Determination of extracellular hydrolytic enzyme production capacity and 16s rdna analysis of bacillus genus bacteria isolated from Erçek Lake
Erçek Gölü'nden izole edilen bacillus cinsi bakterilerın ektraselüler hidrolitik enzim üretme kabiliyetlerinin belirlenmesi ve 16s rdna analizi
- Tez No: 450432
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. KEREM ÖZDEMİR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Bacillus, Hidrolitik ektraselüler enzim, 16S rDNA, Bacillus, Hydrolytic extracellular enzyme, 16S rDNA
- Yıl: 2016
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Yüzüncü Yıl Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışmada, Van ilinde bulunan Erçek Gölü'nde belli istasyonlardan alınan su örneklerinden Bacillus cinsi bakterilerin izolasyonu, ekstraselüler hidrolitik enzim aktivitelerinin belirlenmesi ve 16S rRNA analizinin yapılması amaçlanmıştır. Dilusyan plak yöntemi ile 26 Bacillus cinsi bakteri izole edilmiş ve ardından saflaştırma işlemi yapılmıştır. Bu 26 Bacillus cinsi bakterilerin ekstraselüler hidrolitik enzim aktivitesi çalışmalarında, 12 izolat ksilanaz aktivitesinde. 7 izolat amilaz aktivitesinde, 22 izolat proteaz aktivitesinde, 25 izolat katalaz aktivitesinde ve 1 izolat lipaz aktivitesinde pozitif sonuç vermiştir. Seçilen 7 izolatın geneomik DNA'sı izole edildikten sonra 16S rRNA gen bölgesinin PCR amplifikasyonu, 27F ve 1492R evrensel primerleri ile gerçekleştirilmiştir. Türler arasındaki genetik uzaklığı belirlemek için Maksimum Likelihood filogenetik ağacı oluşturulmuştur. İzolatların filogenetik ağaçta güçlü bir homoloji ile kümelendiği gözlemlenmiş olup genetik pozisyonları ortaya konmuştur.
Özet (Çeviri)
In this study, from water sample taken from definite stations in Erçek Lake located in Van district the isolation of Bacillus kind bacteria, the determination of extracellular hydraulic enzyme activities and doing the analysis of 16S rRNA have been aimed. With dilution plate method 26 Bacillus type bacteria has been isolated and after that distillation operation has been done. This, gave positive results in studies of extracellular hydraulic enzyme activities of 26 Bacillus type bacteria, in 12 isolate xylanase activity, in 7 isolate amylase activity, in 22 isolate protease activity, in 25 isolate catalase activity and in 1 isolate lipase activity. After 7 isolates' genomic DNA has been isolated 16S rRNA gene region's PCR amplification has been realized with 27F and 1492R universal primer. To be able to determine genetic distance between species Maximum Likelihood phonetic tree has been formed. It is observed that isolates have been clustered in phylogenic tree with a strong homology and their genetic positions have been revealed.
Benzer Tezler
- Determination of extracellular hydrolytic enzyme production capacity and 16s rdna analyses of streptomyces genus bacteria isolated from root of Phaseolus vulgaris L. ( bean )
Phaseolus vulgaris L. (fasulye) bitki kök toprağından Streptomyces türlerinin bazı ekstraselüler hidrolitik enzim üretme kabiliyetlerinin belirlenmesi ve 16s rDNA analizi
HUSSEIN ALI SADEQ
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
MikrobiyolojiYüzüncü Yıl ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. KEREM ÖZDEMİR
- Faruk suyu (Van-Köşebaşı köyü)'dan izole edilen bacillus cinsi bakterilerin ektraselüler hidrolitik enzim üretme kabiliyetlerinin belirlenmesi ve 16s rDNA analizi
Determination of the extracellular hydrolytic enzyme production potential and 16s rDNA analysis of bacillus species isolated from Faruk stream (Van–Köşebaşi village)
KÜBRA KARAVAŞ YILDIZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2026
MikrobiyolojiVan Yüzüncü Yıl ÜniversitesiMoleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HAMDULLAH SEÇKİN
- Determination of extracellular hydrolytic enzyme production capacity and 16S rRNA analysis of streptomyces bacteria isolated from some soil samples collected in Sulaimani–Iraq
Süleymaniye'de toplanan bazı toprak numunelernden izole edilen streptomyces bakterilerinin ekstraselüler hidrolitik enzim kabiliyetlerinin belirlenmesi ve 16S rRNA analizi
BARZAN OTHMAN HASAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
MikrobiyolojiYüzüncü Yıl ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. KEREM ÖZDEMİR
- DETERMINATION OF EXTRACELLULAR HYDROLYTIC ENZYME PRODUCTION CAPACITY AND 16S rRNA ANALYSIS OF Streptomyces BACTERIA ISOLATED FROM SOME SOIL SAMPLES COLLECTED IN ERBIL IRAQ
ERBİL'DE TOPLANAN BAZI TOPRAK NUMUNELERİNDEN İZOLE EDİLEN Streptomyces BAKTERİLERİNİN EKSTRASELÜLER HİDROLİTİK ENZİM KABİLİYETLERİNİN BELİRLENMESİ VE 16S rRNA ANALİZİ
FARHAN MOHAMMED AWLA KARU
Yüksek Lisans
İngilizce
2017
MikrobiyolojiYüzüncü Yıl ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. KEREM ÖZDEMİR
- Optimization of Production Parameters for Single Cell Oil and Metabolite Production from Yarrowia lipolytica Strains
Yarrowia lipolytica Suşlarından Tek Hücre Yağı ve Metabolit Üretim Parametrelerinin Optimizasyonu
AYŞE SAYGÜN
Doktora
Türkçe
2017
Gıda Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NEŞE ŞAHİN YEŞİLÇUBUK
PROF. DR. NECLA ARAN