlerinin pcr-ardra tekniği ile tanımlanması
- Tez No: 360533
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. MEHMET ÖZTÜRK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2014
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Abant İzzet Baysal Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Bölümü
- Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 87
Özet
Konakçı sağlığı üzerinde olumlu etkiler gösteren canlı mikroorganizmalar probiyotik olarak adlandırılır. Son yıllarda, probiyotik olan laktobasillerin tüketicinin sağlığı için faydalı olduğu düşünülen ürünlerde kullanılmasıyla buna olan ilgi artmıştır. Lactobacilluslar çoğunlukla endüstriyel ve klinik öneme sahip olan şu anda yaklaşık 140 türü ile birlikte en önemli organizmalar arasındadır. Probiyotik suşun sadece fenotipik ve fizyolojik özellikleri bakımından tanımlanması genellikle çok fazla ayırt edici değildir. Tür seviyesinde Lactobacillus'un tanımlanması günden güne daha gerekli hale gelmektedir. Maalesef metodların çoğu yoğun iş yüklü, maliyetli ve zaman alıcıdır. Bu araştırmanın amacı çoğaltılmış 16S ribosomal DNA kesim analizlerinin (ARDRA) kullanımı ile insan sindirim sisteminde bulunan 14 Lactobacillus suşunu ayırt etmek ve tanımlamaktır. Bu çalışmada, 16S rRNA genine karşı iki üniversal primer (8UA ve 1492R) kullanılarak 1.5 kbç PZR ürünleri, üreticilerin ticari amaçla kullandığı suşlardan elde edilmiştir. Türe özgü restriksiyon parçaları oluşturmak için, çeşitli veri tabanlarından elde edilen 14 Lactobacillus türünün 16S rRNA gen dizilerinin eşleşmeleri sonucu üç adet restriksiyon endonukleaz (FspBI, HinfI ve DraI) seçilmiştir. PZR ürünlerinin bu üç enzim tarafından kesilmesi sonucu oluşan fragmentlerin 14 tür için özgün olan fragmentler oluşturduğu görülmüştür. Ondört ticari Lactobasillus türünden elde edilen 1.5 kbç PZR ürünlerinin FspBI, HinfI ve DraI endonukleazları ile kesimi sonucunda sırası ile altı, dört ve iki Lactobasillus türü ayrıştırılmıştır. Sunulan bu çalışma 1.5 kbç 16S rRNA gen parçalarının insan sindirim sisteminde bulunan Lactobacillus türlerini etkili, hızlı ve uygun bir şekilde ayırt edilidiğini ve tanımlandığını göstermiştir.
Özet (Çeviri)
Probiotic means 'living microorganisms' which have beneficial effects on their host's health. In recent years, interest in the probiotic lactobacilli has been stimulated by the use of these bacteria in products that are claimed to confer health benefits on the consumer. Lactobacillus is among the most important organisms with nearly 140 species at present, mostly of industrial and clinical importance. The identification of probiotic strain only in phenotypic and physiyological characteristics is often with a low level of discrimination. The identification of Lactobacillus at species level is becoming more and more required. Unfortunately, most of the methods are labor-intensive, costly, and time-consuming. The aim of this study is to identify and discriminate fourteen Lactobacillus strains that have been found in the human alimentary tract by the use of amplified 16S ribosomal DNA restriction analysis (ARDRA). In this study, using two universal primers (8AU and 1492R) against the 16S rRNA gene, 1.5 kb PCR products were obtained from the commercial strains of the manufacturers. To obtain species-specific restriction patterns, three restriction endonucleases (FspBI, HinfI and DraI) were chosen for the aligning of the 16S rRNA gene sequences of fourteen Lactobacillus species retrieved from various databases. It was shown that 1.5 kb amplicon digested by these enzymes provided unique patterns of almost fourteen species. Digestion of the 1.5 kb PCR product with FspBI, HinfI and DraI endonucleases differentiated six, four and two species of Lactobacillus respectively. The present study has demonstrated that 1.5 kb 16S rRNA gene fragments can be identified and differentiated in a reliable, rapid and accurate manner for Lactobacillus species that are found in the human alimentary tract.
Benzer Tezler
- Probiyotik özellik taşıyan gıda ve insan kaynaklı laktobasillerin izolasyonu tanımlanması ve bakteriyosin üretim yeteneklerinin karakterizasyonu
Isolation and identification of probiotic lactobacilli orginated from food and human and characterization of the ability of bacteriocin production
BAŞAR UYMAZ
- Hindi kökenli enterococcus faecium, bifidobacterium ve lactobacillus türlerinin probiyotik özelliklerinin araştırılması
Investigation of probiotic properties of turkey originated enterococcus faecium, bifidobacterium and lactobacillus species
NERGİZ VURUCU
Doktora
Türkçe
2024
Veteriner HekimliğiAydın Adnan Menderes ÜniversitesiMikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. SERAP SAVAŞAN
- Bazı fermente ürünlerden izole edilen Pediococcus suşlarının ürettiği laktik asit ve diasetil miktarlarının belirlenmesi
Determination of lactic acid and diacetyl amounts produced by Pediococcus strains isolated from some fermented products
ASENA ASLIHAN ÇELİK
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Gıda MühendisliğiAnkara ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KAMURAN AYHAN
- Bakteriyel vaginosis'li ve sağlıklı kadınların genital ve rektal sürüntü örneklerinden izole edilen laktobasillerin (duderlein basilleri) tanımlanması ve genotipik özelliklerinin araştırılması
Bacterial vaginosis'li and lactobacilli isolated from healthy women, genital and rectal swab samples (duderlein bacilli) and genotypic identification of studying the properties of
SUNA KIZILYILDIRIM
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
MikrobiyolojiÇukurova ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATİH KÖKSAL
- Çeşitli peynirlerdeki bakteriyel ekosistemin PZR-DGJE yöntemi kullanılarak mikrobiyal biyoçeşitliliğinin tanımlanması
Identification of bacterial diversity in different type of traditional Turkish cheeses by using PCR-DGGE method
AYTÜL BAYRAKTAR SOFU
Doktora
Türkçe
2009
BiyoteknolojiSüleyman Demirel ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. F. YEŞİM EKİNCİ