Yeni nesil dizileme teknolojisi ile zeytinin (Olea Europea L. cv. Ayvalık) pedisel dokusunun transkriptom dizilemesi
Transcriptome sequencing via next-generation sequencing technology in olive pedicel tissue (Olea europaea L. cv. Ayvalık
- Tez No: 411535
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MİNE TÜRKTAŞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2015
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 252
Özet
Zeytin (Olea europea L.) ağacı, Akdenizi simgeleyen bir kültürün parçası olmasının yanı sıra, oluşturduğu meyvesi ve bu meyveden elde edilen yağı ile ekonomik olarak çok değerli bir bitkidir. Bu çalışmada meyve ile ağaç arasındaki bağlantıyı sağlayan pedisel dokusunun gelişiminin moleküler mekanizmasını anlamak, bitkide fotosentez sonucu oluşan metabolitlerin zeytin meyvesine taşınımını sağlayan genetik mekanizmaları ortaya çıkarmak ve absisyon olayında etkili genetik faktörleri belirlemek için ham (Temmuz ayına ait), olgun (Kasım ayına ait) pedisel dokularından total RNA izole edilerek, yeni nesil dizileme teknolojisi Roche 454 GS FLX+ cihazı ile transkriptom dizileme çalışması yapılmıştır. Daha önce zeytinde pedisel dokusuna ait böyle bir çalışma yapılmamıştır. Dizileme sonucunda toplamda 164.733 okuma elde edilmiştir. Bu okumalar birleştirilerek biyoinformatik analizler yapılmış, elde edilen genler sınıflandırılarak tanımlanmıştır
Özet (Çeviri)
In addition to being part of a culture that symbolizes the Mediterranean, the olive (Olea europeaL.) tree with its oil obtained from the fruit and its fruit is economically a very valuable plant. In this study, transcriptome sequencing work is performed by isolating total RNA from the mature (belongs to month of december) and underripe (belongs to month of july) pedicel tissues by means of the the new generation sequencing technology device Roche 454 GS FLX+ to understand molecular mechanisim of the development of the pedicel tissue providing link between fruit and tree, to reveal the genetic mechanisms allowing metabolites forming as a result of photosynthesis in plant to be carried to the olive tree and to determine genetic factors effective in the event of abscission. Such a study related to the pedicel tissue of olive has not been done before.164.733 reading in total has been obtained as a result of sequencing. Bioinformatics analyses has been made incorporating these readings and the genes obtained were classified and defined.
Benzer Tezler
- Yeni nesil dizileme teknolojisi ile Türkiye'den izole edilen kutanöz leishmaniosis etkeni leishmania infantum'un genom dizisinin çıkarılması
The genome sequencing with next generation sequencing technology of leishmania infantum causing cutaneous leishmaniosis from Turkish isolate
DİLEK GÜLDEMİR
Doktora
Türkçe
2019
MikrobiyolojiAnkara ÜniversitesiParazitoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞE SERPİL NALBANTOĞLU
- Yeni nesil dizileme teknolojisi ile Türkiye'den izole edilen toxoplasma gondii Ankara suşunun genom dizisinin çıkarılması
The genome sequencing with next generation sequencing technology of toxoplasma gondii Ankara strain from turkish isolate
BANUÇİÇEK YÜCESAN
Doktora
Türkçe
2020
ParazitolojiAnkara ÜniversitesiParazitoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞE ÇAKMAK
- Osteogenezis imperfekta hastalarında yeni nesil dizileme teknolojisi ile ilişkili genlerin taranması ve bilinmeyen genlerin araştırılması
Screening of genes associated with osteogenesis imperfecta by next-generation sequencing technology and investigation of unknown genes
LEYLA ELKANOVA
- Nanopore dizileme teknolojisi ile SNP panelinin geliştirilmesi
Development of SNP panel with nanopore sequencing technology
VEYSEL SAPAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Adli Tıpİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaFen Bilimleri Ana Bilim Dalı
DOÇ. ÖZLEM BÜLBÜL ERCAN
- Nörofibromatozis tip1 olgularında NF1 gen mutasyonlarının yeni nesil dizileme teknolojisi ile araştırılması
Investigation of NF1 gene mutations with next generation sequencing technology in neurofibromatosis type1 cases
SHAHRASHOUB SHARIFI