Mastitisli sığır sütlerinden E. durans ve E. hırae'nin izolasyon ve identifikasyonu
Isolation and identification of E. durans and E. hirae from mastitic bovine milks
- Tez No: 458197
- Danışmanlar: PROF. DR. SÜHEYLA TÜRKYILMAZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2016
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Adnan Menderes Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 51
Özet
Bu çalışmada, mastitisli süt örneklerinden izole edilen ve çok yüksek 16S rRNA benzerliği nedeniyle sıklıkla birbiriyle karıştırılan Enterococcus durans ve Enterococcus hirae'nin moleküler yöntemler kullanılarak identifikasyonlarının yapılması amaçlandı. Çalışma materyalini 620 klinik veya subklinik mastitisli süt örneği oluşturdu. Fenotipik yöntemlerle 96 enterokok şüpheli izolat elde edildi. Bu izolatların cins spesifik primerler kullanılarak gerçekleştirilen polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) sonucu hepsinin Enterococcus spp. olduğu doğrulandı. Tür spesifik primerler kullanılarak uygulanan PZR sonucunda izole edilen 96 enterokokun 9 (%9.3)'unun E. hirae ve 5 (%5.2)'inin E. durans olduğu belirlendi. İzolatların 16S rRNA fragmentleri üniversal 16S primerleri kullanılarak çoğaltıldı ve sekans analizi ile identifikasyonlar doğrulandı. 16S rRNA benzerliği yüksek olan bu iki türün geleneksel fenotipik yöntemler kullanılarak birbirinden ayırt edilmeleri oldukça zor olup, bu çalışmayla türe özgü primerler kullanılarak uygulanan moleküler yöntemlerle bu gibi türlerin kolayca ayırt edilebileceği gösterilmiştir. Özellikle mastitisli sığır sütlerinden sık izole edilen enterokokların tanımlanmasıyla ilgili kesin sonuç veren, kolay ve zaman tasarrufu sağlayan yöntemlerin laboratuvarlarda uygulanmasının faydalı olduğu sonucuna varılmıştır. Bu iki enterokok türünün virulens faktörleri ve antibiyotik dirençliliklerinin belirlenmesi üzerine yapılacak olan çalışmaların bu mikroorganizmaların patogenezlerinin daha iyi anlaşılmasına katkı sağlayacağı düşünülmektedir.
Özet (Çeviri)
In this study, the identification of Enterococcus durans and Enterococcus hirae which are mostly interfering with each other because of very high 16S rRNA similarity that were isolated from mastitic milk samples with using molecular methods was aimed. The material was consisted of milk samples taken from 620 cows suspected of clinical or subclinical mastitis. Firstly, ninety six enterococci suspected isolates were obtained with phenotypic methods. Then it was confirmed that all these isolates were Enterococcus spp. by PCR with using specific primers. The results of PCR with using species-spesific primers showed that out of 96 enteroccocci isolates 9 (9.3%) were E. hirae and 5 (5.2%) were E. durans. 16 S ribosomal RNA fragments were amplified with using universal 16 S primers and these identifications were also confirmed with sequence analysis. It's difficult to differentiate these two species by using phenotypic methods from each other because of their high 16S rRNA similarities and it was also showed that these species could be easily differentiated by molecular methods with using specific primers. It's concluded that this method could be useful for routine laboratory procedures of the identification of enterococci isolated from mastitic bovine milk because of its time-saving, easiness and reliability. It's thought that further studies on the determination of virulence factors and antibiotic resistance of these two enterococci spp. should be designed to understand the pathogenesis of these microorganisms
Benzer Tezler
- Mastitisli sığır sütlerinden izole edilen escherıchıa colı suşlarının önemli virulens genlerinin ve antibakteriyel duyarlılıklarının incelenmesi
Investigation of the important virulence genes and antibacterial sensitivity of escherichia coli strains isolated from mastitic cattle milk
MELİKE BEKÖZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
MikrobiyolojiAdnan Menderes ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SÜHEYLA TÜRKYILMAZ
- Mastitisli sığır sütlerinden izole edilen enterococcus faecalis suşlarının virülens genlerinin incelenmesi
Investigation of virulence genes of enterococcus faecalis strains isolated from mastitic bovine milk
ÖMER YILDIZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
MikrobiyolojiAdnan Menderes ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SÜHEYLA TÜRKYILMAZ
- Mastitisli sığır sütlerinden izole edilen enterococcus faecium suşlarının ürettiği bazı bakteriyosinlerin tanısı
Detection of some bacteriocins in enterococcus faeci̇um strains isolated from mastitic bovine milk
YETER DELİBAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Veteriner HekimliğiAdnan Menderes ÜniversitesiMikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SÜHEYLA TÜRKYILMAZ
- Mastitisli sığır sütlerinden izole edilen enterococcus faecıum suşlarında gele, ESP ve efaafm genlerinin varlığının incelenmesi
Investigation of the presence of gele and ESP genes in enterococcus faecium strains isolated from mastitic bovine milk
TUĞÇE BAHAR HERKMEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
MikrobiyolojiAdnan Menderes ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SÜHEYLA TÜRKYILMAZ
- Mastitisli sığır sütlerinden izole edilen Enterococcus faecalis suşlarının plazmit profillerinin incelenmesi
The investigation of plasmid profiles of Enterococcus faecalis strains isolated from mastitic cow milks
MEHMET ÖZTÜRK
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
MikrobiyolojiAdnan Menderes ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SÜHEYLA TÜRKYILMAZ