Geri Dön

Microbial ecology and genetics of benzalkonium chloride biotransformation in the environment

Benzalkonyum klorür bileşiklerinin çevredeki parçalanmasının mikrobiyal ekolojisi ve genetik alt yapısı

PDF İndir

  1. Tez No: 460970
  2. Yazar: EMİNE ERTEKİN
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. ULAŞ TEZEL
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoteknoloji, Mikrobiyoloji, Biotechnology, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
  10. Enstitü: Çevre Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Çevre Bilimleri Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Antimikrobiyal özellikte olan dördüncül amonyum bileşiklerinin (DAB) çevreye salınmaları ekotoksisite ve antimikrobiyal direncinin yayılması gibi problemlere sebep olmaktadır. DAB ların en sık kullanılan alt grubu olan benzalkonyum klorürlerin (BAK) biyodedradasyonu sırasında BAK önce bir N-dealkilasyonu ile benzil dimetil amine (BDA) dönüşür; daha sonra dimetil amin ve metil amin oluşur. Bu reaksiyon sonucunda BAK lar antimikrobiyal özelliklerini ve dolayısıyla çevreye olan etkilerini kaybederler. BAK biyodegradasyonu biyokimyasal olarak bilinmekle birlikte, çevrede biyodegradasyonu gerçekleştiren mikrobiyal komuniteler ve biyodegradasyonda rol oynayan genlerle ilgili çok az şey bilinmektedir. Bu çalişmada yeni bir tür olan Pseduomonas sp.“BIOMIG1”in çevrede BAK biyodegradasyonuyla ilgili önemli rol oynadığı saptanmıştır. BIOMIG1 in biyodegradasyonun farklı kademelerini gerçekleştirebilen fenotiplerinin tüm genomlarının karşılaştırılması sonucunda bir gen kümesinin BAK'ı BDA'ya dönüştürdüğü tespit edilmiştir. Bu gen kümesi içindeki Rieske oksigenaz tek katabolik gen olup ürettiği enzim diğer DAB ları parçalayan enzimlerle düşük seviyede homoloji göstermektedir (~30% amino asit benzerliği). Bu enzim oxyBAC olarak adlandırılmış ve E.coli içerisine transfer edilmiştir. oxyBAK ı sentezleyen E.coli nin BAK'ı eşit oranda BDA'ya dönüştürdüğü gösterilerek, fonksiyonu deneysel olarak da kanıtlanmıştır.

Özet (Çeviri)

Contamination of the environment with biocides such as quaternary ammonium compounds (QACs) has been associated with public health and environmental hazards such as proliferation of antimicrobial resistance and ecotoxicity. Biodegradation of benzalkonium chloride (BAC), the most commonly used type of QAC biocides, is initiated with the conversion of BAC to benzyldimethyl amine (BDMA) via an N-dealkylation reaction. This reaction removes the biocidal activity of the BAC thus eliminates its impact in the environment. However, the structure of BAC degrading microbial communities is not fully understood as well as the genes involved in the BAC biodegradation pathway. In this study, it was demonstrated that a novel BAC degrader Pseudomonas sp. BIOMIG1 played a key role for BAC degradation in the environment. Whole genomes of four BIOMIG1 phenotypes revealed that a gene cluster specific to the former two strains was likely involved in converting BAC to BDMA, which is the key step in the pathway. This gene cluster consisted a Rieske oxygenase (oxyBAC), which was the only catabolic gene that was homologous to those transforming QAC-like compounds. E. coli transformed with oxyBAC could transform BAC into equimolar amounts of BDMA, confirming its function as a novel enzyme catalyzing an unusual dealkylation reaction.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    335720

    Characterization of microbial community in lab scale enhanced biological phosphorus removal reactors with quantitative real-time polymerase chain reaction

    Anoksik ortamda biyolojik fosfor giderimi yapan bakteri çeşitliliğinin kantitatif gerçek zamanlı zincir tepkimesi tekniği ile incelenmesi

    İPEK ERGAL

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    Mikrobiyolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    İleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ALPER TUNGA AKARSUBAŞI

  2. Tez No

    991708

    İki farklı karides türünden elde edilen yetistiricilik deşarj sularının biyoyumak reaktörlerinde PHB düzeyi ve mikrobiyota kompozisyonuna etkisi

    Impact of aquaculture discharge waters from two shrimp species on PHB production and microbiota composition in biofloc reactors

    AHMET GÜRLER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2026

    GenetikAnkara Üniversitesi

    Su Ürünleri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ERCÜMENT GENÇ

  3. Tez No

    1005913

    OBSESİF KOMPULSİF BOZUKLUK HASTALARINDA YETİŞKİN AYRILMA ANKSİYETESİ EŞTANISI VARLIĞINA GÖRE OROFARENGEAL MİKROBİYOTA PROFİLİNİN KARŞILAŞTIRILMALI ANALİZİ

    COMPARIVE ANALYSIS OF OROPHARYNGEAL MICROBIOTA PROFILES ACCORDING TO ADULT SEPARATION ANXIETY DISORDER COMORBIDITY IN PATIENTS WITH OBSESSIVE-COMPULSIVE DISORDER

    CEREN ŞAHİN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2026

    GenetikSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ASLI BEŞİRLİ

  4. Tez No

    562032

    Balıkesir/Antandros Antik Kenti kazısı toprak örneklerinin metagenomik analizi

    Metagenomic analysis of soil samples of Balıkesir/Antandros Ancient City excavation

    DİLAN BAL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ERCAN ARICAN

  5. Tez No

    709380

    Ko-kültür sistemiyle antimikrobiyal peptid eldesi üzerine çalışmalar

    Studies on antimicrobial peptide obtaining by co-culture system

    AYŞEGÜL YANIK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Genetikİstanbul Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ÇAĞATAY TARHAN

Geri Dön