Geri Dön

Klinik örneklerde mycobacterium tuberculosis tanısında hızlı bir real time-PCR (MTB/RIF) testinin konvansiyonel yöntemlerle karşılaştırılması

Comparison of a real time PCR (MTB/RIF) test with conventional methods in the diagnosis of mycobacterium tuberculosis in clinical specimens

PDF İndir

  1. Tez No: 365887
  2. Yazar: ONUR ÇAĞLAYAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET ÜNLÜ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Mycobacterium tuberculosis, Erlich-Ziehl Neelsen, GeneXpert®MTB/RIF, VersaTREK, rifampisin, Mycobacterium tuberculosis, Erlich-Ziehl Neelsen, GeneXpert®MTB/RIF, VersaTREK, rifampisin
  7. Yıl: 2014
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Balıkesir Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 83

Özet

Klinik Örneklerde Mycobacterium tuberculosis Tanısında Hızlı Bir Real Time-PCR (MTB/RIF) Testinin Konvansiyonel Yöntemlerle Karşılaştırılması Bu çalışmanın amacı, M. tuberculosis tanısında, GeneXpert®MTB/RIF (Sunnyvale, USA) moleküler yönteminin konvansiyonel yöntemler ile karşılaştırılmasıdır. Bu çalışmada, Balıkesir Üniversitesi Hastanesi, Mikrobiyoloji Laboratuvarı ve Balıkesir-Göğüs Hastalıkları Hastanesi, Mikrobiyoloji Laboratuvarı'nda, Eylül 2012 ile Mayıs 2014 tarihleri arasında, primer tüberküloz (TB)'lu hastalardan alınan 96 klinik örnek kullanılmıştır. Klinik örneklerin Erlich-Ziehl Neelsen (EZN) boyama ile mikroskobik incelemesi, L-J ve VersaTrek yöntemleri ile kültürleri ve antimikobakteriyel duyarlılık testleri yapıldı. VersaTrek sıvı kültür yöntemi ile üretilen bakteriler, tekrar mikroskopi ile incelendi ve tip tayini yapılarak M. tuberculosis kompleks olduğu doğrulandı. ARB (+) olan 89 örnek ve ARB (-) olup VersaTrek kültür incelemesi pozitif olan 7 örnek olmak üzere, primer TB'lu hastadan alınan toplam 96 örnek, konvansiyonel yöntemlere ek olarak, moleküler tanı amacıyla MTB/RIF yöntemi ile M. tuberculosis kompleks ve RIF direnci yönünden incelemeye alındı. Kültür yöntemiyle antimikrobiyal duyarlılık testi uygulanan hasta örneklerinin 1'inde RIF direnci saptanırken, MTB/RIF yöntemiyle bu örnekte RIF direnci saptanmadı. İncelemeye alınan 96 örnekte, kültür yöntemleri kullanarak, L-J ve VersaTrek ile sırasıyla %62.5 (60) ve %81.3 (78) oranında pozitiflik saptandı. MTB/RIF yöntemi ile incelenen 96 örneğin %93.8'i (90) pozitif olarak bulundu. ARB (+) 89 örneğin %97.8'i (87) ve ARB (-) 7 örneğin ise %42.9'u (3) pozitif olarak bulundu. Sonuç olarak; GeneXpert®MTB/RIF yönteminin, kolay uygulanması, kısa sürede sonuç vermesi, duyarlılığının yüksek düzeyde olması ve konvansiyonel yöntemlerle kıyaslanabilir veya daha iyi sonuçlar vermesi nedeniyle primer TB vakalarının tanı süresini kısaltmada önemli rol oynayabileceği değerlendirilmektedir.

Özet (Çeviri)

Comparison of A Real Time PCR (MTB / RIF) Test with Conventional Methods in the Diagnosis of Mycobacterium tuberculosis in Clinical Specimens The pupose of the current study to compare GeneXpert®MTB/RIF (Sunnyvale, USA) molecular method with conventional methods in the diagnosis of M. tuberculosis in 96 clinical specimens that were taken from patients with primary tuberculosis (TB) who were admitted to Balıkesir University Hospital and Balıkesir Thoracic Diseases Hospital between September 2012 to May 2014. Microscopic examination by Erlich-Ziehl Neelsen (EZN) staining, L-J and VersaTrek culture and antimycobacterial susceptibility testing of specimens were performed. The bacteria grown by VersaTrek liquid culture were examined by microscopy and confirmed by typing to be M. tuberculosis complex. 89 ARB (+) specimens and 7 ARB (-), VersaTrek culture positive specimens, a total of 96 specimens taken from the patients with primary tuberculosis, were examined by GeneXpert®MTB/RIF in molecular diagnosis of M. tuberculosis complex and RIF resistance in addition to conventional methods. RIF resistance has not been detected by MTB/RIF method in the specimens but one of them detected by antimicrobial susceptibility testing by culture method. In 96 specimens examined by using culture methods, L-J and Versatrek were found to be positive as 62.5% (60) and 81.3% (78), respectively. Of the 96 specimens examined by MTB/RIF method, 93.8% (90) were found to be positive. Of the 90 positive specimens, 45.6% (41) were medium-level, 27.8% (25) low-level, 24.4% (22) high-level and 2.2% (2) very low-level positive. 97.8% (87) of the ARB (+) 89 specimens, 42.9% (3) of the ARB (-) 7 specimens were found to be positive. In conclusion, GeneXpert®MTB/RIF method was considered to play an important role in early diagnosis of primary TB cases due to being easy to use, performed in a short time, having high sensitivity and comparable or better results than conventional methods.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    386587

    Çukurova bölgesinde klinik örneklerden izole edilen Mycobacterium tuberculosis kompleks (MTBK)suşlarında çoklu ilaç direnci (ÇİD) ile beraber ikinci seçenek anti-tüberküloz ilaçlara da karşı gelişen yaygın ilaç direncinin (YİD) fenotipik ve genotipik olarak incelenmesi

    Phenotypic and genotypic investigation of multidrug resistance (MDR) as well as extensively drug resistance (XDR) developing towards second-line anti-tuberculosis drugs in mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) strains isolated from clinical samples in cukurova region

    EMEL YARAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    MikrobiyolojiÇukurova Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. TOĞRUL NAĞIYEV

  2. Tez No

    611477

    Patojenik mikroorganizmaların tanısına yönelik elektrokimyasal nanogenosensör tasarımı

    Electrochemical nanogenosensor design for the detection of pathogenic microorganisms

    SEZİN YÜKSEL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyoteknolojiEge Üniversitesi

    Biyomedikal Teknolojiler Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. PINAR KARA KADAYIFCILAR

  3. Tez No

    195666

    Klinik örneklerde mycobacterium tuberculosis saptanmasında polimeraz zincir reaksiyonu ?enzim immunoassay (PCR-ELISA) yönteminin değerlendirilmesi

    Evaluation of polimerase chain reaction-enzyme linked immunoassay (PCR-ELISA) for direct detection of mycobacterium tuberculosis in clinical specimens

    MÜGE KARAKAYALI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıCelal Bayar Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. NURİ ÖZKÜTÜK

  4. Tez No

    662349

    Akciğer ve akciğer dışı tüberkülozda xpert ve xpert ultra testlerinin tanısal verimliliği

    Başlık çevirisi yok

    İHSAN TOPALOĞLU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Göğüs HastalıklarıSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Göğüs Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SERİR ÖZKAN

  5. Tez No

    912034

    23S rRNA'yı hedef alan oligonükleotit prob ile Mycobacterium tuberculosis kompleks bakterilerinin fısh yöntemi ile hızlı identifikasyonu

    Rapid identification of Mycobacterium tuberculosis complex using oligonucleotide probe targeting 23S rRNAby fish method

    MELİSA TÜMKAYA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    MikrobiyolojiMersin Üniversitesi

    Moleküler Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLAY BÖREKÇİ

Geri Dön