Geri Dön

Investigation of nuclear factor one function by forced expression of wildtype and dominant negative NFI proteins

Yaban tip ve dominant negatif NFI proteinlerinin ifade artırımı ile nükleer faktör I fonksiyonunun araştırılması

PDF İndir

  1. Tez No: 465441
  2. Yazar: VAROL GÜLER
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. ASLI KUMBASAR
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2016
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İstanbul Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 118

Özet

Embriyonik beyin gelişiminin ilk evrelerinde nöral embriyonik kök hücreler farklılaşarak nöral ve glial hücre popülasyonlarını oluştururlar. Nöral kök hücrelerinin farklılaşması içsel ve dışsal mekanizmalar tarafından kontrol edilir. Transkripsiyon faktörleri spesifik hücre popülasyonlarının oluşumunda rol oynayan önemli içsel mekanizmalardan biridir. Nükleer Faktör I (NFI) ailesi, merkezi sinir sisteminin gelişiminde rol oynayan önemli transkripsiyon faktörlerindendir. NFI ailesi omurgalılarda yapısal ve fonksiyonel benzerlikler taşıyan NFIA, NFIB, NFIC ve NFIX olmak üzere 4 adet paralog gen üyesine sahiptir. Her bir NFI üyesi kendisiyle (homodimer) veya diğer aile üyeleriyle (heterodimer) dimer oluşturarak, hedef genin transkripsiyon kontrol bölgesindeki (promotor bölge) NFI spesifik DNA bağlanma dizisine (TTGGC(N5)GCCA) bağlanarak hedef genin ifadesini kontrol eder. NFI proteinleri yapı olarak N-terminal ucunda bulunan DNA bağlanma ve dimerleşme bölgesi (DBD) ve C-terminal ucunda bulunan transaktivasyon ve represyon bölgesi (TAR) olmak üzere iki ana alt birimden oluşur. N-terminal bölgesi NFI proteinleri arasında yüksek oranda korunmuş olup, DNA bağlanma aktivitesinin gerçekleştiği MAD Homoloji 1 (MH1) motifini içerir. Cterminal ucu NFI üyeleri arasında N-terminal'e kıyasla daha değişken bir yapıya sahip olup, içerisinde NFI proteinlerinin lokalizasyonunu belirleyen nükleer lokalizasyon sinyali (NLS) ve NFI proteinlerinin hedef gen üzerindeki fonksiyonunu etkileyen prolince zengin bir bölge bulunmaktadır. NFI proteinlerinin C-terminal bölgesinde bulunan serine-treonin bölgeler glikolizasyon ve fosforilasyon gibi postranslasyonel modifikasyonlara tabi olmaktadır. NFI'ların post-translasyonel modifikasyonları, koaktivatörler ve diğer transkripsiyon faktörleri ile etkileşimlerini etkileyerek, hedef gen üzerindeki fonksiyonlarına çeşitlilik kazandırmaktadır. NFI proteinleri, hedef genin ifadesini çeşitli mekanizmalar üzerinden düzenlerler. Bunlar sırasıyla; DNA kromatin yapısını değiştirerek hedef genin ifadesinin kontrol bölgesi olan promotor bölgesine doğrudan bağlanarak aktivasyonu veya represyonu sağlaması, diğer transkripsiyon faktörleri veya ko-aktivatörler ile etkileşerek hedef genin kontrolü, hedef geni kontrol eden başka bir transkripsiyon faktörü ile birbirine yakın bağlanma bölgelerinde rekabet ederek hedef genin ifadesinin ifadesinin düzenlenmesi ve hedef genin promotor bölgesine bağlanıp, bu geni baskılayan faktörlerden koruması olarak belirtilebilir. Merkezi sinir sisteminin (MSS) ventriküler bölgelerinde kendisini yenileyerek çoğalabilen veya farklılaşarak nöron ve glia gibi spesifik hücre tiplerini oluşturabilen nöral projenitör hücreler bulunur. Nöral projenitör hücrelerin farklılaşması veya kendisini yenileyip çoğalması arasındaki dengenin korunması MSS gelişimi için çok önemlidir; bu denge projenitör hücrelerde ifade edilen regülatör genler tarafından kontrol edilir. Bu genlerden, NFI proteinleri, NFIA, NFIB ve NFIX, gelişimin erken xxvi dönemlerinde ventriküler bölgelerde ifade edilmeye başlar ve ekspresyonları gelişimin son evrelerine kadar devam eder. Yapılan in vivo çalışmalarda NFI genlerinin susturulmasıyla beynin değişik bölgelerinde gelişimsel bozuklukların oluştuğu gösterilmiştir. NFI proteinleri gelişimsel süreçte nörogenez, gliogenez, akson ve dendrit oluşumu, nöronların migrasyonu gibi mekanizmaları kontrol etmektedir. NFI proteinleri spesifik olarak bu mekanizmaları teşvik eden genleri aktivasyonunu sağlarken nöral projenitör hücrelerin çoğalması ve kendini yenilemesinden sorumlu genleri baskılamaktadır. Korteks gelişimi sırasında NFI proteinleri gliogenez ile astrosit popülasyonunun artışını sağlamakla birlikte, nörogenez ile nöron oluşumu teşvik ederken akson ve dendrit yapılarının oluşumunu tetikleyerek terminal nöron farklılaşmasını düzenler. NFI proteinleri spesifik olarak astrosit oluşumunu aktive eden GFAP geninin ifadesini arttırırken, farklılaşmayı baskılayan ve nöral projenitör hücrelerinin devamlılığını sağlayan EZH2, SOX9 ve HES1 genlerin ifadesinin baskılanmasını sağlarlar. Beynin diğer bir bölümü olan omurilik gelişimi sürecinde NFI proteinleri gliogenez ve nörogenez arasındaki dengeyi kontrol eder. Gelişimin ilk evrelerinde NFI, HES1 geninini indükleyerek nörogenezi bloklayıp glial populayonunun oluşumunu sağlar. Daha sonra ise GFAP, GLAST FGR3, APCDD1 ve MMD2 gibi glial spesifik genler NFI tarafından aktive edilerek prekürsör hücreler gliogenez yönünde teşvik edilir. Bunun dışında NFI proteinleri OLIG2 ve SOX10 proteinleri tarafından baskılanarak prekürsör hücrelerin astrosit yerine omurilik bölgesinde önemli bir hücre tipi olan oligodentrosit hücreleri oluşumunu sağlanır. NFI proteinleri omurilik gelişiminde CGN hücrelerinin post-mitotik farklılaşması için GABA reseptörleri ve CGN migrasyonunda önemli hücre dışı matriks proteinleri EPHRINB1, N-CADHERIN, TAG-1 VE WNT7A ifadelerinin artışını sağladığı belirtilmiştir. Yetişkin MSS'de NFI proteinlerinin ifadesi alt ventriküler bölgede kısıtlı kalmakta, burada NFIX embriyonik gelişimdeki görevinden farklı olarak kök hücrelerin devamlılığını sağlamak için, bu hücrelerin farklılaşmadan veya bölünmeden sessiz durumda kalmasını sağlamaktadır.

Özet (Çeviri)

Nuclear Factor One (NFI) transcription factors are site specific DNA binding proteins that play important roles in regulation of central nervous system development. NFI family comprise four genes in vertebrate genomes: NFIA, NFIB, NFIC and NFIX. Each family member is composed of a highly conserved amino (N-) terminal DNA-binding and dimerization domain (DBD) and a distinct carboxyl (C-) terminal transcription activation and repression domain. NFI proteins specifically recognize the palindromic consensus sequence TTGGC(N5)GCCAA on double stranded DNA and bind as homo- or heterodimers. Three members of the NFI family, NFIA, NFIB, and NFIX, are highly expressed in the central nervous system and gene inactivation studies have shown that these nervous system specific NFIs are involved in development of different brain regions, such as the cerebral cortex, hippocampus, cerebellum, and spinal cord, and regulating neuro and gliogenesis and terminal differentiation.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    818840

    Pentilentetrazol ile indüklenen kindling modelinde valproik asitin sitokrom P450 enzim sistemi ve endoplazmik retikulum stresi üzerine etkilerinin araştırılması

    In the kindling model induced with pentylentetrazolinvestigation of the effects of valproic acid on stress of the cytochrom P450 enzyme system and endoplasmic reticulum

    UFUK YÜKSEL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    NörolojiErciyes Üniversitesi

    Nörobilim Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FÜSUN FERDA ERDOĞAN

    DR. ÖĞR. ÜYESİ AYÇA LEKESİZCAN

  2. Tez No

    66571

    Sıkıştırılmış sıvı kaynaması

    Subcooled boiling

    ZEHİR FATİH ÖZTÜRK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1997

    Nükleer Mühendislikİstanbul Teknik Üniversitesi

    Fizik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ŞARMAN GENÇAY

  3. Tez No

    398968

    Transforming growth factor β (TGFβ), nuclear factor kappa b (NF-KB), heat-shock 90β (HSP90β) ve e-kadherin proteinlerinin, testis dokusunda dağılımı üzerine, deneysel olarak oluşturulmuş diabet etkilerinin histolojik ve biyokimyasal olarak incelenmesi

    Transforming growth factor (TGF β), nuclear factor kappa b (NF-KB), heat-shock 90β (HSP90β) and e-cadherin proteins, on the dıstrıbutıon of testicular tissue, ınvestıgatıon histologically and biochemicallly of effects experımental ınduced dıabetes

    PELİN TOROS

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Histoloji ve EmbriyolojiEge Üniversitesi

    Histoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HÜSEYİN AKTUĞ

  4. Tez No

    224782

    Süt dişi periodontal ligamenti ve pulpasında osteoprotegerin ve rankl proteinlerinin ekspresyonunun enzim immüno histokimyasal yöntemle araştırılması

    Enzyme immunohistochemical investigation of osteoprotegerin and rankl expression in peridontal ligament and pulpal tissues of human deciduous teeth

    SİBEL YILDIRIM

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    Histoloji ve EmbriyolojiSelçuk Üniversitesi

    Histoloji ve Embriyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İLHAMİ ÇELİK

  5. Tez No

    75323

    Kömür yakılan kazanda ve sobada ağır metal emisyonlarının incelenmesi

    Başlık çevirisi yok

    EMEL SAÇAKLI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1998

    Kimya Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HASANCAN OKUTAN

Geri Dön