Geri Dön

Pseudomonas aeruginosa klinik izolatlarında beta-laktamaz direnç genleri ile integronların belirlenmesi ve bazı bitki ekstrelerinin dirençli izolatlar üzerine etkisinin araştırılması

Investigation of beta-lactamases genes and integron cassettes in Pseudomonas aeruginosa clinical isolates and effects of some plant extract on resistant isolates

PDF İndir

  1. Tez No: 456958
  2. Yazar: ESMA AKYILDIZ
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. FATİH ŞABAN BERİŞ
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 134

Özet

Bu doktora tez çalışmasında, 91 Pseudomonas aeruginosa klinik izolatında β-laktamaz direnç genleri ve integronlar araştırıldı. Ayrıca dirençli izolatlar üzerinde bazı bitki ekstrelerinin etkileri agar kuyucuk yöntemiyle belirlendi. blaTEM, blaSHV, blaCTX-M1, blaCTX-M2, blaGES, blaVEB, blaPER-2, blaPER-1-3-4-5, blaPER-6, blaKPC, blaIMP, blaVIM, blaNDM-1, blaOXA-23, blaOXA-40, blaOXA-48, blaOXA-51, blaOXA58, blaGIM-1, blaSIM-1, blaSPM-1 ve blaCMY'yi içeren β-laktamaz direnç genleri Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ile araştırıldı. Sınıf 1 ve Sınıf 2 integronlarını tespit etmek için sırasıyla 5'-CS/3'-CS, hep51/hep74 değişken bölge primerleri kullanılarak PZR yapıldı. PZR çalışmaları sonucunda blaTEM-1, blaPER-1, blaVIM-2 blaVIM-38 blaNDM-1 genleri tespit edildi ve baz dizin analizi ile doğrulandı. 91 P. aeruginosa izolatının 33'ünde Sınıf 1 integron gen kaseti tespit edildi. Tespit edilen integronların AacA4, AacA4/OXA-2 benzeri, AAC(6')-Ib/AacA4/AadA7e, AacA4/“AAC6'IB”, GcuD/AAC(6')-I/QacK, AacA4/AadA1, VIM-38/AAC(6')-Ib/EmrE/aadA1 gen kasetlerini içerdikleri baz dizin analizi ile belirlendi. Bir P. aeruginosa klinik izolatında 3,239 bp büyüklüğünde metallo β-laktamaz (MBL) geni içeren yeni bir gen kaseti blaVIM-38/AAC(6')-Ib/EmrE/aadA1 gen kaseti tespit edildi. İzolatların hiçbirinde Sınıf 2 integron belirlenmedi. REP-PZR ile tüm izolatlar 9 farklı grup altında toplandı. Ribes rubrum, Prunus divaricata ve Duchesnea indica'nın meyve, Punica granatum'un yaprak ve Vitis vinifera'nın taze sürgün kısımlarının metanol özütlerinde direnç genleri ve direnç gen kasetlerini taşıyan klinik P. aeruginosa suşları üzerine inhibisyon etkisinin bulunduğu belirlendi.

Özet (Çeviri)

β-lactamase genes and integrons in clinical isolates of 91 Pseudomonas aeruginosa were investigated for in this PhD thesis. And also, inhibitory effects of 15 plant extracts on resistant isolates were determined by the agar well method. β-lactamase resistance genes including blaTEM, blaSHV, blaCTX-M1, blaCTX-M2, blaGES, blaVEB, blaPER-2, blaPER-1-3-4-5, blaPER-6, blaKPC, blaIMP, blaVIM, blaNDM-1, blaOXA-23, blaOXA-40, blaOXA-48, blaOXA-51, blaOXA58, blaGIM-1, blaSIM-1, blaSPM-1 ve blaCMY were determined by PCR. Class I and Class II integron cassette were amplified by PCR with 5'-CS /3'-CS and hep51/hep74 variable region primers, respectively. blaTEM-1, blaPER-1, blaVIM-2, blaVIM-38, and blaNDM-1 were determined and verified by DNA sequenced. Class I integron casette including 91 isolates as AacA4, AacA4/OXA-2 like, AAC(6')-Ib/AacA4/AadA7e, AacA4/“AAC6'IB”, GcuD/AAC(6')-I/QacK, AacA4/AadA1 and VIM-38/AAC(6')-Ib/EmrE/aadA1 was found in 33 isolates but no Class II ones. A novel gene cassette array blaVIM-38/AAC(6')-Ib/EmrE/aadA1 with an metallo β-lactamase (MBL) gene was detected in a P. aeruginosa clinical isolate as 3,239 bp. All isolates were classified into 9 different groups by REP-PCR. Extract from fruits, leaves, flowers, and/or young branches parts of 15 different plants were used to determine growth inhibitory effect on resistant isolates. Extract from R. rubrum fruit, P. divaricata fruit, D. indica fruit, P. granatum leaf, and V. vinifera young branches were observed against clinical P. aeruginosa strains which carrying resistance genes and resistance gene cassette

Benzer Tezler

  1. Tez No

    870395

    Klinik örneklerden izole edilen karbapenem dirençli Pseudomonas aeruginosa izolatlarındaki antibiyotik direncinin moleküler analizi

    Molecular analysis of antibiotic resistance in carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa isolates isolated from clinical samples

    GÜLŞAH ALTAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    MikrobiyolojiRecep Tayyip Erdoğan Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. OSMAN BİROL ÖZGÜMÜŞ

  2. Tez No

    663679

    Kastamonu eğitim ve araştırma hastanesinden izole edilen seftazidime dirençli Pseudomonas aeruginosa izolatlarında PER-1 ve OXA-10 benzeri genişlemiş spektrumlu βeta-laktamaz varlığının araştırılması

    Investigation of the presence of PER-1 and OXA-10 like extended spectrum βeta-lactamases in ceftazidime resistant Pseudomonas aeruginosa strains from Kastamonu training and research hospital

    SARAH AKAR ALI AL-OGAILI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    GenetikKastamonu Üniversitesi

    Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. YASEMİN ÇELİK ALTUNOĞLU

  3. Tez No

    256788

    Hastane enfeksiyonu etkeni pseudomonas aeruginosa suşlarının metallo-ß-laktamaz aktivitesinin fenotipik ve genotipik yöntemler ile saptanması

    Phenotypic and genotypic identification of the metallo-ß-lactamase activity in nosocomial Pseudomonas aeruginosa strains

    ELİF BOZÇAL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    BiyoteknolojiEge Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ATAÇ UZEL

  4. Tez No

    248019

    Geç başlangıçlı, hafif-orta klinik şiddetteki, çok ilaca dirençli bakterilerle enfeksiyon ve/veya yüksek mortalite riski olmayan hastanede gelişen pnömonilerde etken spektrumu ve antibiyotik duyarlılığı

    Bacterial spectrum and antibiotic sensitivity in patients with late onset hospital acquired pneumonia which have not high risk of infection by multi drug resistance microorganisms and/or increased risk of mortality,have mild-moderate clinic presentation

    SABRİ GÖZÜM

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    Göğüs HastalıklarıDokuz Eylül Üniversitesi

    Göğüs Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. OĞUZ KILINÇ

  5. Tez No

    569647

    Pseudomonas aeruginosa ve acinetobacter baumannii izolatlarında imipenem-edta/meropenem-edta disk yöntemi ve motifiye hodge testi ile metallo beta-laktamaz varlığının araştırılması

    Investigation of metallo-beta-lactamase producing pseudomonas aeruginosa and acinetobacter baumannii isolates by imipenem-edta/meropenem-edta disk method and modified hodge test

    HATİCE ÇINAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    MikrobiyolojiAfyonkarahisar Sağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ MERİH ŞİMŞEK

Geri Dön