Geri Dön

Rubus idaeus L. (ahududu) ve Punica granatum L. (nar) meyvelerinden izole edilen maya türlerinin moleküler düzeyde tanımlanması ve hücre dışı enzim aktivitelerinin belirlenmesi

Molecular identification of yeast species that isolated from Punica granatum L. (pomegranate) and Rubus idaeus L. (raspberry) and determination of extracell ular enzyme activities

  1. Tez No: 424065
  2. Yazar: MELİH GÜNAY
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. TÜLAY TURGUT GENÇ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2015
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 140

Özet

Maya türlerinin tanımlanmasında kullanılan geleneksel tanımlama yöntemleri ve kit sistemlerinin yanında moleküler tanımlama yöntemleri de kullanılmaktadır. Araştırma kapsamında nar meyvesinin yüzey maya florası ile ahududu meyvesinin barındırdığı maya florası maya suşlarının morfolojik özellikleri, API ID32C kit sistemi ve moleküler identifikasyon yöntemleri kullanılarak belirlenmesi ve endüstriyel öneme sahip enzim üretebilen maya türlerinin tespit edilmesi planlandı. Maya suşlarının genomik DNA izolasyonlarının ardından ITS1-5.8S rDNA-ITS2 bölgesi ITS1 ve ITS4 evrensel primerleri kullanılarak PCR yöntemiyle çoğaltıldı. PCR ürünlerine göre oluşturulan gruplara ait maya suşlarının ITS1-5.8S rDNA-ITS2 bölgeleri beş farklı restriksiyon enzimi (HinfI, HaeIII, MspI, AluI ve HhaI) kullanılarak kesimleri yapıldı. PCR grupları içinde farklılık gösteren maya suşları seçilerek DNA dizi analizi yapıldı ve BLAST programı kullanılarak maya türleri tanımlandı. Tanımlanan türlerin hücre dışı enzim aktiviteleri API-ZYM test sistemi kullanarak belirlendi. Çalışmamızın sonucunda, maya suşlarının DNA dizi analizlerine göre nar meyvesi yüzeyinden izole edilen maya suşları Metschnikowia pulcherrima, Cryptococcus bestiolae, Aureobasidium pullulans, Candida zeylanoides, Hanseniaspora uvarum, Kluyveromyces lactis ve Metschnikowia sp. türleriyle, ahududu meyvesinden izole edilen maya suşları ise M. pulcherrima, A. pullulans, Candida sp., H. uvarum ve Metschnikowia sp. türleriyle yüksek homoloji gösterdi. API-ZYM test sistemi sonucuna göre nar meyvesinden izole edilen maya türlerinin alkalin fosfataz, lösin arilamidaz, esteraz (C 4), esteraz lipaz (C 8), asit fosfataz, naftol-AS-BI-fosfohidrolaz enzimlerinin; ahududu meyvesinden izole edilen maya türlerinde ise Lösin arilamidaz ve β- Glukosidaz enzimlerinin yüksek aktivite gösterdiği belirlendi.

Özet (Çeviri)

Moleculer identification methods beside the conventional identification methods and kit systems using for identification of yeast species have also been using recently. As a part of research, determination of yeast flora on pomegranate surface and raspberry fruits were planned using morphologic features of yeast strains, API ID32C kit system and molecular identification methods and determination of yeast species that can produce industrial importance enzymes were aimed. After genomic DNA isolation from yeast strains, ITS1-5.8S rDNA-ITS2 gene regions were amplified by PCR method using ITS1 and ITS4 universal primer. The groups obtained from the size of PCR products that belongs to yeast strains were cut by using restriction enzymes (HinfI, HaeIII, MspI, AluI ve HhaI). The yeast strains which differ in PCR groups were selected as restriction profile and DNA sequence analysis were carried out and yeast strains were identified using DNA sequences by BLAST program. Extracellular enzyme activities were determined of identified yeast species by API-ZYM test system. Consequence of my study, according to DNA sequence analysis of the pomegranate yeast strains showed high homology with Metschnikowia pulcherrima, Cryptococcus bestiolae, Aureobasidium pullulans, Candida zeylanoides, Hanseniaspora uvarum, Kluyveromyces lactis and Metschnikowia sp. species. Raspberry yeast strains showed high homology M. pulcherrima, A. pullulans, Candida sp. H. uvarum ve Metschnikowia sp. species. According to API-ZYM results, high enzyme activity were determined for pomegranate in alkaline phosphatase, leucine arylamidase, esterase (C 4), esterase lipase (C 8), acid phosphatase, naftol-AS-BI-fosfohidrolase enzymes, were determinated for raspberry yeast strains in leucine arylamydase and β- glukosidase enzymes.

Benzer Tezler

  1. Türkiye'de ahududu (Rubus idaeus L.) ve böğürtlen (Rubus fruticosus L.) yetiştirilen bazı bahçelerde bitki paraziti nematod türleri üzerinde faunistik ve sistematik araştırmalar

    Faunistic and systematic investigations on the species of plant parasitic nematodes in raspberry (Rubus idaeus L.) and blackberry (Rubus fruticosus L.) in some orchards in Turkey

    SELDA ÇALIŞKAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    ZiraatTokat Gaziosmanpaşa Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İLKER KEPENEKCİ

  2. Bursa'da yetiştirilen bazı ahududu (Rubus idaeus L.) ve böğürtlen (Rubus fruticosus L.) çeşitlerinin fenolik bileşiklerinin sıvı kromatografisi kütle spektrometresi (LC-MS) ile incelenmesi ve antioksidan aktivite tayinleri

    Determination of phenolic compounds by liquid chromatography and mass spectrometry and antioxidant activity of some of raspberry (Rubus idaeus L.) and blackberry (Rubus fruticosus L.) cultivars grown in Bursa

    ESRA SARIBURUN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    KimyaUludağ Üniversitesi

    Kimya Bölümü

    PROF. DR. CEVDET DEMİR

  3. Yaban mersini (Vaccinium myrtillus L.) ve Ahududu (Rubus idaeus L.) bitkilerinden elde edilen sıvı ekstraktların insan lenfosit kültüründe mitomisin C'ye karşı kromozomlar ve hücre bölünme mekanizması üzerine antimutajenik etkilerinin araştırılması

    The investigation of the antimutagenic effects on chromosomes and cell division mechanisms against mitomycine C in human lymphocyte culture of liquid extracts obtained from blueberry (Vaccinium myrtillus L.) and raspberry (Rubus idaeus L.)

    MÜGE MAVİOĞLU KAYA

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Beslenme ve DiyetetikKafkas Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SÜLEYMAN GÜL

  4. Bazı ahududu (Rubus idaeus L.) çeşitlerinde farklı hormon uygulamalarının fenolojik ve pomolojik özelliklerine etkileri

    The effects of different hormone applications on the phenological and pomological properties of some raspberry (Rubus idaeus L.) varieties

    BÜŞRA SAĞLAM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    ZiraatUşak Üniversitesi

    Tarım Bilimleri Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ AYŞEN MELDA ÇOLAK

  5. A Study on adaptation of some raspberry (R. idaeus L.) cultivars in Tokat province

    Bazı ahududu (Rubus idaeus L.) çeşitlerinin Tokat yöresine adaptasyonu üzerine bir araştırma

    ZEYNEP ÖZDEMİR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2001

    ZiraatGaziosmanpaşa Üniversitesi

    Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. RESUL GERÇEKÇİOĞLU