Fetal sığır serum asetilkolinesterazının tetramerik yapısını organize eden poliprolin peptidlerin kütle spektrometre ile analizi
Determination of polyproline tetramer organizing peptides in fetal bovine serum acetylcholinesterase by mass spectrometry
- Tez No: 375000
- Danışmanlar: PROF. DR. ÖZDEN TACAL, PROF. DR. Oksana Lockridge
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2014
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 106
Özet
Fetal sığır serumunda bulunan asetilkolinesteraz (AChE), tetramerik yapıda bir enzimdir. İnsan ve at serumunda bulunan ve AChE ile ilişkili bir enzim olan bütirilkolinesterazın (BChE) tetramerik yapıya dönüşmesinde poliprolin peptidlerin rolü bilinmektedir. Bu çalışmanın amacı, çözünür, tetramerik AChE'ın yapısında tetramer yapıyı organize eden peptidlerin olup olmadığını incelemektir. Çalışmada öncelikle fetal sığır serum AChE'ı, kaynatılarak denatüre edildi ve böylece non-kovalent bağlı peptidlerin AChE'dan salınmasına izin verildi. Peptidler, daha sonra ana proteinden filtrasyon ve HPLC yöntemleri kullanılarak saflaştırıldı. Salınan peptidlerin kütlesi ve amino asit dizisi, MALDI–TOF–TOF ve LTQ-Orbitrap kütle spektrometresi ile belirlendi. Çalışmanın sonunda 5 aile içerisinde sınıflandırılan ondört poliprolin peptid tanımlandı. Çalışılan peptidlerden en uzun peptidin, başka bir amino asit olmaksızın 25 tane ardışık prolin aminoasiti içerdiği bulundu. Diğer poliprolin peptidlerin yapısında ise bir adet farklı bir amino asitin bulunduğu gözlendi. Memeli proteom veritabanında yapılan araştırma sonucunda poliprolin peptidlerin, en azından 5 farklı prekürsör proteinden kaynaklandığı ve onların membrana-bağlı AChE'ın ColQ veya PRiMA'dan bağımsız olduğu bulundu. Günümüze kadar, AChE ve BChE, yapılarında tetramer yapıyı oluşturan poliprolin peptidleri içerdiği bilinen iki proteindir.
Özet (Çeviri)
Acetylcholinesterase (AChE) in the serum of fetal bovine is a tetrameric enzyme. The related enzyme, butyrylcholinesterase (BChE), in the sera of humans and horse requires polyproline peptides for assembly into tetramers. The goal of this study was to determine whether soluble tetrameric AChE includes tetramer organizing peptides in its structure. In this study, fetal bovine serum AChE was denatured by boiling to release non-covalently bound peptides. Released peptides were separated from bulk protein by filtration and by high performance liquid chromatography. Peptide mass and amino acid sequence of the released peptides were determined by MALDI–TOF–TOF and LTQ-Orbitrap mass spectrometry. Fourteen polyproline peptides, divided into 5 families, were identified. The longest peptide contained 25 consecutive prolines and no other amino acid. Other polyproline peptides included one nonproline amino acid. A search of the mammalian proteome database suggested that this assortment of polyproline peptides originated from at least 5 different precursor proteins, none of which were the ColQ or PRiMA of membrane-anchored AChE. To date, AChE and BChE are the only proteins known that include polyproline tetramer organizing peptides in their tetrameric structure.
Benzer Tezler
- Biyomoleküllerde oksidatif hasarı engelleyici antioksidan aktivite tayini için elektrokimyasal yöntem geliştirilmesi
Electrochemical method development for determining antioxidant activity preventing oxidative hazard in biomolecules
AYŞE NUR ÖNEM
Doktora
Türkçe
2022
Kimyaİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA REŞAT APAK
PROF. DR. KEVSER SÖZGEN BAŞKAN
- Human bone marrow-mesenchymal stem cells differentiation into brain-like endothelial cells
İnsan kemik iliği-mezenkimal kök hücrelerin beyin benzi endotel hücrelerine ayrışması
LEYLA YILMAZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyolojiSabancı ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. NUR MUSTAFAOĞLU VAROL
- Monoklonal antikor üreten rekombinant çin hamster yumurtalık (rCHO) hücreleri için serumsuz ortam (SFM) tasarımı
Serum Free Medium (SFM) Design for the Cultivation of Monoclonal Antibody Producing Rekombinant Chinese Hamster Ovary (rCHO) Cells
ILGIN KIMIZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
BiyomühendislikEge ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. SULTAN GÜLÇE İZ
- Dulbecco's Modified Eagle's Medium (DMEM)'in laboratuvar ortamında üretilmesi ve fetal bovine serum (FBS) için bitkisel alternatiflerlerin geliştirilmesi
Production of Dulbecco's Modified Eagle's Medium (DMEM) in a laboratory environment and development of plant-based alternatives for fetal bovine serum (FBS)
MELİKE NAZAN AĞAÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Moleküler TıpKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiBiyomühendislik ve Bilimleri Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SABAHATTİN CÖMERTPAY
- Sığırlarda embriyo kültür medyumuna ilave edilen protein kaynaklarının embriyonik gelişim üzerine etkileri
Effects of the protein sources added to the bovine embryo culture medium on embryonic development
MEHMET YAĞMUR
Doktora
Türkçe
2005
BiyoteknolojiUludağ ÜniversitesiDölerme ve Suni Tohumlama Ana Bilim Dalı
PROF.DR. MUSTAFA KEMAL SOYLU