Geri Dön

Kodlama yapmayan uzun RNA HOTTIP' in periampuller bölge tümörlerindeki klinik öneminin araştırılması

Investigation of the long noncoding RNA hottip for clinic implications in the periampullary region tumors

PDF İndir

  1. Tez No: 447197
  2. Yazar: ÖZKAN BALÇIN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. EKREM KAYA
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Genel Cerrahi, General Surgery
  6. Anahtar Kelimeler: Periampuller Bölge Tümörleri, RNA, KRAS, HOTTIP, Prognoz, Periampullary Region Tumors, RNA, KRAS, HOTTIP, Prognosis
  7. Yıl: 2016
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Uludağ Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Genel Cerrahi Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 37

Özet

Periampuller bölge tümörlerinde erken tanı ve prognozun tayini henüz çözülememiş bir problemdir.Bu çalışmada, son yıllarda keşfedilen ve kanser oluşumunda rol oynadığı bilinen bir kodlama yapmayan uzun RNA olan distal tipteki HOXA transkripti (HOXA transcript at the distal tip-HOTTIP) 'nin periampuller bölge tümörlerindeki rolünün araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmada 2006 - 2014 yılları arasında Uludağ Üniversitesi Tıp Fakültesi (U.Ü.T.F) Genel Cerrahi Anabilim Dalı 'nda periampuller bölge tümörleri nedeniyle cerrahi uygulanan 100 hasta değerlendirildi. Spesmenlerdeki tümörlü ve tümörsüz dokularda Real-Time PCR yöntemi kullanılarak HOTTIP ekspresyon tayini ve DNA sekanslama yöntemi ile KRAS mutasyon durumu araştırıldı. Elde edilen bulgular ile patolojik parametreler karşılaştırıldı ve hastalıksız sağ kalım / genel sağ kalım ile ilişkileri web tabanlı Sabiosciences PCR-Data Analiz istatistik programı kullanılarak analiz edildi. Olguların ortalama yaşı 62 (26 – 91) olup 78 'i erkek, 22 'si kadındır. Olguların 46 'sı pankreas başı, 34 'ü ampulla vateri, 12 'si distal koledok ve 8 'i de duodenum tümörü idi. HOTTIP ekspresyonu, normal doku ile karşılaştırıldığında; tümöral dokuda 32 kat fazla idi (p=0,013). 100 olgunun 29 'unda KRAS kodon 13 mutasyonu saptandı. KRAS kodon 13 mutasyonu taşımayan 71 olgunun % 86 'sında HOTTIP 'in yüksek ekspresyon gösterdiği belirlendi (p=0,03). HOTTIP ekspresyonu pankreas başı ve ampullada lokalize tümörlerde 8,3 ve 5,2 kat, infiltratif karakterlilerde 5 kat, lenfatik invazyonu olanlarda 8 kat ve rezeksiyon sonrası ilk 6 ayda ölenlerde 8,7 kat daha fazla idi (sırası ile p=0,0001, p=0,003, p=0,003, p=0,001 ve p=0,001) Bu çalışmanın sonucuna göre; periampuller bölge tümörlerinde, HOTTIP tayini prognoz takibinde etkili olabilecek bir biyobelirteç adayıdır. Ayrıca, KRAS mutasyonu bulunmayan periampuller bölge tümörlerinde, HOTTIP ekspresyonunun anlamlı derecede fazla olması bu tümörlerin oluşumunda sadece genetik değil epigenetik mekanizmaların da aktif olduğunu düşündürmektedir.

Özet (Çeviri)

Determination of early diagnosis and prognosis of periampullary tumors is a problem not yet solved. Recent studies indicate that long non-coding RNAs (lncRNAs) play crucial roles in tumorigenesis. The objective of this study is to investigate the effect and role of long non coding RNA HOXA transcript at the distal tip (HOTTIP) on prognosis of periampullary region tumors. A total of 100 periampullary region cancer cases were determined at the Department of General Surgery, Uludag University Hospital from 2006 to 2014. Each patient was histopathologically diagnosed as any periampullary region tumors. HOTTIP expression profile was determined using Real-Time PCR in tumors and non-tumor tissues. KRAS gene were screened by DNA sequencing in 100 patients. Relationships between data, patient clinicopathological parameters and disease-free survival and overall survival were analysed by using Web-based Sabiosciences PCR-Data Analysis programme. The present study unrelated patients with periampullary region tumors, including 78 males and 22 females, aged 26-91 years; the median age at the time of diagnosis was 62 years. Primary tumors were localized in the head of the pancreas in 46 cases, the papilla of vateri in 34 cases, the distal bile duct in 12 cases and the duodenum in 8 cases. The expression level of HOTTIP was 32-fold upregulated in tumors relative to normal tissues (p=0,013). Point mutation in KRAS gene codon 13 was identified in 29 cases. HOTTIP expression was upregulated in mutation (-) tumors compared (n=71) to mutation (+) tumors (n=29) (p=0,03) The presence of the primary tumor in the pancreas head and papilla of vater was significantly associated with upregulated expression of HOTTIP compared to other primary tumor locations (p=0,0001; p=0,003). The expression of HOTTIP was 5,09-fold upregulated in patients with infiltrative growth tumors and 8,01-fold upregulated in patients with lymphatic invasion pozitive tumors (p=0,003; p=0,001). The expression level of HOTTIP was 8,75-fold upregulated in patients die during the 6 months after surgery. The elevated expression of HOTTIP may be involved in the progression of periampullary region tumors and may therefore be considered a prognostic factor for patients with poor prognosis. Furthermore, HOTTIP expression was observed high level in tumors without mutation of KRAS gene. This result shows that epigenetic mechanisms maybe as important as genetic mechanism in cancer progression.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    611002

    Kodlama yapmayan uzun RNA'ların kolon tümörlerinde prognoz açısından öneminin araştırılması

    Invastigation of the long non coding rnas for prognostic implications in the colon tumors

    SEÇİL AKSOY

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Tıbbi BiyolojiUludağ Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BERRİN TUNCA

  2. Tez No

    849645

    İnflamasyon ilişkili kodlama yapmayan uzun rna (lncRNA) ekspresyon profilinin, kronik viral hepatit ve bu zeminde gelişmiş hepatosellüler karsinomlardaki patogenetik ve prognostik önemi

    Pathogenetic and prognostic significance of inflammation associated long non-coding rna (lncRNA ) expression profile in chronic viral hepatitis and chronic viral hepatitis associated hepatocellular carcinoma

    BURÇİN PEHLİVANOĞLU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Moleküler TıpDokuz Eylül Üniversitesi

    Moleküler Patoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖZGÜL SAĞOL

  3. Tez No

    604558

    Primer glioblastoma tümörlerinde long non coding RNA MALAT1'in prognostik öneminin araştirilmasi

    Investigation of the prognostic importance of long non coding RNA MALAT1 in primary glioblastoma tumors

    ÖMER GÖKAY ARGADAL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    GenetikBursa Uludağ Üniversitesi

    Beyin ve Sinir Cerrahisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HASAN KOCAELİ

  4. Tez No

    445572

    Koroner arter hastalarının plaklarında ve dolaşımlarındaki uzun kodlama yapmayan RNA ifade düzeylerinin incelenmesi

    Evaluation of long noncoding rna expression levels in the plaque and circulation of patients with coronary artery

    ARZU ÖZCAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2016

    Tıbbi BiyolojiCumhuriyet Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. NİLGÜN ÇEKİN

  5. Tez No

    564624

    Kodlama yapmayan uzun ve kısa boyutlu RNA'lar ile hastalıklar ve çevresel faktörler arasındaki bağlantıların tahmini

    Prediction of associations between diseases and environmental factors of long and short non-coding RNAs

    HÜSEYİN VURAL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolFırat Üniversitesi

    Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET KAYA

Geri Dön