Alt solunum yolu enfeksiyonlarında bakteriyel etkenlerin ve bazı direnç genlerinin polimeraz zincir reaksiyonu ile araştırılması
The investigation of bacterial pathogens and resistance genes in the lower respiratory tract infections BY polymerase chain reaction
- Tez No: 412803
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MEHMET ÖZDEMİR
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Alt solunum yolu, enfeksiyon, multipleks PZR, kültür, Bakteriler, Genler, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Solunum yolları enfeksiyonları, Solunum yolları hastalıkları, İlaçlara direnç, İlaçlara direnç-mikrobiyal, Lower respiratory tract, infection, multipleks PCR, culture, Bacteria, Genes, Polymerase chain reaction, Respiratory tract infections, Respiratory tract diseases, Drug resistance, Drug resistance-microbial
- Yıl: 2013
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Necmettin Erbakan Üniversitesi
- Enstitü: Meram Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Amaç: Alt solunum yolu enfeksiyonu olan hastaların solunum yolu örneklerinde, multipleks PZR ile bakteriyel etkenlerin saptanması, CTX-M, NDM ve mecA direnç genlerinin tespiti ve multipleks PZR'ın etkinliğinin değerlendirilmesi amaçlandı. Yöntem: Eylül 2011-Nisan 2013 tarihleri arasında akut alt solunum yolu enfeksiyonu belirtileri ile Necmettin Erbakan Üniversitesi Meram Tıp Fakültesi Hastanesi ve Konya Numune Hastanesi Göğüs Hastalıkları polikliniklerine başvuran, toplum kaynaklı pnömoni, KOAH alevlenmesi ve bronşiektazi akut alevlenmesi tanısı konulan, ayaktan veya yatırılarak tedavi edilen, 197 hasta çalışmaya alındı. Hastalardan alınan örnekler, eş zamanlı olarak koyun kanlı agar, çikolata agar ve EMB agara ekilerek kültür işlemine alındı. Bakteri tip tanımlaması, Vitek2 (Biomerieux) tam otomatik tanımlama sistemi ile yapıldı. Moleküler olarak bakterilerin amplifikasyonu, deteksiyonu ve direnç genlerinin tespiti moleküler mikrobiyoloji labaratuvarında CAP-Bac-PN Mix (Gen ID®; Autoimmun Diagnostika GmbH, Almanya) kiti kullanılarak yapıldı. Bulgular: Kültür yöntemi ile tüm olguların 62'sinde (% 31,5) en az bir bakteri üremesi saptanırken bu sayı multipleks PZR ile 125'e (%63,5) yükseldi. PZR de en çok saptanan bakteriler sırasıyla; S.pneumoniae (%32), H.influenzae (% 31) oldu. Çoklu etken saptama oranları açısından PZR ile kültür arasında anlamlı farklılık vardı. (p<0.005) Kültürde sadece 2 olguda çoklu bakteri saptanırken, PZR'da 47 olguda çoklu etken saptandı. PZR yöntemi ile CTX-M, NDM ve mecA direnç geni saptanamadı. Sonuç: Alt solunum yolu enfeksiyonlarında; kültür, seroloji gibi konvansiyonel yöntemler etkeni saptamada her zaman yeterli olamamaktadır. Bu nedenle yeni tanı yöntemlerine ihtiyaç duyulmaktadır. Moleküler testlerin hızlı sonuç alınabilen duyarlı testler olması nedeniyle acil ve uygun antimikrobiyal tedavi sağlayarak, antibiyotik direncinde azalmaya katkıda bulunacağı ve daha iyi tedavi yanıtına neden olacağı kanaatine varılmıştır.
Özet (Çeviri)
Objective: It was aimed to determine the bacterial pathogens and CTX-M, NDM, mecA resistance genes by multiplex PCR in the respiratory tract samples of the patients in community acquired lower respiratory tract infections and evaluate the efficiency of multiplex PCR. Results: At least one bacterial growth was determined in 62 (31.5%) of all patients with culture method. This number increased to 125 (63.5%) with multiplex PCR. The bacterie which were most commonly identified by PCR were S. pneumoniae (32%) and H. influenzae (31%). There was a significant difference between PCR and bacterial culture system in terms of multi-factor detection rates (p<0.005). Multiple bacteria were detected only 2 cases in culture method but multiple pathogens were detected in 47 cases with PCR method. CTX-M, NDM and mecA genes were not detected with PCR. Conclusion: Conventional methods, such as culture and serology are not always adequate to detect in lower respiratory tract the pathogens. For this reason, new diagnostic methods such as molecular tests were necessary. Multiplex PCR tests are sensitive and rapid tests. Use of PCR, provide rapid identification of bacteriae and diagnosis of infection. Use of combination of diagnostic tests will be resulted rapid diagnosis and contribute to a reduction in antibiotic resistance.
Benzer Tezler
- 2017-2021 yılları arası Kırıkkale Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları kliniğine başvuran akut gastroenterit tanısı alan 1 ay-18 yaş arası çocukların klinik, laboratuvar ve demografik özellikleri
Clinical, laboratory and demographic features of children between 1 month-18 years, diagnosed with acute gastroenteritis, applying to Kirikkale University Medical Faculty Hospital Pediatric Health and Diseases clinic between 2017-2021
GÜLNARA KİBAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıKırıkkale ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYŞEGÜL ALPCAN
- Tekrarlayan hışıltılı süt çocuklarında mycoplasma pneumoniae ve clamidia pneumoniae etkenlerinin sıklığı ve atopi ilişkisi
Infants with recurrent wheezing prevalence and atopy association of mycoplasma pneumoniae and chlamydia pneumoniae infections
GÜLÇİN BOZAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıEskişehir Osmangazi ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KORAY HARMANCI
- Effüzyonlu otitis media etyolojisinde chlamydia pneumoniae ve mycoplasma pneumoniaenın yeri
Chlamydia pneumoniae and mycoplasma pneumoniae in etiology of otitis media with effusion
ZAHİDE ÇİLER TEZCAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2007
Kulak Burun ve BoğazAnkara ÜniversitesiKulak Burun Boğaz Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA R. SAATÇİ
- Mikoplazma ve/veya klamidya seropozitif akciğer infeksiyonu olan 1-6 yaş arası çocuklarda klinik, laboratuvar ve radyolojik bulguların retrospektif incelenmesi
Retrospective evaluation of clinical, laboratory and radiological findings in mycoplasma and/or chlamydia seropositive 1-6 years old children with pulmonary infection
MEHMET EMRE SELVİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2014
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıDokuz Eylül ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖZDEN ANAL
- Solunum yolu enfeksiyonu ile yatan iki yaş altı çocuk hastalarda multipleks PCR ile saptanan viral ve bakteriyel etkenlerin klinik bulgular üzerine etkisinin karşılaştırılması
Comparison of the clinical impact of viral and bacterial pathogens detected by multiplex PCR in children under two years hospitalized with respiratory tract infections
EZGİ ÖZDEN ÇİFTÇİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSağlık Bilimleri ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖZLEM SANCAKLI