Non sendromik ailesel işitme kayıplı hastalarda genetik analiz
Genetic analysis in patients with nonsyndromic hearing loss
- Tez No: 461124
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MÜZEYYEN YILDIRIM BAYLAN
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Kulak Burun ve Boğaz, Otorhinolaryngology (Ear-Nose-Throat)
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Dicle Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Kulak Burun Boğaz Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 110
Özet
Amaç: Bu çalışmada ailesel nonsendromik sensörinoral işitme kayıplı olan hastalar belirlenip bu hastaların genetik analizi ile bölgemize ait genetik verilerin prevelansının saptanması, fenotip ile genotipin ilişkilendirilmesi ve yeni genlerin bulunması amaçlanmıştır. Materyal ve Metod Dicle üniversitesi Kulak Burun Boğaz hastalıkları polikliniğine 2013 ile 2016 yılları arasında başvuran ailesel nonsendromik işitme kayıplı hastalar üzerinde çalışılmıştır. Hastaların ayrıntılı anamnezleri, yapılan muayeneleri, işitme eşikleri kaydedilmiştir. Ailelerin pedigrileri çizilip incelemeye dahil edilmiştir. Hastaların ve en az iki aile bireyinin kan örnekleri alınarak uygun şartlarda Ankara Üniversitesi Çocuk Genetik Bilim Dalı tarafından incelenmiştir. DNA dizi analizi yöntemi ile Konneksin 26 (GJB2) ve enzimle kesim yöntemi ile mitokondriyal gen mutasyonları taranmıştır. Konneksin 26 ve mitokondriyal gen mutasyonları saptanmayan hastaların DNA örnekleri Miami Üniversitesi John P. Hussman Institute of Human Genomics labaratuvarında yeni nesil sekanslama yöntemlerinden olan tüm ekzom sekanslama yöntemi ile diğer nonsendromik işitme kaybı yapan bilinen bütün gen mutasyonları taranmıştır. Gen mutasyonları tarandıktan sonra işitme kaybı açıklanamayan örneklerden ise bu ailelerin gen haritamaları yapılarak yeni gen mutasyonları araştırılmıştır. Bulgular Çalışmamız non sendromik ailesel işitme kaybı bulunan 57 aile üzerinde gerçekleştirilmiştir. Bu aileler içinden 244 birey değerlendirilmiştir. Bu 244 bireyin 92'sinde ailesel nonsendromik işitme kaybı saptanmıştır. Her aileden seçilen bir proband hasta üzerinde genetik analizlerimiz gerçekleştirilmiştir. Çalışmamızın sonucunda 23 ailede (%40) işitme kaybının nedeni olarak genetik mutasyonlar tespit edilmiştir. Genetik mutasyon tespit edilen hastaların %82,6'sının ailesinde 3. derece akraba evliliği mevuttu. Genetik mutasyon saptanan hastaların %91,3'ünde ileri-derin işitme kaybı mevcuttu. Bu hastaların 7 tanesinde Konneksin26 (GJB2) (%12.2), 4 tanesinde TMIE (%7.01), 3 tanesinde MYO15A (%5.2), 2 tanesinde SLC26A4 (%3.5), 2 tanesinde ESRRB (%3.5), 2 tanesinde TMPRSS3 (%3.5), 1 tanesinde GIPC3 (%1.7), 1 tanesinde MYO6(%1.7), 1 tanesinde MYO7A(%1.7) gen mutasyonları tespit edildi. Sonuç Çalışmamızda en sık işitme kaybı nedeni olarak GJB2 mutasyonları tespit edildi. GJB2 mutasyonlarının en sık nedeni ise c.35delG olarak saptandı. Ailesel nonsendromik işitme kaybı yapan genetik mutasyonların bölgemizdeki prevelansı tespit edildi. Çalışmamız sırasında yeni gen mutasyonları tespit edilemedi.
Özet (Çeviri)
Purpose: In this study, our main aim has been to determine those patients with familial non-syndromic sensorineural hearing loss, to identify the prevalence distribution of genetic data known in regard to our region through these patients' genetic analyses, to establish the association between their phenotype and genotype and to find new genes. Material and Method Patients who were diagnosed with familial non syndromic sensorineural hearing loss, and who applied to the Polyclinic of Otorhinolaryngologic diseases, Dicle University, between 2013 and 2016, were included into the study. The patients' detailed anamnesis, examinations performed and their hearing threshold tests were recorded. The families' pedigrees were drawn and included in the review. Blood samples of the patients and of at least 2 family members were taken and reviewed under appropriate conditions by the department of Child Genetic Science, Ankara University. Connexin 26 (GJB2), identified by the DNA gene sequencing method, and the mitochondrial gene mutations by the cutting with enzyme method were scanned. The DNA samples of patients, whose Connexin 26 and mitochondrial gene mutations were not identified, were scanned at Miami University, John P. Hussman Institute of Human Genomics laboratory for other gene mutations, known to cause the other non-syndromic hearing losses, by using the whole exome sequencing method, which is one of the new generation sequencing methods. As to the samples, in whom hearing loss could not be explained after scanning for other gene mutations known to cause hearing loss, the families' genetic mappings were drawn, and new gene mutations were researched. Findings Our study was carried out on 57 families with familial nonsyndromic hearing loss. From among these families, 244 individuals were assessed. Familial nonsyndromic hearing loss was determined in 92 of those individuals. Our genetic analyses were performed on one proband patient chosen from each family. As a result of our study, genetic mutations were determined to be the main reason for hearing loss in 23 families (40%). There existed third degree consanguineous marriage in 82,6% and severe-to-profound hearing loss in 91,3% of those patients who were determined to have genetic mutations. Gene mutations were determined as follows: Connexin 26 (GJB2) (%12.2) in 7 patients; TMIE (%7.01) in 4; MYO15A (%5.2) in 3; SLC26A4 (%3.5) in 2; ESRRB (%3.5) in 2; TMPRSS3 (%3.5) in 2; GIPC3 (%1.7) in 1; MYO6 (%1.7) in 1; MYO7A (%1.7) in 1. Result In our study, Connexin 26 mutations were determined to be the most frequent reason for hearing loss. As the most common reason for Connexin 26 mutations, c.35delG was identified. The prevalence of genetic mutations leading to familial non-syndromic hearing loss was also determined for our region, During our study, we were not able to identify new gene mutations, however.
Benzer Tezler
- Şanlıurfa ilindeki sensorinöral işitme kayıplı çocuk hastaların etyolojik ve epidemiyolojik degerlendirilmesi
Etiological and epidemiological assessment of pediatric patients with sensorineural hearing loss in the province of Şanliurfa
MEHMET ALİ ÇİFTÇİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2014
Kulak Burun ve BoğazHarran ÜniversitesiCerrahi Tıp Bilimleri Bölümü
DOÇ. DR. İSMAİL İYNEN
- Non-sendromik nörosensöriyal tip işitme kaybı olan hastalarda GJB2, GJB3 ve GJB6 genlerinin MLPA yöntemi ile incelenmesi.
Studying GJB2, GJB3 and GJB6 genes in patients with non-syndromic neurosensorial type hearing loss by MLPA technique.
GÜNEY BADEMCİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2008
GenetikEskişehir Osmangazi ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. M.HAMZA MÜSLÜMANOĞLU
- Güneydoğu Anadolu'daki işitme engellilerde GJB2 mutasyonlarının sıklığı
Frequency of GJB2 mutations in a hearing impaired population from southeastern Anatolia
DORUK TAYLAN
- Abdurrahmangazi İşitme Engelliler İlköğretim Okulunda okuyan öğrencilerin işitme kayıplarının etiyolojik ve epidemiyolojik özelliklerinin incelenmesi
The studies of the etiologic and epidemiologic features of the students? hearing loss at Abdurrahmangazi Hearing Imparied Primary Scool
MUZAFER ARI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2009
Kulak Burun ve BoğazYüzüncü Yıl ÜniversitesiKulak Burun Boğaz ve Baş-Boyun Cerrahisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. A.FARUK KIROĞLU
- Türk toplumunda ailesel nonsendromik işitme kaybının genetik temelinin araştırılması
The investigation of the genetic base of the familial nonsyndromic hearing loss in turkish population
ASLI SUBAŞIOĞLU UZAK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2012
GenetikErciyes ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUNİS DÜNDAR