Geri Dön

Ewing sarkoma'da yeni metastaz biyomarkırları'nın tespit edilmesi

Identification of new metastatic biomarkers in ewing sarcoma

PDF İndir

  1. Tez No: 466765
  2. Yazar: ESRA GÜZEL
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ŞÜKRÜ ÖZTÜRK
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 163

Özet

Ewing Sarkoma (EWS), intrastoplazmik glikojen içeren, blast benzeri küçük, yuvarlak hücrelerden oluşan, nöral orijinli, andiferansiye özellikte primer malign kemik tümörüdür. Çocukluk çağında kemikte görülen tümörlerde osteosarkomdan sonra ikinci sırada yer alır. Primitif Nöroektodermal Tümör'ler (PNET), malign küçük neoplazm hücrelerinden oluşmuş olup, kötü differansiye ve prognozları kötü seyreden lezyonlardır. PNET'ler morfolojik ve histolojik olarak kemiğe ait gelişen EWS'den ayırt edilememektedir. Bu iki tip tümörün metastatik özellikte olduğu bilinmektedir. MikroRNA'ların (miRNA) kanser patogenezinde önemli olduklarına dair güçlü kanıtlar vardır ve yeni bir gen regülatörü sınıfı olarak düşünülmektedir. Tanımlanan insan miRNA'larının yarısına yakınının genomun kırılgan yerlerinde bulunması, bu küçük moleküllerin kanser progresyonunda rol alabileceğini düşündürmektedir. Metastaz tanısında biyomarkırların belirlenmesi, erken tanı, yeni tedavi yöntemlerinin geliştirilmesi ve tedavi direncinin üstesinden gelinmesi konusunda hala aydınlatılması gereken konulardandır. Tez çalışması kapsamında PNET hücre hatlarından CHLA-32, CHLA-10, CHLA-9 ve EWS hücre hatlarından TC-71, TC-106, CHLA-99 hücre hatları arasında en agresif olan ve en az agresif özellikteki hücrelerin tespiti için fonksiyonel çalışmalar gerçekleştirildi. En agresif olarak TC-71, TC-106; en az agresif olarak da CHLA-99'un olduğu saptandı ve EWS'ye ait olduğu tespit edilen bu üç hücre hattında metastatik etkiden sorumlu olan miRNA'ların tespiti için RNA dizilemesi yapıldı. MiRNA dizilemesi (MirSeq) sonucunda anlamlı ifade değişimine sahip olan miRNA'lardan; mir-129-2-3p, mir-214-3p ve önemli bir tümör süpresör miRNA olan miR-145 için, EWS hücre hatlarında RT-PZR kullanılarak doğrulama çalışması yapıldı. İfade değişimleri doğrulanan ve aday metastaz biyomarkırları olarak tespit edilen mir- 145 ve mir-129-2-3p için EWS hücre hatlarında fonksiyonel çalışmalar yapıldı. Bu şekilde EWS hücrelerinin metastatik potansiyellerine katkıda bulunan miRNA'ların tespiti gerçekleştirilerek, mir-129-2-3p ve mir-145'in EWS'de metastaz kazanımlarındaki rollerinin aydınlatılmasına katkı sağlandı.

Özet (Çeviri)

Ewing sarcoma (EWS) is a primary malignant bone tumor comprised of blast-like, small, round undifferentaited cells with neural origin. It is the second most common childhood bone tumor after osteosarcoma. Primitive Neuroectodermal Tumors (PNET) are comprised of malignant small neoplasm cells and are poorly differentiated lesions with poor prognosis. PNETs cannot be morphologically and histologically distinguishable from EWS of the bone. These two types of tumors are known to be metastatic. There are strong evidences showing that microRNAs (miRNAs) are important in the cancer pathogenesis and they are considered as a new class of gene regulators. Localization of almost half of the identifined human miRNAs in the fragile sites of the genome suggests that these small molecules might be involved in cancer progression. Identification of diagnostic biomarkers for metastasis, development of early diagnostic tools and novel treatment modalities and overcoming the therapeutic resistance are amongst the important subjects to be resolved. Functional studies were performed for the identification of the most aggressive and the least aggressive cell lines among CHLA-32, CHLA-10, CHLA-9 PNET cell lines and TC-71, TC-106, CHLA-99 EWS cell lines. TC-71 and TC-106 were found to be the most aggressive cell lines and CHLA-99 was found to be the least aggressive cell line. A small RNA sequencing (miRSeq) study was performed to detect miRNAs responsible for metastatic effects in these three cell lines. RT-PCR was used to validate the differential expression of miR-670-3p, mir-129-2-3p, mir-214-3p, which are demonstrated to be deregulated in miRSeq analysis and of miR- 145, an important tumor suppressor miRNA, in EWS cell lines. The changes in the metastatic potential of miR-145 and miR-129-2-3p, which are validated to be differentially expressed and identified as putative metastatic markers in EWS cell lines. In this way, by identification of miRNAs contributing to the metastatic potential of EWS cells we helped elucidation of the roles of these miRNAs in metastatis of EWS.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    721563

    Primer kemik sarkomlarında hasta sağkalımını etkileyen faktörlerin belirlenmesi

    Determination of factors affecting patient survival in primary bone sarcomas

    MEHMET DENİZ KESİMER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    OnkolojiMarmara Üniversitesi

    Ortopedi ve Travmatoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BÜLENT EROL

  2. Tez No

    124363

    Metoksi izobütil izonitrilin (MIBI) multipl miyelom ve lösemi dışı çocukluk çağı kanserlerinde kemik iliği tutulumunun belirlenmesindeki yeri

    Başlık çevirisi yok

    KEZBAN BERBEROĞLU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2003

    Radyoloji ve Nükleer Tıpİstanbul Üniversitesi

    Nükleer Tıp Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. SEHER NİLGÜN ÜNAL

  3. Tez No

    839841

    Yuvarlak hücreli sarkomlarda BCOR antikorunun, 2020 WHO yeni sınıflandırması ışığında ayırıcı tanıya katkısı ve histopatolojik parametrelerle yeniden değerlendirilmesi

    The contribution of BCOR antibody to differential diagnosis in round cell sarcomas in the light of the 2020 WHO new classification and re-assessment with histopathological parameters

    HÜLYA BİLGİ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    PatolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. CEM ÇOMUNOĞLU

  4. Tez No

    544698

    Yuvarlak hücreli sarkomlarda güncel klinikopatolojik sınıflama ve prognostik önemi

    Contemporary clinicopathological classificationof round cell sarcoma and its prognostic significance

    GAMZE GÖKTÜRK ÖZCAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Patolojiİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa

    Patoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NİL ÇOMUNOĞLU

  5. Tez No

    907133

    Negatif sinyal ve yalancı pozitif üreme sinyali veren otomatize kan kültür şişelerinde moleküler yöntemler ile bakteriyemi ve fungemi etkeni mikroorganizma varlığının araştırılması

    Investigation of the presence of bacteremia and fungemia- related microorganisms with molecular methods in automated blood cultures with false positive and negative growth signals

    MERVE ERTÜRK MELEZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    MikrobiyolojiErciyes Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUSTAFA ALTAY ATALAY

Geri Dön