Geri Dön

Alabalıklarda görülen streptokkosis vakaları ile ilişkili bakteriyel patojenlerin multipleks polimeraz zincir reaksiyonu (MPCR) ile tanımlanması

Identification of encountered bacterial pathogens related with streptococcosis cases by using multiplex polymerase chain reaction (MPCR) in trout

PDF İndir

  1. Tez No: 376818
  2. Yazar: SAADET GÜRPINAR
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. ŞÜKRÜ KIRKAN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: S. difficilis, S. parauberis, L. garvieae, S. iniae, gökkuşağı alabalığı, identifikasyon, mPCR, S. difficilis, S. parauberis, L. arvieae, S. iniae, rainbow trout, identification, mPCR
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Adnan Menderes Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 48

Özet

Araştırma için alabalık yetiştiriciliği yapılan 4 farklı çiftlikten alınan 220 adet 50-60 g ağırlığındaki Gökkuşağı alabalığı (Oncorhynchus mykiss Walbaum 1792) örnekleri multipleks PCR (mPCR) yöntemi ile incelenmiştir. Multipleks PCR çalışması sonucunda identifiye edilen hedef patojenlerin toplam örneklerin % 62,71?inden Streptococcus spp. ve Lactococcus spp. identifikasyonu gerçekleştirilmiştir. 220 adet örnekten yapılan Multipleks PCR identifikasyonu sonucundaki tür bazındaki yüzde dağılımları, L. garvieae % 52,17, S. parauberis % 27,54 ve S. difficilis % 20,29?dir Multipleks PCR ile yapılan identifikasyonlarda hedef patojen türlerinin çiftlik bazındaki % dağılımları incelendiğinde, L. garvieae?nin % 45,45 oranı ile 1. çiftlikten en çok izole edildiği görülmektedir. Çiftlik bazında genel bir değerlendirme yapıldığında, 1. çiftlikten % 38,41; 2. çiftlikten % 25,36; 3. çiftlikten % 16,67 ve 4. çiftlikten % 19,56 oranlarında izolasyon gerçekleşmiştir. Araştırmamızda, Gökkuşağı alabalıklarında (Oncorhynchus mykiss Walbaum 1792) Lactococcus garvieae, Streptococcus parauberis ve Streptococcus difficilis?in multipleks PCR ile varlığı belirlenmiştir. Araştırmamızda, Gökkuşağı alabalıklarında (Oncorhynchus mykiss Walbaum 1792) ölümlerle ekonomik kayıplara neden olan Streptokokkosis hastalığının bilinen başlıca etkenlerinden Streptococcus ineae idendifiye edilmemiştir. Bunun yanında, Streptokokkosis vakalarında Lactococcus garvieae, Streptococcus parauberis ve Streptococcus difficilis?in rol oynadığı multipleks PCR ile ortaya konulmuştur.

Özet (Çeviri)

For this research a number of 220, weighing in 50-60 g rainbow trout (Oncorhynchus mykiss Walbaum 1792) samples from 4 different fish farm were examined by multiplex PCR (mPCR). At the end of multiplex PCR study, Streptococcus spp. and Lactococcus spp. target pathogens were identified at the rate of 62.71% from whole samples. The percentage distribution according to identified species were at the rate of L. garvieae 52.17%, S. parauberis 27.54% and S. difficilis 20.29%. The identified target pathogens by multiplex PCR percentage distribution according to fish farms, L. garvieae was isolated at the highest rate of 45.45% from 1st fish farm. In general fish farm evaluations (1st, 2nd, 3rd, 4th) showed that performed isolations were at the rate of 38.41%; 25.36%; 16.67% and 19.56%, respectively. In our study, Lactococcus garvieae, Streptococcus parauberis and Streptococcus difficilis presences in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss Walbaum 1792) were determined by multiplex PCR. Streptococcus ineae; the main agent of streptococcosis which causes economic losses with mortality in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss Walbaum 1792) was not identified. Moreover, Lactcoccus garvieae, Streptococcus parauberis and Streptococcus difficilis were found out by multiplex PCR which are main pothogens in streptococcosis.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    810048

    Tunceli ilindeki alabalıklarda yersinia ruckeri infeksiyonunun maldı-TOF MS yöntemiyle identifikasyonu ve sekans analizi

    Identification and sequence analysis of yersinia ruckeri infection in trout in Tunceli province by maldi-TOF MS

    GÖKÇE GÜRBÜZ ELGÜN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyoteknolojiMunzur Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÜLKÜ ÖZBEY

    PROF. DR. GÖKBEN ÖZBEY

  2. Tez No

    195021

    Gökkuşağı alabalıklarında (oncorhynchus mykiss) sık görülen patojen mikroorganizmaların tespiti ve antibiyotik duyarlılık düzeylerinin belirlenmesi

    Detection of frequently seen pathogen microorganizms and determination of antibiotic susceptibility in rainbow trouts (oncorhynchus mykiss)

    DİLEK AKŞİT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    Veteriner HekimliğiAdnan Menderes Üniversitesi

    Farmakoloji ve Toksikoloji Ana Bilim Dalı

    Y.DOÇ.DR. CAVİT KUM

  3. Tez No

    360074

    Amoksisilin'in alabalıklarda (Oncorhynchus mykiss) in vivo genotoksik aktivitesinin değerlendirilmesi

    Evaluation of in vivo genotoxic activity of amoxicillin on rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)

    FATMA CEREN ANLAŞ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Genetikİstanbul Üniversitesi

    Farmakoloji ve Toksikoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. OYA ÜSTÜNER

  4. Tez No

    482563

    Bakteriyel enfeksiyonlara karşı kahverengi alabalıklarda gen ekspresyonunun belirlenmesi

    Determination of brown trout gene expression after bacterial infection

    SEÇİL TURGUT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Balıkçılık TeknolojisiKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Balıkçılık Teknolojisi Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İLHAN ALTINOK

  5. Tez No

    527728

    Ege Bölgesindeki alabalık çiftliklerinden yersinia ruckeri izolasyonu ve e-test yöntemi ile duyarlılıklarının belirlenmesi

    Isolation of yersinia ruckeri from rainbow trout farms in Aegean Region and determination of susceptibility with e-test method

    MERVE RENCİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Su Ürünleriİzmir Katip Çelebi Üniversitesi

    Su Ürünleri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TEVFİK TANSEL TANRIKUL

Geri Dön