Meme kanserli hastalarda WNR, DOK 1 ve DSP genlerinde metilasyon değişikliklerinin araştırılması
Investigation of WRN , DOK 1 and DSP genes methylation status in breast cancer patients
- Tez No: 391098
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET NEJAT DALAY
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Onkoloji, Oncology
- Anahtar Kelimeler: Meme kanseri, Metilasyon, WRN geni, DOK1 geni, DSP geni, Breast cancer, Methylation, WRN gene, DOK1 gene
- Yıl: 2015
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Temel Onkoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Deneysel ve Moleküler Onkoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 67
Özet
Genomda anormal DNA metilasyonu neredeyse tüm kanser tiplerinde gözlenir. Bu olay birçok tümör baskılayıcı genin sessizleştirilmesine neden olarak malin değişikliklere zemin hazırlar. Bu nedenle her tümör türünde DNA metilasyon değişikliklerinin araştırılması, ilgili tümör davranışını daha iyi anlamamızı sağlayarak, klinik tanı ve tedavide yararlı olabilir. Çalışmamızda, meme kanserli 103 hastanın tümör ve normal dokuları materyal olarak kullanılarak; WRN, DOK1 ve DSP genlerindeki DNA metilasyon değişiklikleri incelenmiştir. Werner Sendrom (WS) geni genomun bütünlüğünü denetleyen bir tümör baskılayıcı gendir. WS' lu hastalarda WRN geninde mutasyonlar bulunmuştur. WRN mutasyonu taşıyan hastalarda geniş spektrumlu epitelyal ve mezenkimal tümörler gelişir ve hastalar 50 yaşından önce kaybedilir. Downstream of tyrosine kinase 1 (DOK1) geni; aday bir tümör baskılayıcı gendir. DOK1, hücrede MAP kinaz aktivitesini inhibe eder ve anti-proliferatif etki gösterir. DOK1 geninin değişik hücrelerde tümör baskılayıcı olarak işlev gösterdiği düşünülmektedir. Desmoplakin (DSP) ise plakin ailesinin bir üyesi ve desmozomal plakların bir bileşenidir. Birçok çalışma tümör hücrelerinin invazyon davranışlarının desmosomların azalmasıyla ilişkili olduğunu göstermiştir. Belirtilen genlerin metilasyonu akciğer kanseri, over kanseri ve kolorektal kanserlerde incelenmiş iken, özellikle meme kanserindeki metilasyon değişiklikleri hakkında literatürde herhangi bir çalışmaya rastlanmamıştır. Çalışmamız bu konudaki bilimsel açığı doldurmak üzere planlanmıştır. Meme kanserli hastalardan alınan taze tümör dokusu ile normal dokudan elde edilen DNA'ların bisülfit modifikasyonu yapıldıktan sonra örnekler polimeraz zincir reaksiyonu ile çoğaltılarak genlerin metillenme düzeyi değerlendirilmiştir. Çalışmamızda, tümör dokusu ile sağlıklı dokular karşılaştırıldığında araştırılan genlerin promotör bölgelerinde metillenme düzeyi açısından, WRN ve DSP genleri için anlamlı fark saptanmamış, ancak DOK1 geninin metillenme düzeyinde anlamlı değişiklik görülmüştür. Ayrıca bütün genlerin metillenme düzeyi ile tümör evresi arasında anlamlı bir ilişki saptanmıştır.
Özet (Çeviri)
Aberrant DNA methylation in the human genome is observed in all types of cancer. This contributes to malignant transformation by silencing tumor suppressor genes. Therefore, analysis of DNA methylation in distinct tumor types can help in understanding tumor behavior and may provide new treatment and diagnostic options. In our study, promoter methylation of the WRN, DOK1 and DSP genes were analyzed in tumors and normal tissue samples. Werner syndrome (WS) is an autosomal recessive disease characterized by premature aging, genetic instability and increased cancer incidence. Mutations in the WRN gene are found in patients exhibiting clinical symptoms of WS. The patients with WRN germline mutations develop a wide spectrum of epithelial and mesenchymal tumors which lead to death before the individuals are 50 years old. Downstream of tyrosine kinase 1 (DOK1) gene is a putative tumor suppressor gene. DOK1 inhibits MAP kinase activity and displays an anti-proliferative effect. DOK1 acts as a tumor suppressor gene in different cells. Desmoplakin (DSP) is a member of the plakin family of proteins and a component of the desmosomal plaques. Several studies indicate that the invasive behavior of tumor cells is associated with a decrease of desmosomes. Although methylation of these genes have been analyzed in lung, ovarian and colorectal cancer, there is no study in the literature investigating methylation of these genes in breast cancer. DNA was extracted from the normal and tumor tissue samples from 103 patients with breast cancer. Bisulfite- modified DNA was amplified by PCR and the methylation status of the genes was evaluated. In our study, promoter methylation status of the WRN and DSP genes were analyzed and statistically there is no differences were found between tumor and normal tissue samples, although DOK1 gene methylation status was statistically associated in the tumor and normal tissue samples. Also we analysed tumor stage and methylation status of these genes and our results suggest a corralation exists between the stage and methylation.
Benzer Tezler
- Meme kanserli hastalarda aksiller diseksiyon sonrası gelişen lenfödeme bağlı cilt ve tırnak bulguları
Evaluation of hand and nail findings in patients who develop lymphedema after axillary dissection
MUSTAFA SAYGIN DENİZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
OnkolojiKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. OZAN BALAKAN
- Meme kanserli hastalarda lenfödem gelişmesinde etkili risk faktörlerinin belirlenmesi
How to diagnose breast cancer patients with high-risk for upper extremity lymphedema: A cross-sectional study examining the risk factors associated with lymphedema and its prevalence
SİBEL KİBAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
Fiziksel Tıp ve RehabilitasyonSağlık BakanlığıFizik Tedavi ve Rehabilitasyon Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MELTEM DALYAN ARAS
- Meme kanserli hastalarda orem'in öz bakım eksikliği kuramı'na temellendirilmiş eğitimin kemoterapi yan etkilerinin yönetimine ve öz bakım davranışlarına etkisinin incelenmesi
Investigation of the effect of the training given according to orem's self-care deficit theory based education on the management of chemotherapy side effects and improving the patient's self-care of the patients with breast cancer
DİLEK URTEKİN
Doktora
Türkçe
2024
HemşirelikSağlık Bilimleri ÜniversitesiHemşirelik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEMİHA AKIN EROĞLU
- Meme kanserli hastalarda neoadjuvan kemoterapi sonrası mr incelemede radyolojik ve patolojik yanıtın karşılaştırılması ve patolojik yanıtı etkileyen olası parametreler açısından tedavi öncesi MR inceleme ile değerlendirilmesi
Comparison of radiological and pathological response in breast cancer patients after neoadjuvant chemotherapy on mr imaging and evaluation of pre-treatment MR for potential parameters influencing pathological response
MUSTAFA ENES MISIR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
Radyoloji ve Nükleer TıpAcıbadem Mehmet Ali Aydınlar ÜniversitesiRadyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA ERKİN ARIBAL
- Meme kanserli hastalarda beslenme düzeyi ve propolis kullanımının bağışıklık sistemi, kan değerleri ve yaşam kalitesine etkisi
Effects of nutrition and propolis use on quality of life, immune system and blood values in patiens with patient with breast cancer
ZEHRA YILDIRIM
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
OnkolojiTokat Gaziosmanpaşa ÜniversitesiPalyatif Bakım Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ŞAHİZER ERAYDIN