Geri Dön

Hindi kuşbaşı örneklerinde vankomisin dirençli enterokokların varlığı ve moleküler karakterizasyonu

Presence and molecular characterization of vancomycin resistant enterococci in Turkey meat

  1. Tez No: 453915
  2. Yazar: AZAM AZIMI MAHALLEH
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MUAMMER GÖNCÜOĞLU
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Besin Hijyeni ve Teknolojisi, Food Hygiene and Technology
  6. Anahtar Kelimeler: Vankomisin dirençli enterokok (VRE), multipleks PCR, antibiyotik direnç, E. faecalis, E. faecium, van A, van B, Vancomycin resistant Enterococci (VRE), multiplex PCR, antibiotic resistance, E. faecalis, E. faecium, van A, van B
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ankara Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Gıda Hijyeni ve Teknolojisi (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 152

Özet

Çalışmada, Ankara'daki marketlerde taze olarak satışa sunulan hindi kuşbaşı örneklerinden klasik kültür yöntemiyle Enterococcus spp. izolasyonu ve biyokimyasal testler kullanılarak identifikasyonu, izolatların PCR (Polimeraz Zincir Reaksiyonu) analizi ile doğrulanması, pozitif bulunan izolatların multipleks PCR ile tür düzeyinde identifikasyonu, Enterococcus spp. izolatlarının eritromisin, kloramfenikol, gentamisin, penisilin, streptomisin, vankomisin, linezolid, kinupristin-dalfopristin olmak üzere 8 farklı antibiyotik diski kullanılarak antibiyotik direnç profillerinin CLSI (Clinical and Laboratory Standards Institute) standartlarına göre saptanması, E. faecalis ve E. faecium olarak identifiye edilen serotiplerin van A ve van B direnç fenotipleri yönünden multipleks PCR analizi yapılarak moleküler karakterizasyonlarının belirlenmesi, vankomisine direnç gösteren tüm suşlarda E test yapılarak MİK (Minimum İnhibisyon Konsantrasyonu) değerlerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Bu kapsamda toplam 100 hindi kuşbaşı örnek analiz edilmiş, 50'si (% 50) Enterococcus spp. pozitif olarak tespit edilmiştir. Serotiplendirme sonuçlarına göre 50 örneğin 21'i (% 42) E. faecalis, 19'u (% 38) E. faecium, 5'i (% 10) E. gallinarum, 1'i (% 2) E. durans, 1'i (% 2) E. hirae, 3'ü (% 6) ise E. casseliflavus olarak identifiye edilmiştir. Enterococcus spp. olarak belirlenen 50 izolatın 7'sinin (% 14) van A, 18'inin (% 36) van B geni yönünden pozitif olduğu saptanmıştır. Antibiyotik direnç profillerine göre 50 izolatın 6'sının (% 12) 2 antibiyotiğe, 15'inin (% 30) 3 antibiyotiğe, 17'sinin (% 34) 4 antibiyotiğe, 8'inin (% 16) 5 antibiyotiğe, 3'ünün (% 6) 6 antibiyotiğe birden dirençli oldukları, bir E. faecalis (% 2) izolatı bir antibiyotiğe dirençli olduğu saptanmıştır.

Özet (Çeviri)

The objectives of this study were to isolate and identify Enterococcus spp. from turkey retail meat samples collected from Ankara markets by classical culture method and using biochemical tests, to verify the isolates by PCR (Polymerase Chain Reaction), to evaluate the antibiotic resistance profiles of the verified Enterococcus spp. isolates with 8 different antibiotics including erythromycin, chloramphenicol, gentamicin, penicillin, streptomycin, vancomycin, linezolid, quinupristin-dalfopristin according to CLSI Clinical and Laboratory Standards Institute) standards, to determine the molecular characterization of the serotypes identified as E. faecalis and E. faecium for van A and van B resistance phenotypes with multiplex PCR, to verify of positive isolates' species with multiplex PCR, to determine MIC (Minimum Inhibitory Concentration) values of all the isolates determined as vancomicin resistant by E test. For this purpose, 100 turkey retail meat samples were analyzed, fifty (% 50) of the samples were detected as Enterococcus spp. positive. According to serotyping results 21 (% 42) were isolated as E. faecalis, 19 (% 38) were isolated as E. faecium, 5 (% 10) were isolated as E. gallinarum, 1 (% 2) was isolated as E. durans, 1 was isolated as (% 2) E. hirae, 3 (% 6) were isolated as E. casseliflavus. Among 50 isolates confirmed as Enterococcus spp., 7 isolates (% 14) were detected as van A positive, 18 isolates (% 36) were detected as van B positive. According to antibiotic resistance profiles, 6 isolates (% 12) were resistant to 2, 15 isolates (% 30) were resistant to 3, 17 isolates (% 34) were resistant to 4, 8 isolates (% 16) were resistant to 5, 1 E. faecalis isolate (% 2) were resistant to one of the 8 antibiotics out of 50 isolates.

Benzer Tezler

  1. Dondurulmuş piliç ve hindi parça etlerinde termofilik campylobacter türlerinin varlığı

    Presence of thermophilic campylobacter in frozen chicken and turkey cuts meat.

    ÇETİN KOCA

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Besin Hijyeni ve Teknolojisiİstanbul Üniversitesi

    Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖMER ÇETİN

  2. Hindi etlerinden hareketli aeromonas türlerinin izolasyon ve identifikasyonu

    Isolation and identification of motile aeromonas spp. in Turkey meats

    ÇETİN KOCA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    Besin Hijyeni ve TeknolojisiAnkara Üniversitesi

    Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. BELGİN SARIMEHMETOĞLU

  3. Hindi etlerinde Campylobacter jejuni'nin kültür tekniği ve PCR ile saptanması.

    Detection of Campylobacter jejuni from turkey meats using culture technique and PCR.

    ÖMER ÇAKMAK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    Besin Hijyeni ve TeknolojisiAnkara Üniversitesi

    Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İRFAN EROL

  4. Farklı yenilenebilr kaolama kombinasyonlarının dilimlenmiş hindi budunda kullanımı

    Application of food grade coating on sliced Turkey buttocks

    SAKİNE İLTER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    Gıda MühendisliğiYüzüncü Yıl Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İSMAİL SAİT DOĞAN

  5. Paketlemede ambalaj materyali olarak kullanılan nem tutucu filtrelerin hindi etinin raf ömrü üzerine etkisi

    The effect of humidity absorbing filters used as packing material on the shelf life of turkey meat

    GÜLŞAH UĞURLUAY

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    Besin Hijyeni ve Teknolojisiİstanbul Üniversitesi

    Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HİLAL ÇOLAK