Klinik örneklerden izole edilen çoklu ilaç dirençli acinetobacter baumannii kökenlerinde karbapenem direnç mekanizmalarının araştırılması
Investigation of carbapenem resistance mechanisms in multi drug resistant clinical isolates of acinetobacter baumannii
- Tez No: 419994
- Danışmanlar: PROF. DR. MÜNEVVER UFUK HASDEMİR
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları, Clinical Microbiology and Infectious Diseases
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2016
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Marmara Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 68
Özet
Amaç: Hastanemiz Yoğun Bakım Ünitesinde yatan hastaların klinik örneklerinden izole edilen çoklu ilaç dirençli Acinetobacter baumannii kökenlerinde karbapenem direnç mekanizmalarını araştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: İlk olarak kökenlerin karbapenemlere dirençli oldukları disk difüzyon testi ile doğrulanmıştır. Direncin temel sebebi olan karbapenemazların (oxa, imp, vim, nmp) varlığı her gene özgü PZT ile gösterilmiştir. Efluks pompa inhibitörleri (NMP, CCCP) varlığında ve yokluğunda tekrarlanan sıvı mikrodilüsyon yöntemi ile, epi varlığında daha düşük MİK değeri saptanan kökenlerde efluks pompalarının dirençteki etkisi ortaya koyulmuştur. Kökenler arasındaki klonal ilişkinin saptanması açısından REP-PZT kullanılmıştır. Bulgular ve Sonuçlar: Karbapenem dirençli 22 A.baumannii kökenini dahil ettiğimiz çalışmada karbapenemaz genlerinin varlığı oxa-51 (%100), oxa-23 (%78.3), oxa-58 (%21.7), ndm (%13.0), oxa-24 (%8.7) ve imp (%8.7) olarak saptanmıştır. Üç ana klonda toplanan kökenlerde efluks pompa inhibitörünün etkisi yalnızca A klonundaki 6 kökende (% 27.3) gözlenmiştir. oxa-23 enzimi de taşıyan bu kökenlerde, genin düşük ekspresyonu nedeniyle dirence neden olan ana mekanizmanın efluks olduğunu kuvvetle işaret etmektedir. Efluks varlığının fenotipik olarak gösterilemediği diğer kökenlerde (16, % 72.7) ise enzim varlığının tek başına, ya da CarO porininde meydana gelen bir değişiklikle birlikte, direnç gelişimine yol açtığı düşünülmektedir.
Özet (Çeviri)
Aim: We aimed to investigate the carbapenem resistance mechanisms of Acinetobacter baumannii isolated from clinical samples of ICU patients in our hospital. Material and Methods: First of all, carbapenem resistance is confirmed by disk diffusion method. Major cause of the resistance, carbapenemases (oxa, imp, vim, nmp), is investigated by PCR. The decrease of antibiotic MIC values with the presence of efflux pump inhibitors (NMP, CCCP), pointed out the efflux pumps contribute in the resistance. REP-PCR is performed in oder to demonstrate clonal resistance between clinical isolates. Results and Conclusion: Our study included 22 carbapenem resistant A.baumannii isolates harboring carbapenemase genes oxa-51 (%100), oxa-23 (%78.3), oxa-58 (%21.7), ndm (%13.0), oxa-24 (%8.7) and imp (%8.7). REP-PCR showed that the isolates gathered in 3 main clones. The effect of efflux pump inhibitors are detected in 6 isolates (%27.3) belonging to the clone A only. All of these 6 isolates carrying also oxa-23, led us think that the main mechanism of the resistance is efflux of the antibiotic because of decreased expression of the enzyme. We assume in the rest of the isolates (16, % 72.7) gain resistance due to the presence of the carbapenemases with or without the CarO porin modification.
Benzer Tezler
- Yoğun bakım hastalarından ve yoğun bakım ünitesi ortamından izole edilen acinetobacter suşlarının genotipik olarak karşılaştırılması
Comparıson as genotypıc acınetobacter straıns that were ısolated from ıntensıve care unıt and ıntensıve care patients
ESRA KIRKGÖZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
MikrobiyolojiGaziantep ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YASEMİN ZER
- Çoklu ilaç dirençli acınetobacter baumannıı suşlarında çeşitli antibiyotik kombinasyonlarının ın-vıtro etkinliği
In-vitro effect of various antimicrobials in combination against multidrug-resistant acinetobacter baumannii
RIDVAN GÜÇKAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
MikrobiyolojiCelal Bayar ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEMRA KURUTEPE
- Acınetobacter baumannii izolatlarında çeşitli antibiyotik kombinasyonlarının sinerjistik etkisinin dama tahtası yöntemiyle araştırılması
Investigation of the synergistic effects of various antibiotic combinations in acinetobacter baumannii isolates using the checkerboard method
NİLGÜN ONGUN
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
MikrobiyolojiAbant İzzet Baysal ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FIRAT ZAFER MENGELOĞLU
- Klinik örneklerden izole edilen çoklu ilaç dirençli Acinetobacter baumannii suşlarında bazı karbapenemazların genotipik yöntemlerle araştırılması
Investigation of some carbapenemases by genotypic methods in multi-drug resistant Acinetobacter baumannii strains isolated from clinical specimens
NİDA ÖZCAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
MikrobiyolojiDicle ÜniversitesiTemel Tıp Bilimleri Bölümü
PROF. DR. KADRİ GÜL
- Klinik örneklerden izole edilen acinetobacter izolatlarında metallobetalaktamaz varlığının fenotipik ve genotipik yöntemlerle belirlenmesi
Phenotypic And Genotypic Determination Of Metallo Beta Lactamases In Acinetobacter Isolates Isolated From Clinical Samples
FERHAN KORKMAZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2018
MikrobiyolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ASUMAN BİRİNCİ