Geri Dön

Sikloartan grubu sapogenollerden hareketle potansiyel sitotoksik etkinliği yüksek moleküllerin hazırlanması

Preparation of potentially cytotoxic molecules from cycloastragenol type sapogenols

PDF İndir

  1. Tez No: 371982
  2. Yazar: İSMAİL HAKKI AKGÜN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ERDAL BEDİR, PROF. DR. ERÇİN ERCİYAS
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyomühendislik, Kimya, Bioengineering, Chemistry
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2014
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ege Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 358

Özet

Bu tezde sikloastragenol ve 34 türevinin sentezi, karakterizasyonu ve sitotoksik aktiviteleri çalışılmıştır. Çalışılan 35 molekülün, PC-3 (insan prostat kanseri), HT-29 (insan kolon kanseri), MDA-MB-231 (insan meme kanseri) ve MCF-7 (insan meme kanseri) hücre hatları üzerindeki inhibisyon etkisi MTT test yöntemi kullanılarak belirlenmiştir. Bu moleküllerin içinden 20(R),24(S)-epoksi-3β,6α,16β,25-tetrahidroksisikloartan-3,6-dipivalat- türevi C19, MDA-MB-231 hücre hattında gösterdiği 6.20 µM IC50 değeri ile en aktif molekül olarak belirlenmiştir. Moleküllerin lineer yapı –aktivite ilişkileri daha önceki çalışmalardan farklı olarak Yapı-Aktivite Yüzey Indeksi (YAYI) yaklaşımı ile değerlendirilmiştir. Moleküllerin YAYI grafikleri yapı ile aktivite arasındaki ilişkiyi açıklayabilmek için yapay sinir ağları (YSA) regresyonu modeli gibi non-lneer yöntemler yerine klasik çoklu lineer regresyon modeli (ÇLR), temel bileşenler regresyonu modeli (TBR), ya da kısmi en küçük kareler (KEK) yönteminin kullanılmasının anlamsız olduğunu göstermiştir. Nitekim tüm hücre hatlarında en yüksek regresyon katsayısı ve en düşük farkların karelerinin toplamı değerleri yapay sinir ağı regresyonu modelinde elde edilmiştir. Bunlara ek olarak YAYI grafikleri molekül seti içindeki aktivite tepelerini aydınlatmamızda yardımcı olmuştur. YAYI değerlerinin ve heatmap grafiklerinin yardımı ile HT-29 hücrlerinde iki, PC-3, MCF-7 ve MDA-MB-231 hücre hatlarında 1'er tane aktivite tepesi oluşturan molekül çifti belirlenmiştir.

Özet (Çeviri)

In this thesis, synthesis, characterization, cytotoxic activities of cycloastragenol (C1) and its 34 derivatives were described. The effect of derivatives on the growth of PC-3 (human prostate adenocarcinoma), HT-29 (human colon colorectal adenocarcinoma), MDA-MB-231 (human breast adenocarcinoma), MCF-7 (human breast adenocarcinoma) human cancer cell lines was determined using MTT assay. In this series, (-20(R),24(S)-epoxy-3β,6α,16β,25-tetrahydroxycycloartane-3,6-pivalate) C19 was found to be the most active compound with its 6.20 µM IC50 values on MDA-MB-231 cell line. Linear structure activity relationship of these derivatives were inspected via Structure Activity Landscape Index (SALI) approach that was distinctive compared to other studies in this thesis. SALI graphs of the molecules indicated that it was unmeaningful to build models with classical linear regression like multiple linear regression (MLR), principle component regression (PCR) and partial least square regression (PLS) in stead of non-lineer regression model artifical neural network (ANN). Best regression coefficients and lowest sum of squares of error values were obtained with artifical neural network models in all cell line. Besides, SALI graphs were useful in determining activity cliffs of the molecule set. As an outcome of the SALI calculations and heatmap graphs, we identified two activity cliffs in HT-29, one each in PC-3, MCF-7 and MDA-MB-231 cell lines.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    315667

    Sikloartan grubu siklokantogenol ve astragenol saponinlerinin mikrobiyal biyotransformasyonu

    Microbial biotransformation of cycloartane type saponins cyclocanthogenol and astragenol

    CEYDA KULA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    BiyomühendislikEge Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ERDAL BEDİR

  2. Tez No

    256055

    Sikloartan grubu saponinlerin mikrobiyal biyotransformasyonu

    Microbial biotransformation of cycloartane type saponins

    MELİS KUBAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    BiyomühendislikEge Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GAYE ÖNGEN

    PROF. DR. ERDAL BEDİR

  3. Tez No

    455643

    Septofusidium berolinense'nin biyoaktif sekonder metabolit içeriğinin araştırılması ve endofitik funguslarla sikloartan grubu saponinlerin biyotransformasyonu

    Research on bioactive secondary metabolite profile of Septofusidium berolinense and biotranformation of cycloartane type saponins by endophytic fungi

    GÜNER EKİZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    BiyomühendislikEge Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ERDAL BEDİR

    PROF. DR. ELİF ESİN HAMEŞ

  4. Tez No

    276407

    Astragalus schottianus boiss. türü üzerinde fitokimyasal ve biyolojik aktivite çalışmaları

    Biological activity and phytochemical studies of Astragalus schottianus boiss. species

    FATİH KARABEY

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    BiyolojiEge Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ERDAL BEDİR

  5. Tez No

    320651

    Doğal ürünlerden elde edilen potansiyel sitotoksik moleküllerin NFKB (Nükleer Faktör KappaB) aktivasyonuna olan etkilerinin incelenmesi

    Investigation of the effects of potential cytotoxic molecules from natural products on NFKB (Nuclear Factor KappaB) activation

    FATMA KOCABAŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    BiyomühendislikEge Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ERDAL BEDİR

Geri Dön