Escherichia coli klinik izolatlarında plazmid aracılı florokinolon direnci
Plasmi̇d-medi̇ated fluoroqui̇nolone resi̇stance i̇n cli̇ni̇cal i̇solates of escheri̇chi̇a coli̇
- Tez No: 422865
- Danışmanlar: PROF. DR. DUYGU FINDIK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Escherichia coli, plazmid, kinolon, plazmid aracılı direnç, qnr, qepA, aac (6')-1b-cr, Escherichia coli, quinolone, plasmid-mediated resistance, qnr, qepA, aac (6')-1b-cr
- Yıl: 2015
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Selçuk Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 93
Özet
Arkaplan: Escherichia coli insanların normal bağırsak florasında bulunan ve birçok doku ve organda çeşitli enfeksiyonlara neden olabilen fırsatçı bir patojendir. Kinolonların son yıllarda yaygın olarak kullanılmaları nedeniyle bu türler arasında bu antibiyotiğe karşı direnç giderek artmaktadır. Kinolonlara karşı direnç gelişimi, genellikle kromozomlarla kodlanan topoizomeraz ve efflux pump genlerindeki mutasyonlara, porin kaybına ve plasmid aracılı qnr, aac (6')-Ib-cr ve qepA gen transferine bağlı olarak gelişmektedir. Bu çalışmanın amacı, kinolon dirençli E.coli klinik izolatlarında plazmid aracılı kinolon direnç genlerinin varlığını araştırmaktır. Yöntem: Çalışmaya, Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji Laboratuvarında çeşitli klinik örneklerden izole edilen toplam 115 kinolon dirençli E. coli suşları alındı. qnrA, qnB, qnrC, qnrS, qepA, and aac (6')-1b-cr genleri polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile araştırıldı. Tüm aac (6')-1b-cr varyantını tanımlamak için aac (6')-1b pozitif amplikonlar BseGI restriksiyon enzimiyle kesilerek araştırılmıştır. Bulgular: 115 kinolon dirençli E.coli suşları arasında, qnrA, qnrC ve qepA genleri tespit edilmedi, bu suşların üçünde (% 2.6) qnrB, dokuzunda (% 7.8) qnrS ve ellisinde (% 43.5) aac (6')-1b-cr genleri pozitif bulundu. Sonuç olarak tez projemizde, Konya şehrinde izole edilen E. coli klinik suşlarında yüksek kinolon direncinden, aac (6 ')-1b-cr geninin sorumlu olduğu belirlendi. Bunun yanında, QnrB ve qnrS gen sıklığı düşük olarak tespit edildi ancak qnrA, qneC ve qepA genleri tespit edilemedi.
Özet (Çeviri)
Background: Escherichia coli is found in the normal intestinal flora of humans and cause various infectionsin many tissues and organs. Because quinolones are widely used in recent years, the resistance has been increasing among this species. Bacterial resistance to quinolones usually results from mutations in the topoisomerase genes encoded chromosomally and also the expression of efflux pumps, loss of porines and the transfer of plasmid-mediated genes namely qnr, aac (6')-Ib-cr, and qepA.The aim of this study was to investigate the presence of plasmid-mediated quinolone resistance genes in E.coli clinical isolates. Methods: A total of 115 quinolone-resistant E. coli strainsisolated from various clinical specimens in Selcuk University, Microbiology Laboratory of Medical Faculty were included in the study. qnrA, qnrB, qnrC, qnrS, qepA, and aac (6')-1b-cr genes were investigated by polymerase chain reaction (PZR). All aac (6')-1b positive amplicons were analyzed by digestion with BseGI restriction enzyme to identify aac (6')-1b-cr variant. Results: Among 115 quinolone-resistant E. coli strains, none of themharboured qnrA, qnrC and qepA genes, however qnrB, qnrS and aac (6')-1b-cr were positive in three (2.6%), nine (7.8%) and 50 (43.5%) strains, respectively. Conclusion: In conclusion, we determined that aac (6')-1b-crgene was responsible for high quinolone resistance in clinical strains of E. coli from Konya, Turkey. The prevalence of qnrB and qnrS genes were low and qnrA, qnrC and qepA genes were not detected.
Benzer Tezler
- Escherichia coli ve Klebsiella spp. klinik izolatlarında plazmid aracılı AmpC beta-laktamaz tespiti
Detection of plasmid mediated AmpC beta-lactamase in clinical isolates of Escherichia coli ve Klebsiella spp.
SİBEL AK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2008
MikrobiyolojiHacettepe ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BURÇİN ŞENER
- Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Klinik İzolatlarında Plazmid Aracılı AmpC Beta- Laktamaz Tespiti
Detection of AmpC Beta-Lactamases in Clinical Isolates of Ecsherichia coli and Klebsiella pneumoniae
SERPİL COŞKUN
Doktora
Türkçe
2011
MikrobiyolojiAnkara ÜniversitesiFarmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NURTEN ALTANLAR
- Kinolon dirençli escherichia colı klinik izolatlarında plazmidik direnç mekanizmalarının araştırılması
Investigation of plasmid-mediated resistance mechanisms in quinolone resistant clinical escherichia coli isolates
PINAR AKÇAY ÖZLÜER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
MikrobiyolojiAdnan Menderes ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MURAT TELLİ
- Sefoksitin Dirençli ya da Az Duyarlı Saptanan Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli ve Proteus mirabilis Suşlarındaki Plazmid Aracılı AmpC Beta Laktamaz Enzim Tiplerinin PCR Yöntemi ve Dizi Analizi ile Araştırılması
Detection of Plasmid-Borne AmpC Beta Lactamase Enzyme Types in Cefoxitin Resistant or Intermediate Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli and Proteus mirabilis Isolates by using Multiplex PCR and Sequencing
HADİYE DEMİRBAKAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2007
MikrobiyolojiAkdeniz ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MERAL DİLARA ÖĞÜNÇ
- Kan kültürlerinden izole edilmiş kinolon dirençli escherichia coli ve klebsiella spp. izolatlarında plazmid aracılı kinolon direncinin araştırılması
Investigation of plasmid-mediated quinolone resistance among quinolone-resistant isolates of escherichia coli and klebsiella spp. isolated from blood cultures
HİKMET ÖZTEL OCAK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2014
MikrobiyolojiKaradeniz Teknik ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FARUK AYDIN