Investigating evolutionary trade-offs for designing novel strategies to slow down evolution of antibiotic resistance
Evrimsel ödünleşimlerin araştırılarak antibiyotik direncini yavaşlatmak için yeni stratejilerin belirlenmesi
- Tez No: 389520
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. ERDAL TOPRAK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2013
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Sabancı Üniversitesi
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Bilimleri ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 120
Özet
Antibiyotik direnci küresel bir halk sağlığı sorunudur. Bu problemin en kolay çözümü tüm dirençli bakterileri öldürebilecek yeni ilaçlar geliştirmektir ama ne yazık ki bu çözüm ekonomik ve doğal kısıtlamalar sebebiyle mümkün olmamaktadır. Bir başka makul çözüm de alternatif tedavi metotları geliştirerek mevcut ilaçların daha etkili kullanılmasıdır. Henüz yeni strateji belirleme çabaları moleküler ve popülasyon düzeyinde antibiyotik direncinin sebepleri hakkındaki bilginin kısıtlı olması yüzünden faydalı olamamıştır. Biz bu sorunu çözmek için, ilaca duyarlı E.coli bakterilerilerini 22 farklı klinik olarak önemli antibiyotiğe karşı direnç kazandırdığımız ve sistematik olarak fenotip ve genotip değişikliklerine baktığımız geniş bir evrim deneyi uyguladık. Dirence sebep olan mutasyonların ortak genetik hedefleri ve neden olduğu fenotipik değişiklikleri oluşturduğumuz geniş veri setimizden faydalanarak belirledik. Analizlerimizi kullanarak antibiyotik direnci miktarını azaltabileceğimiz, çoklu ilaç tedavi stratejileri belirleyebiliriz. Umuyoruz ki bu araştırmayla geliştirdiğimiz yöntemler, kanser ve bağışıklık sistemi hastalıklarına karşı etkili tedavi bulmada da yardımcı olacaktır.
Özet (Çeviri)
Antibiotic resistance is a global public health problem. The straightforward solution to this problem is developing new antibiotics that can kill all of the drug resistant bugs, alas; this has not been possible so far due to economic and natural limitations. Another plausible solution to this problem is the effective use of already existing antibiotics by designing novel treatment strategies. However, efforts towards finding such strategies have not been rewarding to the date due to our limited knowledge about the origins of antibiotic resistance at the molecular and population levels. In order to tackle this problem, we performed an extensive laboratory evolution experiment where we evolved drug sensitive E.coli populations against 22 different clinically important antibiotic compounds and systematically phenotyped and genotyped evolved populations. Benefiting from this extensive data set, we identified common genetic targets for resistance conferring mutations and resulting phenotypic changes. Our analysis allows us design effective multidrug treatments strategies that can slow down evolution of antibiotic resistance. We hope that, the methodologies that were developed throughout this study will also be helpful for finding effective therapies for combating cancer and immune disease.
Benzer Tezler
- Commedia dell'Arte'nin opera üzerindeki dramatik ve müzikal etkilerinin incelenmesi
The dramatic and musical influences of Commedia dell'Arte on opera
BAHADIR NOYAN COŞGUN
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
MüzikANKARA MÜZİK VE GÜZEL SANATLAR ÜNİVERSİTESİSes Eğitimi Ana Sanat Dalı
DOÇ. RAŞİT GÖRKEM AYTİMUR
- Örgüt topluluklarında yeni örgüt formlarının oluşumu: Türkiye ve Avrupa bağlamında bir araştırma
Formation of new organizational forms in organizational populations: A study in the context of Türkiye and Europe
SENCER ÖZEL
Doktora
Türkçe
2024
İşletmeGalatasaray Üniversitesiİşletme Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NACİYE AYLİN ATAAY SAYBAŞILI
- Development of a novel evolutionary algorithm specialized for crystal structure prediction of molecular systems: MCaSP-Evo
Moleküler sistemlerin kristal yapı tahmini için özelleştirilmiş bir evrimsel algoritmanın geliştirilmesi: MCaSP-Evo
DENİZHAN TUTAR
Yüksek Lisans
İngilizce
2019
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrolİstanbul Teknik ÜniversitesiHesaplamalı Bilimler ve Mühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ADEM TEKİN
- An investigation of firm responses to rapid vs. continuousinstitutional change: dynamic view of firm performanceat post-entry
Başlık çevirisi yok
IZZET SİDKİ DARENDELİ
- Nörostratejik yönetimde fMRI ve EEG teknikleri ile beyni keşfetmek: İhracat gerçekleştiren karar vericiler üzerine bir araştırma
Exploring the brain with fMRI and EEG techniques in neurostrategic management: A study on export decision makers
FATMA YEŞİLKUŞ
Doktora
Türkçe
2024
İşletmeTarsus Üniversitesiİşletme Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ONUR BAŞAR ÖZBOZKURT
PROF. DR. BORA GÜRER