Determination of extracellular hydrolytic enzyme production capacity and 16S rRNA analysis of streptomyces bacteria isolated from some soil samples collected in Sulaimani–Iraq
Süleymaniye'de toplanan bazı toprak numunelernden izole edilen streptomyces bakterilerinin ekstraselüler hidrolitik enzim kabiliyetlerinin belirlenmesi ve 16S rRNA analizi
- Tez No: 450904
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. KEREM ÖZDEMİR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Mikrobiyoloji, Biology, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Moleküler karakterizasyon, Süleymaniye, Streptomyces, 16S rRNA, Molecular characterization, Sulaimani, Streptomyces, 16S rRNA
- Yıl: 2016
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Yüzüncü Yıl Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 102
Özet
Bu çalışmada Irak'ın Süleymaniye ilinde belli noktalardan alına toprak numunelerinden Streptomyces cinsi bakterileri izole edilerek bazı ekstraselüler enzimlerin aktiviteleri belirlenmiş ve 16S rRNA gen bölgesinin filogenetik analizi yapılmıştır. Seyreltme plak yöntemi ile 26 farklı Streptomyces cinsi bakteri izole edilmiş ve daha sonra saflaştırma işlemi yapılmıştır. 26 Streptomyces suşuna yapılan ekstraselüler hidrolitik enzim aktivitesi çalışmalarında 3 izolat ksilinaz aktivitesinde, 3 izolat lipaz aktivitesinde, 21 izolat amilaz aktivitesinde ve 18 izolat proteaz aktivitesinde pozitif sonuç göstermiştir. Genomik DNA'sı izole edilen 8 izolatın 16S rRNA gen bölgesi 27F ve 1492R evrensel primerleri ile amplifiye edilip sekans analizi yapılmıştır. Bu sonuçlar Mega7.0.18 paket programı ile Maximum Likelihood algoritması kullanılarak filogenetik uzaklık matrisi olan (Jukes ve Cantor 1969) metodu ile filogenetik ağaç oluşturulmuştur. Oluşan filogenetik ağaçta NCBI'dan dizileri alına Streptomyces suşları ile çalışmamızda kullanılan suşlar güçlü bir homoloji ile kümelenerek filogenetik analizleri yapılmıştır.
Özet (Çeviri)
In this work, some soil samples taken from different location from Sulaimani-Iraq. The Streptomyces bacteria by isolating some extracellular enzymes is determined what activities they do and 16S rRNA gene field's phylogeny analyse has been made. 26 different types of bacteria have been isolated and then purification process has been with dilution plate method. At the works of extracellular hydrolytic enzyme activities has been done to 26 Streptomyces strains has resulted positive in 3 isolate xylenase activity, 3 isolated lipase activity, 21 isolate amylase activity and 18 protease activity. 8 isolate which genomic DNA of it isolated, sequence analyse of that has been done by amplified with universal primer as 16S rRNA gene field 27F and 1492R. With these results phylogenetic tree have been made by using Mega 7.0.18 package and ML algorithm and method of phylogenic distance matrix of (Juke and Cantor1969).At the created phylogenic tree, Streptomyces strains that their lines taken by NCBI.
Benzer Tezler
- Determination of extracellular hydrolytic enzyme production capacity and 16s rdna analyses of streptomyces genus bacteria isolated from root of Phaseolus vulgaris L. ( bean )
Phaseolus vulgaris L. (fasulye) bitki kök toprağından Streptomyces türlerinin bazı ekstraselüler hidrolitik enzim üretme kabiliyetlerinin belirlenmesi ve 16s rDNA analizi
HUSSEIN ALI SADEQ
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
MikrobiyolojiYüzüncü Yıl ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. KEREM ÖZDEMİR
- Determination of extracellular hydrolytic enzyme production capacity and 16s rdna analysis of bacillus genus bacteria isolated from Erçek Lake
Erçek Gölü'nden izole edilen bacillus cinsi bakterilerın ektraselüler hidrolitik enzim üretme kabiliyetlerinin belirlenmesi ve 16s rdna analizi
SARDAR HUSSEIN RASOOL
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
MikrobiyolojiYüzüncü Yıl ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. KEREM ÖZDEMİR
- Optimization of Production Parameters for Single Cell Oil and Metabolite Production from Yarrowia lipolytica Strains
Yarrowia lipolytica Suşlarından Tek Hücre Yağı ve Metabolit Üretim Parametrelerinin Optimizasyonu
AYŞE SAYGÜN
Doktora
Türkçe
2017
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NEŞE ŞAHİN YEŞİLÇUBUK
PROF. DR. NECLA ARAN
- Determination of extracellular hydrolytic enzyme capabilities of some anoxybacillus isolated from hot spring environments
Kaplıcalardan izole edilen bazı anoksibasillerin ekstrasellüler hidrolitik enzim kapasitelerinin belirlenmesi
WIDAD HASSAN YARWAIS JAF
Yüksek Lisans
İngilizce
2017
BiyolojiSiirt ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. MEHMET EMRE EREZ
- Van Gölü'nden toplanan su ve sediment numunelerinden izole edilen bakterilerin lakkaz ve mannanaz enzimlerini üretme kabiliyetleri
The production capabilities of laccase and mannanase enzymes of the bacteries isolated from water and sediment samples collected from the Van Lake
NEVROZ ASLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
MikrobiyolojiYüzüncü Yıl ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ERDAL ÖĞÜN