Geri Dön

Kolorektal kanserlere epigenetik yaklaşım; APC tümör supresör gen fonksiyon analizleri

Epigenetic approach to colorectal cancer; the functional analysis of tumor supressor gene APC

PDF İndir

  1. Tez No: 385261
  2. Yazar: EBRU ŞIK
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ÖZTÜRK ÖZDEMİR
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Onkoloji, Genetics, Oncology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2014
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 109

Özet

Kolorektal karsinogenez (KRK), normal hücrenin kanser hücresine dönüşümünde genetik ve epigenetik değişikliklerin rol aldığı çok basamaklı bir süreçtir ve moleküler genetiği tüm insan kanserleri arasında en iyi anlaşılmış olanıdır. Günümüzde gelişen teknoloji sayesinde ve epigenetik faktörlerin kanserdeki rollerinin anlaşılmasıyla bu alanda yoğun çalışmalar yapılmaya başlanmıştır. Tümör supresör genlerin promotor bölgelerinde CpG adacıklarının anormal metillenmesi, genlerin aktivitelerini bozabilir ve susturulmasına yol açar. Bu sessizlik hücre bölünmesi boyunca kalıtılır ve metilasyon inhibitörleri ile muamele haricinde geri dönüşümsüz olduğu kabul edilir. Çalışmamızda kolorektal kanser tanısı alan farklı tümör evresi ve farklı yaş gruplarından 20 birey yer almıştır. Öncelikli olarak tümör supresör APC geni, bunun yanında tümör supresör TP53, MGMT (191 nt), MGMT (346 nt), MSH6, BRCA1 ve BRCA2 genlerine ait promotor bölge metilasyon profilleri araştırılmıştır. Metod olarak, metil spesifik MLPA (Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification) yöntemi kullanılmıştır. Analizi amaçlanan gen bölgelerinin metilasyon paternleri SALSA MS-MLPA ME002-C1 tumor suppressor-2 probemix kiti kullanılarak incelenmiştir. Analizleri sonucunda APC geni %100 (20/20), TP53 geni %60 (12/20), MGMT (191 nt) geni %10 (2/20), MGMT (346 nt) geni %10 (2/20), MSH6 geni %60 (12/20) oranında metilasyon saptanmıştır. BRCA1 ve BRCA2 genlerinde metilasyon saptanmamıştır. Elde edilen epigenetik analizler, kanser vakalarında hem tümörlü dokuya özgü tedavi yöntemlerin geliştirilmesinde hem de sağkalım oranlarının artmasında oldukça yararlı olacaktır.

Özet (Çeviri)

Colorectal carcinogenesis is a multistep process that occured genetic and epigenetic changes in the transformation of normal cells into malignant cells and colorectal cancers, all of the molecular genetics of human cancer is the most well understood. Today, thanks to advanced technologies and understanding of the role of epigenetic factors in cancer, intensive studies have been started in this area. Abnormal methylation of CpG islands that tumor suppressor genes of the promoter regions, genes activity can disrupt and leads to silencing. This silence is inherited through cell division and except treatment with methylation inhibitors are considered to be irreversible. In our study involved in nineteen individuals have diagnosis of colorectal cancer who has been different tumor stage and different age groups. Firstly, the APC tumor suppressor gene, besides the tumor suppressor TP53, MGMT (191 nt), MGMT (346 nt), MSH6, BRCA1 and BRCA2 genes belonging to the promoter region methylation analysis was performed. In the method, methyl specific MLPA (Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification) method was used. Analysis of the methylation pattern of gene regions was examined using SALSA MS-MLPA ME002-C1-2 tumor suppressor kit probemix. As a result of analysis APC gene 100% (20/20), TP53 gene, 60% (12/20), MGMT (191 nt) gene is 10% (2/20), MGMT (346 nt) gene 10% (2/20), MSH6 genes is 60% (12/20) methylation ratio was determined. The obtained epigenetic analyzes, in the cancer cases both specific to tumor tissue development of treatment methods and in increasing of survival rate will be quite useful.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    288506

    Meme kanseri hastalarında TWIST, RARß2 ve ESR1 genlerinin metilasyon durumlarının Metilasyon Spesifik HRM (MS-HRM) yöntemiyle incelenmesi

    Investigation of the methylation status of TWIST, RARß2 and ESR1 genes in breast cancer patients by Methylation Specific HRM (MS-HRM) technique

    ONUR EROĞLU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    GenetikEskişehir Osmangazi Üniversitesi

    Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. BEYHAN DURAK ARAS

  2. Tez No

    647715

    Sporadik kolorektal kanserlerde epigenomik ve transkriptomik profilin entegrasyonu

    Integration of epigenomics and transcriptomics profiles in colorectal cancer

    EDİBE ECE ABACI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    BiyoteknolojiAnkara Üniversitesi

    Temel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HİLAL ÖZDAĞ

  3. Tez No

    538029

    Kolorektal kanserlerde yeni biyobelirteçlerin tanımlanması

    Identification of novel biomarkers in colorectal cancers

    SIDIKA ÖZTOP

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyoteknolojiAnkara Üniversitesi

    Temel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYTEKİN AKYOL

    PROF. DR. ERKAN YILMAZ

  4. Tez No

    175181

    Genom metilasyon profilinin kolorektal kanser etyolojisindeki rolü

    Başlık çevirisi yok

    ESRA ŞÜKRAN ÇAKAR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    GenetikCumhuriyet Üniversitesi

    Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İLHAN SEZGİN

  5. Tez No

    195563

    Genom metilasyon profilinin kolorektal kanser etiyolojisindeki rolü

    The role of genom methylation profiling in etiology of colorectal carcinogenesis

    ESRA ŞÜKRAN ÇAKAR KIRAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    Moleküler TıpCumhuriyet Üniversitesi

    Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. İLHAN SEZGİN

Geri Dön