Met-Tyr dipeptidinin konformasyon analizi ve kuantum kimyasal yöntemleri ile titreşim frekans ve kiplerinin incelenmesi
Conformational analysis of Met-Tyr dipeptide and investigation of its vibrational frequencies and modes with quantum chemical studies
- Tez No: 444165
- Danışmanlar: PROF. DR. AYŞEN ERBÖLÜKBAŞ ÖZEL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Fizik ve Fizik Mühendisliği, Physics and Physics Engineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2016
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fizik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Atom ve Molekül Fiziği Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 78
Özet
Bu tez çalışmasında Metionin ve Tirozin amino asitlerinden oluşan Met-Tyr dipeptidinin yapısal ve titreşimsel özellikleri teorik ve deneysel moleküler spektroskopik yöntemler ile incelenmiştir. Çalışmanın teorik kısmında, bir potansiyel enerji yüzey taraması ile, Met-Tyr dipeptidinin teorik olarak mümkün olan kararlı konformasyonları araştırılmış ve belirlenen en kararlı konformere ait optimize edilmiş denge durumu geometrik parametreleri hesaplanmıştır. Ardından, bu en kararlı konformerin titreşim modlarına ait dalgasayıları, Kırmızıaltı (IR) ve Raman şiddetleri hesaplanmıştır. Gaussian03 paket programı kullanılarak gerçekleştiren bu hesaplamalarda Yoğunluk Fonksiyonu Teorisi (DFT)'ne dayalı B3LYP metodu kullanılmıştır. Çalışmanın deneysel kısmında Met-Tyr dipeptidinin Kırmızıaltı ve Raman spektrumları, Jasco300 FT-IR and Micro Raman NRS3100 model dispersif mikro Raman spektrometreler kullanılarak, oda sıcaklığında kaydedilmiştir. Çalışmanın son bölümünde ise molekülün hesaplanan titreşimsel spektral verileri onun kaydedilen deneysel IR ve Raman spektrumlarından elde edilenler ile karşılaştırıldı ve ardından gözlenen temel titreşimsel bandların işaretlemeleri molekülün titreşimsel modları için hesaplanan Potansiyel Enerji Dağılımı (PED) değerleri baz alınarak gerçekleştirilmiştir.
Özet (Çeviri)
In this thesis study, the structural and vibrational properties of Met-Tyr dipeptide, which consists of methionine and tyrosine amino acids, have been investigated by using the theoretical and experimental methods in molecular spectroscopy. In the theoretical part of the study, the possible conformers of Met-Tyr dipeptide were searched by means of potential energy surface. Afterwards, the optimized equilibrium geometry parameters of the most stable conformers of the molecule and the corresponding wavenumbers, IR and Raman intensities of the vibrational modes were calculated. These calculations which were carried out using Gaussian03 software with B3LYP method based on the Density Functional Theory was used. In the experimental part of the study, the Infrared (IR) and Raman spectra were recorded at room temperature using Jasco 300 model FT-IR and NRS3100 model dispersive micro Raman spectrometers. In the final section of the study, the calculated vibrational spectral data of the molecule were compared with those obtained from its recorded experimental IR and Raman spectra and then the observed fundamental vibrational bands were assigned on the basis of the calculated potantial energy distribution (PED).
Benzer Tezler
- Cholecystokinin'in (CCK-8) Tc-99M ile işaretlenmesi ve radyofarmasötik potansiyelinin incelenmesi
Labeling of cholecystokinin (CCK-8) with Tc-99M and investigation of its radiopharmaceutical potential
TÜRKAN ERTAY
Yüksek Lisans
Türkçe
2000
Nükleer MühendislikEge ÜniversitesiNükleer Bilimler Ana Bilim Dalı
PROF. DR. PERİHAN ÜNAK
- Farklı ticari rennetler ile üretilen beyaz peynirlerde uçucu bileşenler ve serbest amino asitlerin belirlenmesi
Determination of free amino acids and volatile compunds in white cheeses produced by the different types of rennet
GİZEM SÜNER
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
Gıda MühendisliğiHatay Mustafa Kemal ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEHRA GÜLER
- Determınatıon of proteın qualıty of foods ın turkomp natıonal food database and evaluatıon ın terms of adult nutrıtıon
Türkomp ulusal gıda veri tabanındaki gıdaların protein kalitesinin belirlenmesi ve yetişkin beslenmesi açısından değerlendirilmesi
MERYEM BAYRAKDAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
Beslenme ve DiyetetikBayburt ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ENGİN ŞAHİN
DR. ÖĞR. ÜYESİ TAYYİBE ERTEN
- Hipoksik iskemik ensefalopati ve hipoglisemide eksitatuar aminoasitlerin ve n-methyl-d aspartat reseptörünün rolü
The Role of excitatory amino acids and n methyl d-aspartate receptor in hypoxic ischemic encephalopathy and hypoglycemia
YUSUF ZİYA ARAL
- Bazı tı̇osemı̇karbazon ve kumarı̇n bı̇leşı̇klerı̇nı̇n 6PGD ve G6PD enzı̇m aktı̇vı̇telerı̇ üzerı̇ne etkı̇lerı̇nı̇n ı̇n vı̇tro ve sı̇lı̇ko olarak araştırılması
Investigation of the effects of some thiosemicarbazone and coumarin compounds on 6PGD and G6PD enzyme activities in vitro and in silico
ANAS HAMEED MEZHER MEZHER