Karadeniz bölgesindeki balıklarda viral hemorajik septisemi virüsünün izolasyonu ve patojenitelerinin belirlenmesi
Isolation of viral haemorrhagic septicemiae virus in fish in the black sea region and determination of its pathogenicity
- Tez No: 260533
- Danışmanlar: PROF. DR. YUSUF BOLAT
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Viral hemorajik septisemi hastalığı (VHSH), virüs izolasyon, sörvey, DNA dizileme, mortalite, Viral Haemorrhagic Septicemiae (VHS), virus isolation, survey, DNA sequencing, mortality
- Yıl: 2010
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Fırat Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Viroloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 85
Özet
Viral hemorajik septisemi hastalığı (VHSH) tüm dünyada, balıklarda yaygın olarak görülen önemli bir viral hastalıktır. Bu tezin amacı Karadeniz bölgesindeki balıklardan viral hemorajik septisemi virüs (VHSV)'ün izolasyonu ve izole edile virüslerin patojenitelerinin belirlenmesidir. Bu amaçla, öncelikle Karadeniz kıyısı boyunca 12 deniz balık türünde 3378 balıktan ve 62 alabalık işletmesinden alınan 2589 adet gökkuşağı alabalığından örnekler toplandı. Bu örneklerden elde edilen RNA'lar kullanılarak VHSV'nin varlığı tersine transkripsiyon-polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PZR) ile belirlendi. Daha sonra virüs varlığı belirlenen örneklerden, hücre kültüründe virüs izolasyonu gerçekleştirildi. Ayrıca, elde edilen bu virüslerin genomik kimliklendirilmeleri ve patojenik güçleri belirlendi. RT-PZR sonucunda yalnızca beş kalkan balığında VHSV RNA varlığı tespit edildi. Bu kalkan balıklarından izole edilen virüslerin patojenite çalışmaları sonucunda dördünün kalkan balıklarında oldukça patojenik oldukları kaydedildi. Bir izolatın ise patojenik olmadığı görüldü. Alabalıklarda ise kalkan balıklarından izole edilen tüm izolatların patojenik olmadığı belirlendi. Yapılan DNA dizi analizi sonucu tüm izolatların genogrup I içerisinde yer aldığı kaydedilmiştir. Bu çalışma sonucunda VHSV'nin Karadeniz kalkanında endemik olduğu kaydedildi. Bu çalışmanın verilerine göre, bu hastalığın Karadenizde son yıllarda kalkan balığı stoklarındaki azalma ile bir ilişkisi olabileceği ve bu nedenle VHSV ile ilgili daha detaylı ve kapsamlı çalışmaların yapılması gerektiğini önermekteyiz.
Özet (Çeviri)
Viral haemorrhagic septicemiae (VHS) is an important viral disease which is commonly seen in fishes around the world. The aim of this thesis was to isolate viral haemorrhagic septicemiae virus (VHSV) from fish living in the Black Sea region and to determine pathogenicity of the isolates. For this purpose, samples were collected from 3378 fish from 12 species in the Black Sea coast and 2589 rainbow trouts from 62 aquaculture farms in this region. Presence of VHSV was determined by using reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) from the RNA samples isolated from fish tissues. Later, the virus isolation from cell culture was performed from the VHSV detected samples by RT-PCR. Additionally, genomic identification and pathogenicity of the viruses were studied. RNA of VHSV was detected from five turbots only. In the pathogenicity tests, four of the virus isolates were found very pathogenic on turbot. On the other hand, one of the isolates was found not pathogenic. All the isolates were seen not to be pathogenic on trouts. According to the DNA sequence analysis, all the isolates were recorded to belong to genogroup I. In conclusion, VHS was found to be endemic in Black sea turbots. We suggest that there may be a relation between VHS and reduce in the turbot stocks in the Black sea in recent years. It is therefore required to conduct detailed studies on VHSV in order to have a better understanding of the epidemiology of the disease.
Benzer Tezler
- Doğu Karadeniz Bölgesindeki alabalık kuluçkahanelerinde ve yavru alabalıklarda bazı viral etkenlerin araştırılması
İnvestigation of some viral pathogens in trout hatcheries and juveniles in Eastern Black Sea Region
HÜSEYİN ALP
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
Veteriner HekimliğiMehmet Akif Ersoy ÜniversitesiViroloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. SİBEL HASIRCIOĞLU
PROF. DR. OYA BULUT
- Karadeniz'de avlanan balıklarda infeksiyöz pankreotik nekrozis (IPN), viral hemorajik septisemi (VHS) ve infeksiyöz hematopoetik nekrozis (IHN) virüs enfeksiyonlarının epidemiyolojisi
Epidemiology of infectious pancreatic necrosis (IPN), viral hemorrhagic septicemia (VHS) and infectious hematopoetic necrosis (IHN) virus infections in fish caught in Black sea
FATİH DOĞAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Veteriner HekimliğiOndokuz Mayıs ÜniversitesiVeterinerlik Viroloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HARUN ALBAYRAK
- Karadeniz'de avlanan balıklarda betanodavirus enfeksiyonunun epidemiyolojisi
Epidemiology of betanodavirus infection in captured fish in blacksea
BAHADIR MÜFTÜOĞLU
Doktora
Türkçe
2023
Veteriner HekimliğiOndokuz Mayıs ÜniversitesiVeterinerlik Viroloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HARUN ALBAYRAK
- Karadeniz bölgesi'ndeki gökkuşağı alabalıklarında Aquareovirus Aenfeksiyonlarının varlığının araştırılması
Investigation of the presence of Aquareovirus A infections in rainbow trout in the black sea region
SEMRA GÜNDÜZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Veteriner HekimliğiOndokuz Mayıs ÜniversitesiVeterinerlik Viroloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. CÜNEYT TAMER
- Akdeniz bölgesinde bulunan lagünlerdeki (akyatan, akgöl-paradeniz ve beymelek) levrek (Dicentrarchus labrax), çipura (Sparus aurata) ve bazı kefal türlerinde (ugil spp.) viral nervöz nekrozis (VNN) virusunun varlığının araştırılması
Investigation of viral nervous necrosis (VNN) virus in sea bass (Dicentrarchus labrax), sea bream (Sparus aurata and some mullet species (Mugil spp.) in lagoons in the mediterranean region (akyatan, akgöl-paradeniz and beymelek)
UFUK OĞUZ
Doktora
Türkçe
2024
Veteriner HekimliğiSelçuk ÜniversitesiVeterinerlik Viroloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SİBEL YAVRU