Plazmid aracılı kinolon direnci(QNRS1 ve ACC (6')-IB-CR) ve enrofloksasin ile eliminasyonu
Plazmid-mediated quinolone resistance(qnrs1 and AAC (6')-IB-CR)and its elimination with enrofloxacin
- Tez No: 460078
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MURAT CENGİZ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Eczacılık ve Farmakoloji, Veteriner Hekimliği, Pharmacy and Pharmacology, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: E. coli, qnrS, aac (6')-Ib-cr, enrofloksasin, Mutant Önleyici Konsantrasyon, statik in vitro farmakodinami, E. coli, qnrS, aac (6')-Ib-cr, enrofloxacin, Mutant Prevention Concentration, statik in vitro pharmacodynamics
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Uludağ Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Farmakoloji ve Toksikoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 165
Özet
PLAZMİD ARACILI KİNOLON DİRENCİNİN (qnrS1 ve aac (6')-Ib-cr) ve ENROFLOKSASİN İLE ELİMİNASYONU Bu çalışma, florokinolon direncini tanımlamak, florokinolon direnç etmenlerinin enrofloksasinin mutant oluşumunu önleme potansiyeli ve bakteriyel inhibisyon özellikleri üzerindeki etkilerini belirlemek ve enrofloksasinin hayvansal kaynaklı E. coli izolatları üzerindeki etkinliğini değerlendirmek amacıyla gerçekleştirilmiştir. Tez projesinde TUBİTAK (COST) 110O478 numaralı proje kapsamında Bursa ili ve çevresinden toplanan 311 adet hayvansal kaynaklı E. coli izolatı ve 2 kontrol suşu (E. coli ATCC 25922 ve E. coli AG100) ve moleküler olarak oluşturulmuş 3 klon suş kullanıldı. Enrofloksasinin duyarlılığı mikrodilüsyon yöntemi ile belirlendi. Plazmidal genlerin tespiti ve klonlama işlemleri moleküler teknikler ile gerçekleştirildi. kromozomal mutasyonların ve plazmidal genlerinin direnç üzerindeki etkilerini belirlemek amacıyla izolatlar arasından en geniş genetik skalaya sahip 5 izolat, 2 kontrol suşu ve 3 klon suş için Mutant önleyici konsantrasyon (MÖK),Mutant frekansı (MF) ve mutant seçim penceresi (MSP) değerleri belirlendi. Statik in vitro farmakodinamik model kullanılarak zamana bağlı doz-yanıt deneyleri yapıldı. Doksan dokuz E. coli izolatı duyarlı, 50 orta derecede duyarlı, 162 tanesi ise dirençli olarak sınıflandırıldı. On qnrS1 ve 32 adet aac (6')-Ib-cr geni tespit edildi. Gen prevelanları sırasıyla % 3,3 ve % 10,3 olarak belirlendi. İki genin birlikte bulunma oranı ise % 0,62 olarak hesaplandı. MÖK, MF ve MSP çalışmaları sonunda QRDR mutasyonları ve qnrS1ve aac (6')-Ib-cr genlerinin enrofloksasinin MÖK, MF ve MSA değerlerini arttırarak bakterileri enrofloksasinin antimikrobiyal etkilerinden koruduğu belirlendi. Ayrıca zamana bağlı doz-yanıt deneyleri ile enrofloksasinin karakteristik konsantrasyona bağlı bakterisidal etkisi klon suşlar, PMQR genlerine ve/veya QRDR mutasyonlarına sahip E. coli izolatlarında zamana-bağlı veya ko-etkiye dönüştüğü saptandı.
Özet (Çeviri)
PLAZMID-MEDIATED QUINOLONE RESISTANCE (qnrS1 and aac (6')- Ib-cr) AND ITS ELIMINATION WITH ENROFLOXACIN Aims of this study were to identify floroquinolone resistance, characterization of QRDR mutations and PMQR genes and their influence on enrofloxacin resistance as well as assessment and characterization of enrofloxacin activity against fluoroquinolone resistant E. coli isolated from animals. Three hundered and eleven E. coli strains from the sample collection of COST Project 110O478, 2 control strains (E. coli ATCC 25922 and E. coli AG100) and 3 molecularly constructed clones were used in this study. Broth microdilution tests were performed for determination of enrofloxacin susceptibility. Molecular methods were used for detection and cloning of PMQR genes. Mutant prevention concentration (MPC), mutant frequency (MF) and mutant selection window (MSW) values were determined for 5 E. coli isolates 3 clone and 2 control strains. Static in vitro pharmacodynamic model was used for assessment and characterization of enrofloxacin pharmacodynamics. Ninety nine E. coli isolates were classified as susceptible, 50 as intermediate and 162 as resistant. Sequencing results verified 10 S1 and 32 cr variants. Prevelance of PMQR genes were 3,3 % and 10,3 % respectively. Prevelance of coexistance was 0,62 %. MPC, MF, MSW experiments indicated that QRDR mutations and PMQR genes enhance MPC, MF, MSW values and provide protection against enrofloxacin activity thus aiding survival and provoking emergence of enrofloxacin resistant sup-poulations in E. coli. Static in vitro pharmacodynamic modelling revealed characteristic dosedepended bactericidal effect of enrofloxacin is altered and displayed as time-depended or co-effect in the prescence of QRDR mutations and/or PMQR genes in E. coli.
Benzer Tezler
- Klinik Escherichia coli izolatlarında plazmit aracılı kinolon direnç genlerinin araştırılması
Investigation of plasmid-mediated quinolone resistance genes in clinical Escherichia coli isolates
AHMED MOHSIN SALEH AL-AZZAWI
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyolojiKırşehir Ahi Evran ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATMA FİLİZ ARI
- Kinolon dirençli escherichia colı klinik izolatlarında plazmidik direnç mekanizmalarının araştırılması
Investigation of plasmid-mediated resistance mechanisms in quinolone resistant clinical escherichia coli isolates
PINAR AKÇAY ÖZLÜER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
MikrobiyolojiAdnan Menderes ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MURAT TELLİ
- Gram negatif bakterilerde plazmid aracılı kinolon direnci varlığının araştırılması
Investigation of the presence of plasmid mediated quinolone resistance in gram negative bacteria
PELİN TAŞKIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
MikrobiyolojiMarmara ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MÜNEVVER UFUK HASDEMİR
- Klinik örneklerden izole edilen Klebsiella pneumoniae suşlarında plazmid aracılı kinolon direnç geni QNR'nin araştırılması
Detection of the plazmid-mediated quinolone resistance determinant gene QNR among clinical isolates of Klebsiella pneumoniae
YAĞMUR EKENOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
MikrobiyolojiÇukurova ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AKGÜN YAMAN
- Escherichia coli klinik izolatlarında plazmid aracılı florokinolon direnci
Plasmi̇d-medi̇ated fluoroqui̇nolone resi̇stance i̇n cli̇ni̇cal i̇solates of escheri̇chi̇a coli̇
DHAY ALİ AZEEZ AL-DULAİMİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
MikrobiyolojiSelçuk ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DUYGU FINDIK