Natural language processing for mining neuroanatomical relations among brain regions
Doğal dil işleme kullanılarak beyin bölümleri arasındaki ilişkiler için metin madenciliği
- Tez No: 433935
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. ARZUCAN ÖZGÜR TÜRKMEN, PROF. DR. REŞİT ŞAHİN CANBEYLİ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol, Computer Engineering and Computer Science and Control
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2016
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Beynin çalışma şeklini daha iyi anlayabilmek için beynin bölümleri arasındaki ilişkileri anlamak çok önemlidir. Beynin her bir bölümü birbiri ile kimyasal veya fonksiyonel etkileşim halindedir ve bu etkileşimleri inceleyen çok fazla sayıda çalışma bulunmaktadır. Bu çalışmalarda yer alan beyin bölümleri arasındaki ilişkiler, çevrimiçi erişilebilir yayınlanmış makalelerde yer almaktadır. Metin madenciliği teknikleri kullanılarak özellikli ilişkilerin çıkartılması bize ilişkiler hakkındaki büyük resmi görmemiz konusunda yardımcı olmaktadır. Biz de bu çalışmamızda, doğal dil işleme (NLP) teknikleri kullanarak beynin bölümleri arasındaki ilişkileri yayınlanmış makalelerden çıkartmayı hedeflemekteyiz. Çalışmamızda“Paraventricular Thalamic Nucleus (PVT)”adı verilen beyin bölümünün ilişkileri üzerinde yoğunlaşıyoruz. Dilbilimsel bir yaklaşımla, örüntülere bağlı olarak ilişkilerin yer aldığı cümleler seçilerek, daha sonrasında bu cümleler üzerinde bağlılık ayrıştırıcı ve öğe ayrıştırıcı kullanılarak ilgili beyin bölümleri ve birbirleriyle ilişkileri çıkartılmıştır. Çalışmamızda, ilişkilerin yanısıra bu ilişkilerin yönü de tayin edilerek beyin bölümlerinin birbiriyle bağlantılarını gösteren bir bağlantı grafiği sunulmaktadır. Geliştirdiğimiz sistem, Whitetext projesinin derlemi üzerinde değerlendirildikten sonra aynı metodlar PVT beyin bölümünün bağlantı grafiğini çıkartma ve analiz etme konularında kullanılmaktadır. PVT, uyarılma, isteklendirme, ilaç arama davranışı ve dikkat gibi çok sayıda işlev üzerinde etkisi olduğu inanılan önemli bir beyin bölümüdür. Çalışmamızın sonuçlarının göstereceği üzere PVT beyin bölümü davranış değerlendirmesi konusunda yeni bir araştırma odağı olabilir.
Özet (Çeviri)
Identifying the relations among different regions of the brain is vital for a better understanding of how the brain functions. While a large number of studies have investigated the neuroanatomical and neurochemical connections among brain structures, their specific findings are found in publications scattered over a large number of years and different types of publications. Text mining techniques have provided the means to extract specific types of information from a large number of publications with the aim of presenting a larger, if not necessarily an exhaustive picture. By using natural language processing techniques, the present study aims to identify relations among brain regions in general and relations relevant to the paraventricular nucleus of the thalamus (PVT) in particular. We introduce a linguistically motivated approach based on patterns defined over the constituency and dependency parse trees of sentences. Besides the presence of a relation between a pair of brain regions, the proposed method also identifies the directionality of the relation, which enables the creation and analysis of a directional brain region connectivity graph. The approach is evaluated over the manually annotated data sets of the WhiteText Project. In addition, as a case study, the method is applied to extract and analyze the connectivity graph of PVT, which is an important brain region that is considered to influence many functions ranging from arousal, motivation, and drug-seeking behavior to attention. The results of the PVT connectivity graph show that PVT may be a new target of research in mood assessment.
Benzer Tezler
- Purification of bacteriorhodopsin from halobacterium halobium and reconstitution studies in liposomes
Başlık çevirisi yok
M.BAKER ZABUT
Yüksek Lisans
İngilizce
1987
BiyokimyaOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MERAL YÜCEL
- Çukurova bölgesinde biyoklimatik veriler kullanılarak açık ve yeşil alan sistemlerinin belirlenmesi ilkeleri üzerinde bir araştırma
A research on the determination of the principles in open and green spaces systems by using the bioclimatic data in Çukurova region
MEHMET FARUK ALTUNKASA
Doktora
Türkçe
1987
Çevre MühendisliğiÇukurova ÜniversitesiPeyzaj Mimarlığı Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ERDOĞAN GÜLTEKİN
- Çiğit ve ayçiçek yağlarının doğal antioksidan içerikleri ile bu yağların stabilitelerinin arttırılmaları üzerinde araştırmalar
Başlık çevirisi yok
ALİ KEMAL YALNIZ
Doktora
Türkçe
1985
Gıda MühendisliğiEge ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MAHİR ÇOLAKO¦LU
- Geleneksel Beypazarı konutlarında baş odanın günümüz ihtiyaçlarını karşılayacak düzende donatılması
The Redecoration of the“Baş Oda”in Beypazarı traditional houses according to our today's needs
AYNUR ÖZMEN
Yüksek Lisans
Türkçe
1987
MimarlıkGazi ÜniversitesiBina Bilgisi (mimari Tasarım) Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUAMMER HACIBALOĞLU
- Antakya tarihi ticaret merkezi mekansal yapı değişim ve gelişim sürecinin kent ticaret merkezi planlamasına etkinliği
The Effectiveness of spatial structural chance and development period of the historical trade center of Antakya in the urban trade planning
NEVİN TURGUT
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
Şehircilik ve Bölge PlanlamaGazi ÜniversitesiŞehir ve Bölge Planlama Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. NURCAN UYDAŞ