Ölüm reseptörü ile WNT/β-katenin sinyal yolağı arasındaki ilişkinin zebra balığı modelinde araştırılması
Investigating the relationship between WNT/ β-catenin signaling and death receptor in zebrafish model organism
- Tez No: 466320
- Danışmanlar: DOÇ. DR. HATİCE GÜNEŞ ÖZHAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Genetik, Tıbbi Biyoloji, Biology, Genetics, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Wnt/β-katenin sinyali, ölüm reseptörü(nradd), zebrabalığı, apoptoz, TNFR, Wnt/β-catenin signaling, death receptor (nradd), zebrafish, apoptosis, TNFR
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Tıbbi Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 71
Özet
Wnt/β-katenin sinyal iletim yolağı, embriyonik gelişim sırasında hücre bölünmesinde, hücre kaderinin belirlenmesinde, doku homeostazisinin sürekliliğinde ve çeşitli doku ve organların rejenerasyonunda önemli rollere sahiptir. Wnt/β-katenin sinyal iletimi regülasyonu ile ilgili bu güne kadar birçok araştırma yapılmış olmasına rağmen, hala tamamiyle anlaşılmış bir yolak değildir. Bu çalışmada öncelikle, Wnt/β-katenin sinyal iletiminin yeni hedef genlerini ortaya çıkarmak için, Wnt sinyali aktive ve inhibe edilmiş zebrabalığı embriyolarından elde ettiğimiz toplam RNA'nın yeni nesil RNA dizileme (RNA seq) verisini analiz ettik. Daha sonra, bilinen Wnt/β-katenin sinyali hadef genlerin bazılarının aynı zamanda geri bildirim yoluyla düzenleme kapasitesine de sahip olması özelliğinden yararlanarak, analizimizden elde ettiğimiz aday hedef genlerin içinde yer alabilecek potansiyel yolak düzenleyicilerinden birini ortaya çıkarmayı ve moleküler düzeyde karakterize etmeyi hedefledik. Çalışmamız, Tümör Nekroz Faktörü Reseptörü (TNFR) süper ailesi üyesi olan nradd geninin ekspresyonunun artan ve azalan Wnt/β-katenin aktivitesine bağlı olarak, sırasıyla, arttığını ve azaldığını göstermektedir bu da nradd geninin bir Wnt hedef geni olduğunu ve RNAseq sonuçlarını doğrulamaktadır. Ayrıca çalışmalarımız, nradd geninin hem bir Wnt/β-katenin hedef geni hem de yolağın bir geribildirim inhibitörü olduğunu göstermiştir. Nradd geninin, Wnt/β-katenin sinyal iletimini gerek kültüre edilmiş hücrelerde gerekse zebrabalığı embriyolarında baskıladığını ve zebrabalığı embriyolarında apoptozu tetiklediğini çalışmalarımız göstermektedir. Bu sonuçlar doğrultusunda, Wnt/β-katenin sinyal iletim yolağındaki bozukluktan dolayı oluşan hastalıklarda tedavi amacı olarak kullanılabilecek yeni terapötik hedefler geliştirilmesi amaçlanmaktadır.
Özet (Çeviri)
Wnt/β-catenin signaling has significant roles in regulating a lot of cellular processes during embryonic development, adult tissue homeostasis and regeneration. There have been huge studies done about regulation of Wnt/β-catenin signaling pathway, however there are still unclear parts. In this study, firstly, we analyzed the RNAseq data from Wnt loss of function and Wnt gain of function zebrafish embryos total RNA to reveal new Wnt/β-catenin signaling target genes. Later, taking advantage of knowing that some Wnt/β-catenin signaling target genes have capacity to regulate the Wnt pathway as negative feedback regulator, we aimed to identify and characterize our candidate gene from RNAseq analysis in molecular level. Our studies, relevant to RNA seq results, show that expression of nradd gene, which belongs to tumor necrosis factor receptor (TNFR) superfamily, is down-regulated or up-regulated with decreased and increased Wnt expression, respectively. Moreover, our studies shows that nradd is not only a Wnt/β-catenin target gene, but also a negative feedback regulator of Wnt/β-catenin signaling. Nradd protein can repress the Wnt/β-catenin signaling both in cultured cell lines and zebrafish embryos and it can also induce apoptosis in zebrafish embryos. In accordance with these studies, we aimed to improve new therapeutic targets to cure diseases caused by defects of Wnt/β-catenin signaling pathway.
Benzer Tezler
- Investigation of the role of neurotrophin receptor associated death domain protein in regulation of WNT/ß-catenin signaling using the zebrafish model
Nörotrofin reseptörü ile ilişkili ölüm bölgesi proteininin WNT/ß- katenin sinyal iletiminin düzenlenmesindeki rolünün zebra balığı modelinde araştırılması
ÖZGÜN ÖZALP
Doktora
İngilizce
2022
BiyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HATİCE GÜNEŞ ÖZHAN
- Investigation of the role of neurotrophin receptor associated death domain protein in regulation of Wnt/β-catenin signaling using the embryonic and CRISPR/Cas9 knockout models of zebrafish
Nörotrofin reseptörü ile ilişkili ölüm bölgesi proteininin Wnt/ β - katenın sinyal iletiminin düzenlenmesindeki rolünün zebrabalığı embriyonik modeli ve CRISPR/Cas9 knockout modeli ile araştırılması
ÖZGE ÇARK
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
BiyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiMoleküler Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HATİCE GÜNEŞ ÖZHAN
- Investigation of the role of p75NTR homologue nradd in formation of degeneration and regeneration responses in Alzheimer's disease in zebrafish amyloid ß42 toxicity model
Alzheimer hastalığında nöronal dejenerasyon ve rejenerasyon yanıtlarının oluşumunda p75NTR homoloğu nradd'ın rolünün zebrabalığı amiloid ß42 toksisite modelinde araştırılması
DOĞAÇ İPEKGİL
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
BiyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiGenom Bilimleri ve Moleküler Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HATİCE GÜNEŞ ÖZHAN
- Beta-katenin ile apoptozis arasındaki ilişkinin sitolojik ve immünositokimyasal yöntemlerle araştırılması
Examination of interaction between beta-catenin and apoptosis by cytological and immunocytochemical methods
HANİFE GÜLER DÖNMEZ
- Kuersetin, berberin, saponin ve krisin moleküllerinin akciğer kanser hücrelerinde anti kanser etkisinin araştırılması ve etkilediği sinyal yolaklarının belirlenmesi
Investigation of anti-cancer effect of quercetin, berberine, saponin and chrysin molecules in lung cancer and determi̇nation on the signaling pathways
SERDAR IŞIK
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
BiyolojiÜsküdar ÜniversitesiMoleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BELKIS ATASEVER ARSLAN