Geri Dön

Pirenil türevleri ile modifiye edilmiş floresan karakterli peptid ve protein substratlara proteaz etkisinin florometrik yöntemlerle incelenmesi

Examination of protease effects on fluorescent peptid and protein substrates modified with pyrenyl derivatives by fluorometric methods

  1. Tez No: 457737
  2. Yazar: İBRAHİM ETHEM ÖZYİĞİT
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. EMİNE KARAKUŞ
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyokimya, Biochemistry
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2015
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Yıldız Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Biyokimya Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Spektroflorometrik yöntemler çok sayıda değişik enzimlerin aktivitelerinin incelenmesinde yaygın olarak kullanılmaktadır. Enzim aktivitesinin florometrik olarak gösterilmesi, doğrudan enzimlerin substratlarından ya da substratlarının floresan türevlerinden elde edilen emisyon sinyallerinin yorumlanmasıyla gerçekleştirilir. Böylece enzim-substrat komplekslerinin oluşumu, konformasyonel değişimleri, enzim faaliyetinin durdurulması ve enzimatik reaksiyon kinetiği florometrik verilerle hassas olarak izlenebilmektedir. Piren, floresein, rodamin, antrasen vb. floresan karakterli çok sayıda organik madde; yapılarında gerçekleştirilen uygun kimyasal değişikliklerle, proteinleri oluşturan L-α-amino asitlerin alkil yan zincirlerinde bulunan –COOH, -NH2, -OH, -SH gibi işlevsel gruplara kovalent olarak bağlanabilmektedir. Bu çalışmada, kimotripsin ve tripsin enzimlerinin aktivitelerinin, N-(1-pirenil)maleimid ile modifiye edilmiş sığır serum albumininin floresans ömür dağılımları üzerindeki etkileri incelendi. Floresans ömür dağılımlarındaki değişimleri elde etmek amacıyla Eksponansiyel Seriler Yöntemi (ESM) ile analiz edilen floresans bozunma verilerini görüntülemek için zaman ayrımlı spektroflorometre kullanıldı. Sentezlenen substrat PM-BSA'nın proteazlara maruziyeti sonrası floresans ömür dağılımları, proteazların farklı aktivitelerine atfedilen özgün yapılar sergiledi. Bu olgu fizyolojik etkinliklerinin yanısıra kanser, AIDS, SARS vb. birçok hastalıkta kilit rolü olan proteazların aktivitelerinin belirlenmesi ve birbirlerinden ayrıştırılması için geliştirilebilecek yeni tetkik yöntemlerine kapı aralamaktadır.

Özet (Çeviri)

Spectrofluorometric methods are widely used for examination of activities of many various enzymes. Monitoring of enzyme activity in fluorometric examinations are performed by evaluation of changes of the emission signals obtained directly from the substrates of enzymes or from the fluorescent derivatives of their substrates. Thus it can sensitively be succeeded that the formation of Enzyme – Substrate complexes, conformational changes and enzymatic reaction kinetics by evaluation of fluorometric data. Many fluorescent organic substances, such as pyrene, fluorescein, rhodamin, anthracene, etc. can be covalently bound to the functional groups such as –COOH, -NH2, -OH, -SH existing in alkyl side chains of L-α-amino acids by the way of proper chemical changes performed in their structures. In this study, the effects of activities of chymotrypsin and trypsin enzymes on fluorescence lifetime distributions of the substrat Bovine Serum Albumin (BSA) modified with N-(1-pyrenyl)maleimide (PM) were examined. The time resolved spectrofluorometer was used to monitor fluorescence decays, which were analysed by using the Exponential Series Method (ESM) to obtain the changes of fluorescence lifetime distributions. After the exposure of the synthesized substrat PM-BSA to the proteases, the fluorescence lifetime distributions exhibited specific structures, which are attributed to the different activities of the proteases. This phenomenon opens the door to new assay methods which would be developed to determine and to distinguish the activities of proteases which have key roles in many diseas like cancer, AIDS, SARS, etc.

Benzer Tezler

  1. Fonksiyonel grup içeren tetrapirol türevlerinin sentezi ve karakterizasyonu

    Synthesis and characterization of tetrpyrolle derivatives containing functional groups

    YAĞMUR ZEYNEP YURDAKUL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2026

    Kimyaİstanbul Teknik Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ESİN HAMURYUDAN

    DOÇ. DR. MUKADDES ÖZÇEŞMECİ

  2. Sigara filtre zifirinde benz (a) pirenin HPLC ile tayini

    Başlık çevirisi yok

    Ş.FATMA ÖZDEMİR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1989

    KimyaOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUSTAFA ÖZCİMDER

  3. Sigara izmarit zifiri üzerine kromatografik çalışmalar

    Başlık çevirisi yok

    Ş.FATMA AYGÜN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1995

    KimyaOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. MUSTAFA ÖZCÜMDER

  4. Sıçanlarda benzo(A)piren toksisitesine Doksorubisin ve Taksol'ün etkileri

    The Effects of Taxol and Doxorubicine in benzo(A)pyrene toxicity on rats

    DİDEM ÇOŞAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    Tıbbi BiyolojiEskişehir Osmangazi Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. AYŞE BAŞARAN