Türkiye Pyrus L. (rosaceae) cinsinin taksonomik revizyonu ve moleküler filogenisi
A taxonomic revision and molecular phylogeny of the genus Pyrus L. (rosaceae) in Turkey
- Tez No: 444599
- Danışmanlar: PROF. DR. ALİ ASLAN DÖNMEZ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2016
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 218
Özet
Bu tez çalışması Türkiye'de yetişen Pyrus L. cinsine ait türlerin taksonomik revizyonunu ve moleküler filogenisini içermektedir. Bu çalışmada kullanılan örnekler Türkiye, Gürcistan ve Azerbaycan'dan toplanan bitkiler ile yurtiçi ve yutdışındaki herbaryumlarda incelenen örneklerden oluşmaktadır. Cinsin taksonomisi morfoloji, numerik taksonomi, yaprak ve meyve anatomisi ve moleküler çalışmalarla elde edilen veriler ışığında yeniden düzenlenmiştir. Tüm örnekler morfolojik olarak incelenmiş, tohum ve polen morfolojisi ışık mikroskobu ve SEM altında ayrıntılı olarak çalışılmıştır. Belirlenen tüm morfolojik karakterler sayısallaştırılarak analiz edilmiştir. Moleküler filogeni çalışmasında, kloroplasttan trnH-rpl2, psbA-trnH, rpl20-rps12 ara bölgeleri ile çekirdekteki LFY2intron2 bölgelerinin baz dizilimi kullanılmıştır. Dizilim verileri Maximum Likelihood ve Bayesian analiz yöntemleriyle değerlendirilmiştir. P. elaeagrifolia ve yakın taksonlarının akrabalık ilişkileri ise son zamanlarda geliştirilen ve Yeni Nesil Dizileme Yöntemleri'nden biri olan ddRADseq yöntemiyle araştırılmıştır. Bu revizyon çalışmasıyla Türkiye'deki Pyrus cinsi, sect. Pyrus ve sect. Pashia altında 16 tür (21 takson) olarak kabul edilmiştir. Pyrus demetrii, P. georgica, P. pyraster ve P. pseudosyrica'nın Türkiye için yeni kayıt olduğu belirlenmiştir. Bunlardan P. georgica ve P. demetrii için lektotip seçilmiş, P. pseudosyriaca türü yeni kombinasyon ve statü değişikliği ile P. syriaca altında varyete olarak kabul edilmiştir. P. hakkiarica, P. yaltirikii, P. salicifolia var. serrulata, P. amygdaliformis var. lanceolata ve P. balansae taksonları sinonim edilmiştir. Daha önceden P. elaeagrifolia'nın alttürü yapılan P. kotschyana yeniden tür seviyesine çıkarılmıştır. P. elaeagrifolia'nın sinonimi olarak kabul edilen P. taochia için yeni kombinasyon ve statü değişikliği yapılarak bu türe alttür olarak bağlanmıştır. P. turcicus morfolojik ve ddRADseq verilerine göre yeni tür olarak tanımlanmıştır. Türkiye'deki Pyrus türleri için teşhis anahtarı hazırlanmış, türlerin ayrıntılı betimleri yapılmıştır. Ayrıca taksonların arazi fotoğrafları, Türkiye yayılış haritaları, tehlike kategorileri, habitat ve fenoloji bilgileri ile eğer varsa yerel isimleri verilmiştir.
Özet (Çeviri)
This thesis includes taxonomic revision and molecular phylogeny of plants growing in Turkey belongs to genus Pyrus L. Plant collections come from field trips in mainly Turkey, Georgia and Azerbaijan along with herbarium samples in related herbaria. Taxonomy of the genus is a re-circumscribed in lights of morphology, numerical taxonomy, anatomy and molecular data. All samples are examined morphologically, particularly seed and pollen morphology are studied in detail using light and SEM microscopy. All morphological characters are evaluated numerical taxonomy methods. trnH-rpl2, psbA-trnH, rpl20-rps12 gene regions come from chloroplast and LFY2intron2 from nuclear region are used for molecular phylogeny studies. Maximum Likelihood and Bayesian inference are runned for DNA data. Relationship of Pyrus elaeagrifolia and related taxa are searched using ddRADseq method which is one of newly develop methods of Next generation Sequencing. In the revision of the genus leads to the recognition of 16 species (21 taxa) in two section: sect. Pashia ve sect. Pyrus. Pyrus demetrii, P. georgica, P. pyraster and P. pseudosyrica are idetified as a new record for Flora of Turkey. Among them P. georgica ve P. demetrii are lectotipified properly and P. pseudosyriaca is accepted under the variety of P. syriaca with new combination and status. P. hakkiarica, P. yaltirikii, P. salicifolia var. serrulata, P. amygdaliformis var. lanceolata and P. balansae are proposed as a new synonym. Pyrus kotschyana which was cited under P. elaeagrifolia formerly, is rised up to species level again. P. taochia is accepted as a new subspecies of P. elaeagrifolia with new combination and status. A new species of Pyrus is described based on morphology and ddRADseq data. Identification key is present for the Turkish Pyrus taxa, and morphological descriptions are avaliable for all taxa. This work also includes pictures, threat category, habitat and phenology information and vernacular names –if available- of taxa.
Benzer Tezler
- Bursa ili armut bahçelerinde cacopsylla pyri (L.) (Hemiptera:Psyllidae)'nin yayılış alanı ile doğal düşmanlarının belirlenmesi
Determination of distribution area and natural enemies of cacopsylla pyri (L.) (Hemiptera: Psyllidae) in pear orchards of bursa province
NİDA KÜLCÜOĞLU
- Karyağdı armut (Pyrus communis L.) çeşidinde yapraktan protein ve kalsiyum uygulamalarının hasat önü dökümü ve meyve kalitesine etkilerinin belirlenmesi
Determination of the effects of leaf protein and calciumapplications on pre-harvest and fruit quality in karyagdı pear (Pyrus communis L.) cultivar
RÜVEYDA BASIM
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
ZiraatAkdeniz ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SADİYE GÖZLEKÇİ
- Armutta melezleme yoluyla ateş yanıklığına (Erwinia amylovora) dayanıklılık konusunda elde edilen F1 melez populasyonunun fenolojik ve meyve özelliklerinin belirlenmesi
Determination of phenological and fruit features of F1 hybrid pear (Pyrus communis L.) population in terms of fire blight (Erwinia amylovora) resistance
KEREM MERTOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
ZiraatEskişehir Osmangazi ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YASEMİN EVRENOSOĞLU
- Ankara ilinde armut (Pyrus communis L.) bahçelerinde bulunan Tylenchida (Nematoda) türleri üzerinde faunistik ve taksonomik araştırmalar
Faunistik and taxonomic investigations on the species of Tylenchida (Nematoda) in the pear (Pyrus communis L.) orchards in Ankara district
EMRE EVLİCE
- Морфо-культуральная и молекулярная характеристика возбудителя бактериального рака (Pseudomonas syringae pv. syringae) косточковых плодовых культур кыргызстана
Kırgızistan'da sert çekirdekli meyve ağaçlarında bakteriyel kanser hastalığı pseudomonas syringae pv. syringae'nin morfo-kültülrel ve moleküler özellikleri
MAKSATAY AVAZOVA
Yüksek Lisans
Kırgızca
2019
ZiraatKırgızistan-Türkiye Manas ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DR. SAYKAL BOBUŞOVA