Q humması hastalığına karşı tanı kiti oluşturulması amacıyla lipopolisakkarit-BSA konjugatlarının oluşturulması ve yapılarının incelenmesi
Formation and structural investigation of lipopolsaccharide-BSA conjugates to make a diagnostic kit for Q fever disease
- Tez No: 457835
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. ZEYNEP AKDESTE
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Bioengineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2016
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Yıldız Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik ve Bilimleri Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 80
Özet
Bu çalışmada Coxiella burnetii patojeninin sebep olduğu Q Humması hastalığı için basit, otomasyonu mümkün olan ve ucuz bir tanı kiti yapılmaya çalışılmıştır. Günümüzde bu hastalığın tespiti hastalığından şüphelenen canlılardan alınan numunelerle patojenin genomunun aranmasıyla yapılmaktadır. Bu tanı kitini oluşturmak için patojenden izole edilen Lipopolisakkarit (LPS) biyopolimeri Bovin Serum Albümin (BSA) proteini ile konjuge edilmiştir. Konjugasyon reaksiyonları 1-etil-3-(3-dimetilaminopropil) karbodiimid hidroklorid (EDC) çapraz bağlayıcısı varlığında gerçekleştirilmiştir. Bu çapraz bağlayıcı karboksil grupların amino gruplarına bağlanmasında kullanılır. Hidroksil grubu barındıran biyopolimerlerde karboksil grubu oluşturmak için biyopolimer sodyum periyodat (NaIO4) ile tepkimeye sokulmuştur. Biyopolimer ile protein için ideal konjugasyon oranlarının bulunması amacıyla ilk önce BSA proteini Dekstran biyopolimeri ile konjuge edilmiştir. Konjugasyon ve saflaştırma işlemleri gerçekleştirildikten sonra konjugatların ELISA platelerine bağlanmaları sağlanmıştır. LPS ile aşılanan farelerden alınan kan serumları bu ELISA platelerine doldurulup üretilen antikor miktarı tayinini yapılmıştır. LPS molekülü kendi başına bu platelere bağlanabiliyor olsa da BSA proteinde bulunan yan zincir grupları molekülün daha iyi bağlanıp yıkama işlemleri sırasında ortamdan uzaklaşmamasını sağlar. Oldukça spesifik olan antikor-antijen ilişkisinden ve kullanılan İndirekt ELISA yönteminden dolayı konjugat ile yapılan antikor tayininin sadece LPS kullanılarak yapılan tayine göre daha etkili olduğu görülmüştür.
Özet (Çeviri)
In this study making a simple, automatable and cheap diagnostic kit for Q fever caused by Coxiella burnetii pathogen was aimed. The current method for diagnosing this disease is to look for the genome of the pathogen on samples obtained from suspected organisms. In order to make the diagnostic kit, isolated Lipopolysaccharide (LPS) from the pathogen was conjugated with Bovin Serum Albumin (BSA). Conjugation reactions took place in the presence of 1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl) carbodiimide hydrochloride (EDC) cross binder. This cross binder is used to bind amino groups with carboxyl groups. Biopolymer containing hydroxide groups was reacted with sodium periodate (NaIO4) in order to form carboxyl groups. BSA protein was conjugated with Dextran biopolymer initially in order to determine the ideal conjugation ratio. After conjugation and purification procedures were completed, the conjugates were bound to ELISA plates. Blood sera obtained from mice vaccinated with LPS were placed in ELISA plates for antibody diagnosis. LPS molecule can weakly bind to ELISA plates on its own but side chains located on BSA protein allows the molecule to bind to the plate strongly and keeps the molecule from washing out during washing procedures. It was seen that antibody diagnosis done with the conjugate was better compared to diagnosis done with LPS due to highly specific antibody-antijen interaction and Indirect ELISA methodology used in this thesis.
Benzer Tezler
- Q Humma Hastalığına karşı aşı modeli oluşturulması amacıyla sentetik polimerlerin lipopolisakkaritlerle konjugatlarının geliştirilmesi ve yapılarının incelenmesi
Development and structure analysis of synthetic polymers and lipopolysaccharide conjugates to form a vaccine model for Q fever
PELİN PELİT ARAYICI
Doktora
Türkçe
2021
BiyomühendislikYıldız Teknik ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SERAP DERMAN
DOÇ. DR. MESUT KARAHAN
- Antalya, Diyarbakır ve Samsun illerinde Q Humması
Q Fever in Antalya, Diyarbakır and Samsun provinces
UMUT BERBEROĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2003
MikrobiyolojiSağlık BakanlığıMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞEGÜL GÖZALAN
- Sığır ve koyun sürülerinden alınan örneklede coxiella burnetii (q fever) varlığının araştırılması
Investigation of presence of coxiella burnetii (q fever) in samples obtained from cattle and sheep flocks
ALİYE GÜLMEZ
Doktora
Türkçe
2013
Veteriner HekimliğiKafkas ÜniversitesiMikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MİTAT ŞAHİN
- Abort yapmış ineklerde Coxiella burnetii varlığının serolojik ve moleküler yöntemlerle araştırılması
Investigation of Coxiella burneti in aborted cows using serological and molecular methods
ASİL ERGÜN
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
Veteriner HekimliğiAtatürk ÜniversitesiMikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MEHMET CEMAL ADIGÜZEL
- Ayvacık'ta (Çanakkale) koyunlarda Coxiella burnetii infeksiyonunun seroprevalansının belirlenmesi
Seroprevalence of Coxiella burnetii infection in sheep in Ayvacik (Canakkale)
BAVER COŞKUN
Doktora
Türkçe
2016
Veteriner HekimliğiÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiZootekni Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KEMAL ÇELİK