Real-time PCR kullanılarak Eğirdir Gölü ve çevresinde iki amfibi patojeninin (Batrachochytrium dendrobatidis ve Ranavirus) yaygınlığının ilk kez saptanması
First time determination of prevalence of the two amphibian pathogen(Batrachochytri̇um dendrobati̇di̇s ve Ranavi̇rus) around Eği̇rdi̇r Lake using real-time PCR
- Tez No: 382358
- Danışmanlar: DOÇ. DR. SAFİYE ELİF KORCAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2014
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Afyon Kocatepe Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 69
Özet
Bu araştırmada, Türkiyenin önemli tatlı su göllerinden biri olan Eğirdir Gölü ve çevresinde IUCN kriterlerine göre Kırmızı Liste'de (Red List)“Nesli tehlike altında bulanan hayvanlar”kategorilerinde yer alan ve azalmakta olduğu ifade edilen Pelophylax caralitanus türü üzerinde Real- Time PCR tekniği kullanılarak ölümcül hastalıklara neden oldukları bilinen iki amfibi patojeni Batrachochytrium dendrobatidis ile Ranavirüs genom equivalentlerine ait primeler kullanılarak ilk tespitinin yapılması ve B. dendrobatidis' in laboratuvar ortamında ilk kez kültüre alınması amaçlanmıştır. Arazi çalışmaları 2012 ve 2013 yılı olmak üzere 6 lokalite üzerinde iki tekrar halinde yapılmıştır. 2012 yılında yapılan çalışma sonuçlarında %17,02 oranında B. dendrobatidis, % 0 Ranavirüs pozitif sonuçları elde edilirken, 2013 yılı çalışmalarında % 45,00 oranında B. dendrobatidis ve % 5,00 oranında Ranavirüs pozitif sonuçlarına ulaşılmıştır. Ayrıca B. dendrobatidis kültür çalışmaları yapılarak mikroskop altında incelenerek sporangia, genç ve olgun sporahif, zoosporangia ve haploid zoospor yapılarına rastlanmıştır. Sonuç olarak, tüm dünyada amfibiler için ölümcül hastalıklarla bağlantılı olduğu bilenen ve popülasyon azalmalarına neden olan B. dendrobatidis' in gerek moleküler gerekse mikrobiyal analiz ile diğer polikilotherm hayvanlara kolaylıkla bulaşabilen Ranavirus' ün tarama çalışması yapılarak ülkemizin ilk kayıtları oluşturulmuştur.
Özet (Çeviri)
In this study, two amphibian pathogens were identified on endemic Pelophylax caralitanus which is located in Eğirdir Lake in Isparta and listed as Near Threatened (NT) on Red List by IUCN and also known as to be decreasing, using the Real – Time PCR (quantitative PCR, qPCR) technique. That two amphibian pahtogens are Batrachochytrium dendrobatidis and Ranavirus (Frog virüs, FV-3). In Eğirdir Lake, that pathogen organisms was determined for the first time using qPCR technique with specific primers. And also we aimed grow B. dendrobatidis in the medium in laboratuar conditions. P. caralitanus samples were collected with swab technique for twice between 2012 and 2013 years from 6 localities in field. Results of experiment of 2012 yaer were %17,02 positive for Batrachochytrium dendrobatidis and totaly negative for Ranavirus. On the other hands, results of 2013 were %45 positive for Batrachochytrium dendrobatidis and %5 positive for Ranavirus. Furthermore, we have examined B. dendrobatidis cultures under light microscope and we have detected sporangia, mature and immature sporahifas, zoosporangiums and hapolid zoospores. Consequently, that two deadly pathogens which responsible deadly disases and decreasing on amphibian populations; determinations of Batrachochytrium dendrobatidis (Bd) and Ranavirus (Iridoviridae) have been srudied and first records of that pathogens in Eğirdir Lake have determined.
Benzer Tezler
- Real-time PCR kullanılarak Beyşehir Gölü ve çevresinde iki amfibi patojeninin (Batrachochytrium dendrobatidis ve Ranavirüs) yaygınlığının ilk kez saptanması
First determination by real-time assay of prevalence of two amphibianan pathogens (Batrachochytrium dendrobatidis and Ranavirus) in Beyşehi̇r Lake and its surroundings
PINAR AĞYAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
BiyolojiAfyon Kocatepe ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. UĞUR CENGİZ ERİŞMİŞ
- Real-tıme PCR kullanılarak iki amfibi patojeninin (Batrachochytrium dendrobatidis ve ranavirus) araştırılması
Investigation of to amphibian pathogens using real-time PCR
HACER ÖZUSLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
GenetikAfyon Kocatepe ÜniversitesiMedikal Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. UĞUR CENGİZ ERİŞMİŞ
- Investigation of ischemia-reperfusion effects on DUSP1 and CXCL2 gene expression in rat kidney tissues using rt-PCR and real-time q-PCR
Rt-PCR ve gerçek zamanlı PCR kullanılarak sıçan böbrek dokularında DUSP1 ve CXCL2 genleri üzerindeki iskemi reperfüzyon etkilerinin incelenmesi
ŞEYMA HANDE TEKARSLAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2009
Moleküler Tıpİstanbul Teknik Üniversitesiİleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR
PROF. DR. ZİYA AKÇETİN
- Farklı çürük uzaklaştırma tekniklerinin süt dişi dentin dokusundaki mikroorganizmalar üzerine etkisinin Real-Time PCR kullanılarak in-vitro ortamda incelenmesi
Assessment of the antimicrobial effect of different caries removal techniques on dentinal caries of primary teeth by using Real-Time PCR: In-vitro study
MELİS ARDA SÖZÜÖZ
Doktora
Türkçe
2023
Diş HekimliğiSağlık Bilimleri ÜniversitesiÇocuk Diş Hekimliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MERVE AKSOY
- Mide kanserli hastalarda periferik kanda Telomeraz mRNA ekspresyonunun real time-PCR kullanılarak belirlenmesi ve klinikopatolojik özelliklerle ilişkisinin saptanması
The determination of telomerase mRNA expression in peripheric blood by real time-PCR and of association with clinicopathological parameters in patients with gastric cancer.
HAMDULLAH TURHAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2008
BiyokimyaAtatürk ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EBUBEKİR BAKAN